nitrocobalamin | 20623-13-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 四吡咯及其衍生物
• 英文名称: nitrocobalamin
• 英文别名: nitritocobalamine；cobalt(3+);[(2R,3S,4R,5S)-5-(5,6-dimethylbenzimidazol-1-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] [(2R)-1-[3-[(1R,2R,3R,7S,12S,13S,17S,18S,19R)-2,13,18-tris(2-amino-2-oxoethyl)-7,12,17-tris(3-amino-3-oxopropyl)-3,5,8,8,13,15,18,19-octamethyl-2,7,12,17-tetrahydro-1H-corrin-21-id-3-yl]propanoylamino]propan-2-yl] phosphate;nitrite
• CAS: 20623-13-6
• 化学式: C₆₂H₈₈CoN₁₄O₁₆P
• 分子量: 1375.43
• InChiKey: UUWYBLVKLIHDAU-WZHZPDAFSA-K

物化性质

• 溶解度：
  甲醇（微溶）、水（微溶）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.56
• 重原子数：
  94
• 可旋转键数：
  26
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.63
• 拓扑面积：
  504
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  谷胱甘肽 、 nitrocobalamin 在 sodium acetate 、 三氟甲磺酸钠 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 0.17h， 生成 glutathionylcobalamin
  参考文献：
  名称：

  硝基钴胺与谷胱甘肽反应的机理研究：形成水钴胺中间体的动力学证据

  摘要：

  必需但也是有毒的气体信号分子一氧化氮被还原的维生素 B12 复合物 cob(II)alamin 清除。生成的复合物硝基钴胺素 (NO--Cbl(III)) 在氧气存在下被迅速氧化为硝基钴胺素 (NO2Cbl)；然而，硝基钴胺素本身在生物系统中不太可能稳定。报道了关于 NO2Cbl 与重要的细胞内抗氧化剂谷胱甘肽 (GSH) 之间反应的动力学研究。在这项研究中，提出了一种反应途径，其中 NO2Cbl 的 β 轴配体首先被水取代，得到水钴胺素 (H2OCbl+)，然后与 GSH 进一步反应形成谷胱甘肽钴胺素 (GSCbl)。四个相关速率常数 k1、k-1、k2 和 k-2 的独立测量支持所提出的机制。

  DOI：

  10.1002/ejic.201300254
• 作为产物：
  描述：

  nitrosylcobalamin 在 air 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 nitrocobalamin
  参考文献：
  名称：

  硝基氧芯（III）阿拉明：合成和X射线结构表征。

  摘要：

  DOI：

  10.1002/anie.200701131

文献信息

• Kinetics and Mechanism of the Reversible Binding of Nitric Oxide to Reduced Cobalamin B_12r (Cob(II)alamin)
  作者：Maria Wolak、Achim Zahl、Thorsten Schneppensieper、Grazyna Stochel、Rudi van Eldik

  DOI：10.1021/ja010530a

  日期：2001.10.1

  reduced form of aquacobalamin binds nitric oxide very effectively to yield a nitrosyl adduct, Cbl(II)-NO. UV-vis, (1)H-, (31)P-, and (15)N NMR data suggest that the reaction product under physiological conditions is a six-coordinate, "base-on" form of the vitamin with a weakly bound alpha-dimethylbenzimidazole base and a bent nitrosyl coordinated to cobalt at the beta-site of the corrin ring. The nitrosyl

  水钴胺素的还原形式非常有效地结合一氧化氮以产生亚硝酰基加合物 Cbl(II)-NO。UV-vis、(1)H-、(31)P-和 (15)N NMR 数据表明，生理条件下的反应产物是六配位的“基础”形式的维生素，具有弱结合α-二甲基苯并咪唑碱和弯曲的亚硝酰基在 corrin 环的 β 位点与钴配位。亚硝酰基加合物可以正式描述为 Cbl(III)-NO-。分别通过激光闪光光解和停流技术研究了结合和解离反应的动力学。正向和反向反应的活化参数 DeltaH、DeltaS 和 DeltaV 是根据温度和压力对这些反应动力学的影响估算的。对于 Cbl(II) 与 NO 的“on”反应，较小的正 DeltaS 和 DeltaV 值表明在 Co(II) 中心存在解离交换 (I(d)) 替代机制。详细的激光闪光光解和 (17)O NMR 研究为激光闪光实验中水结合中间体的形成提供了证据，并强烈支持所提出的 I(d)
• A simple, convenient method to synthesize cobalamins: synthesis of homocysteinylcobalamin, N-acetylcysteinylcobalamin, 2-N-acetylamino-2-carbomethoxyethanethiolatocobalamin, sulfitocobalamin and nitrocobalamin
  作者：Edward Suarez-Moreira、Luciana Hannibal、Clyde A. Smith、Roberto A. Chavez、Donald W. Jacobsen、Nicola E. Brasch

  DOI：10.1039/b610158e

  日期：——

  Glutathionylcobalamin, nitrocobalamin and sulfitocobalamin are important cobalamin metabolites isolable from human tissues. Herein we demonstrate that a procedure used to synthesize and isolate γ-glutamylcysteinylcobalamin and glutathionylcobalamin in aqueous solution in high yield and purity can be used to synthesize other novel, biologically relevant thiolatocobalamins, including D,L-homocysteinylcobalamin, N-acetyl-L-cysteinylcobalamin (Na+ salt) and 2-N-acetylamino-2-carbomethoxy-L-ethanethiolatocobalamin, as well as other non-alkylcobalamins, such as sulfitocobalamin (Na+ salt) and nitrocobalamin. This uncomplicated, general procedure will assist researchers in identifying unknown cobalamin metabolites isolated from biological samples, and researchers interested in studying the uptake and intracellular cobalamin processing mechanisms utilizing non-alkylcobalamin derivatives that are not yet commercially available. The X-ray structure and XAS spectrum of N-acetyl-L-cysteinylcobalamin are also presented.

