5-ethynyl-2’-fluoro-2’-deoxyuridine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-ethynyl-2’-fluoro-2’-deoxyuridine
• 英文别名: 5-ethynyl-1-[(2R,3R,4R,5R)-3-fluoro-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₁₁H₁₁FN₂O₅
• 分子量: 270.217
• InChiKey: YEEGMPUOCRQFRV-FDDDBJFASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  99.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-ethynyl-2’-fluoro-2’-deoxyuridine 在 磷酸三甲酯 、 1,8-双二甲氨基萘 、 三氯氧磷 、 三正丁胺 、 三丁基焦磷酸铵 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.83h， 以41%的产率得到5-ethynyl-2'-fluoro-2'-deoxyuridine-5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  [EN] DNA DISPLAY OF FOLDED RNA LIBRARIES ENABLING RNA-SELEX WITHOUT REVERSE TRANSCRIPTION
  [FR] AFFICHAGE D'ADN À PARTIR DE BANQUES D'ARN PLIÉES ACTIVANT L'ARN-SELEX SANS TRANSCRIPTION INVERSE

  摘要：

  本发明涉及一种选择与目标分子结合的RNA分子的方法和用于执行该方法的试剂盒。该方法包括：提供一个寡核苷酸复合物池，每个复合物包括一个双链DNA分子和一个RNA分子，其中双链DNA分子包括至少部分与RNA分子的第一区域配对的第一条DNA链，因此RNA分子的第二区域可以自由地形成二级结构；将池暴露于目标分子并允许RNA的第二区域与目标分子结合；从池中选择一个或多个含有RNA分子的复合物，其中RNA分子的第二区域与目标分子结合。

  公开号：

  WO2018152470A1
• 作为产物：
  描述：

  2'-氟-2'-脱氧尿苷 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 N-碘代丁二酰亚胺 、 copper(l) iodide 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 生成 5-ethynyl-2’-fluoro-2’-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  [EN] DNA DISPLAY OF FOLDED RNA LIBRARIES ENABLING RNA-SELEX WITHOUT REVERSE TRANSCRIPTION
  [FR] AFFICHAGE D'ADN À PARTIR DE BANQUES D'ARN PLIÉES ACTIVANT L'ARN-SELEX SANS TRANSCRIPTION INVERSE

  摘要：

  本发明涉及一种选择与目标分子结合的RNA分子的方法和用于执行该方法的试剂盒。该方法包括：提供一个寡核苷酸复合物池，每个复合物包括一个双链DNA分子和一个RNA分子，其中双链DNA分子包括至少部分与RNA分子的第一区域配对的第一条DNA链，因此RNA分子的第二区域可以自由地形成二级结构；将池暴露于目标分子并允许RNA的第二区域与目标分子结合；从池中选择一个或多个含有RNA分子的复合物，其中RNA分子的第二区域与目标分子结合。

  公开号：

  WO2018152470A1

文献信息

• Anti-viral compounds
  申请人：THE WELLCOME FOUNDATION LIMITED

  公开号：EP0453247A2

  公开（公告）日：1991-10-23

  Fluoro-substituted pyrimidine nucleosides are disclosed which are useful in the treatment or prophylaxis of herpes virus infections.

  本研究公开了可用于治疗或预防疱疹病毒感染的氟代嘧啶核苷。
• JPH05331184A
  申请人：——

  公开号：JPH05331184A

  公开（公告）日：1993-12-14
• [EN] DNA DISPLAY OF FOLDED RNA LIBRARIES ENABLING RNA-SELEX WITHOUT REVERSE TRANSCRIPTION<br/>[FR] AFFICHAGE D'ADN À PARTIR DE BANQUES D'ARN PLIÉES ACTIVANT L'ARN-SELEX SANS TRANSCRIPTION INVERSE
  申请人：UNIV BRANDEIS

  公开号：WO2018152470A1

  公开（公告）日：2018-08-23

  The present invention is directed to the method for selecting an RNA molecule that binds to a target molecule and a kit for carrying out the method. This method includes: providing a pool of oligonucleotide complexes that each comprise a ds-DNA molecule and an RNA molecule, the ds-DNA molecule comprising a first DNA strand at least partially annealed to a first region of the RNA molecule, whereby a second region of the RNA molecule is free to adopt a secondary structure; exposing the pool to a target molecule and allowing the second region of the RNA to bind the target molecule; and selecting from the pool one or more oligonucleotide complexes comprising an RNA molecule having the second region bound to the target molecule.

  本发明涉及一种选择与目标分子结合的RNA分子的方法和用于执行该方法的试剂盒。该方法包括：提供一个寡核苷酸复合物池，每个复合物包括一个双链DNA分子和一个RNA分子，其中双链DNA分子包括至少部分与RNA分子的第一区域配对的第一条DNA链，因此RNA分子的第二区域可以自由地形成二级结构；将池暴露于目标分子并允许RNA的第二区域与目标分子结合；从池中选择一个或多个含有RNA分子的复合物，其中RNA分子的第二区域与目标分子结合。