  这段文字的中文翻译： 谷胱甘肽钴胺素、亚硝酸钴胺素和亚硫酸钴胺素是可从人体组织中分离出的重要钴胺素代谢物。在此我们证明，一种用于在水溶液中高产率和高纯度合成和分离γ-谷氨酰半胱氨酰钴胺素和谷胱甘肽钴胺素的方法，可以用来合成其他新型的、具有生物相关性的硫醇钴胺素，包括D,L-同型半胱氨酸钴胺素、N-乙酰-L-半胱氨酸钴胺素（钠盐）和2-N-乙酰氨基-2-羧甲基-L-乙硫醇钴胺素，以及其他非烷基钴胺素，如亚硫酸钴胺素（钠盐）和亚硝酸钴胺素。这种简单的通用方法将帮助研究人员识别从生物样品中分离出的未知钴胺素代谢物，以及帮助那些对研究尚未商业化的非烷基钴胺素衍生物的摄取和细胞内钴胺素处理机制感兴趣的研究人员。文中还介绍了N-乙酰-L-半胱氨酸钴胺素的X射线结构和XAS光谱。
• Pulse radiolysis studies of the reactions of nitrogen dioxide with the vitamin B12 complexes cob(II)alamin and nitrocobalamin
  作者：Rohan S. Dassanayake、Diane E. Cabelli、Nicola E. Brasch

  DOI：10.1016/j.jinorgbio.2014.09.014

  日期：2015.1

  are few studies on the reactivity of NO2, including the reactions between NO2 and transition metal complexes. We report kinetic studies on the reactions of NO2 with two forms of vitamin B12 — cob(II)alamin and nitrocobalamin. UV–visible spectroscopy and HPLC analysis of the product solution show that NO2 cleanly oxidizes the metal center of cob(II)alamin to form nitrocobalamin, with a second-order rate

  尽管现在已被认为是修饰蛋白质，DNA和脂质结构的生物系统中重要的反应性氮物种，但对NO 2反应性的研究很少，包括NO 2与过渡金属络合物之间的反应。我们报告了关于NO 2与两种形式的维生素B 12的反应的动力学研究-钴（II）阿拉明和硝基钴胺。产物溶液的紫外可见光谱和HPLC分析表明，NO 2干净地氧化了钴（II​​）阿拉明的金属中心，形成硝基钴胺，其二级速率常数为（3.5±0.3）×10 8  M − 1  s − 1（pH 7.0和9.0，室温，I  = 0.20 M）。反应的化学计量为1：1。当硝基钴胺素暴露于2.0 mol当量时，通过紫外可见光谱和产品溶液的HPLC分析未检测到任何反应。NO 2。
• Nitrite Impurities Are Responsible for the Reaction Observed between Vitamin B₁₂ and Nitric Oxide in Acidic Aqueous Solution
  作者：Federico Roncaroli、Tatyana E. Shubina、Timothy Clark、Rudi van Eldik

  DOI：10.1021/ic061151r

  日期：2006.9.1

  The reaction between aquacobalamin, Cbl(H2O), and NO was studied at low pH. As previously reported, the final product of the reaction is the same as that obtained in the reaction of NO and reduced Cbl(H2O), viz. Cbl(NO-). Nevertheless, this reductive nitrosylation is preceded by a faster reaction (accompanied by small absorbance changes) that depends on the HNO2 concentration but not on the NO concentration

  在低pH条件下研究了水钴胺，Cbl（H2O）和NO之间的反应。如先前报道的，反应的最终产物与在NO和还原的Cbl（H2O）的反应中获得的产物相同，即。Cbl（NO-）。然而，这种还原性亚硝基化反应之前发生的反应更快（伴随较小的吸光度变化），这取决于HNO2的浓度而不取决于NO的浓度。动力学和紫外可见光谱数据表明，在该反应过程中生成了Cbl（NO2-）。光谱数据表明，在pH 1时，反型为NO2-配体的二甲基苯并咪唑基被质子化并部分去螯合，从而诱导与NO的反应。进行DFT计算以比较NO和NO2-结合钴胺素的能力及其对二甲基苯并咪唑基团稳定性的影响。还原性亚硝基化反应对HNO2浓度呈二次依赖性，而对NO浓度呈逆相关性。它也强烈依赖于pH，并且在pH> 4时不再观察到。基于对一系列Co（III）卟啉的早期研究，提出了一种可以定量解释HNO2和NO依赖性的机理。还原性亚硝基化反应实际上主要由反反应（
• Marques, Helder M.; Knapton, Leanne, Journal of the Chemical Society, Dalton Transactions, 1997, # 20, p. 3827 - 3833
  作者：Marques, Helder M.、Knapton, Leanne

  DOI：——

  日期：——