N-Fmoc-O-allylserine | 704910-17-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: N-Fmoc-O-allylserine
• 英文别名: (S)-2-{[(9H-fluoren-9-yl)methoxy]carbonyl}amino-3-(prop-2-enoxy)propanoic acid；Fmoc-Ser(Allyl)；Fmoc-Ser(allyl)-OH；Fmoc-L-Ser(Alll)-OH；N-Fmoc-O-allyl-L-serine；(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-prop-2-enoxypropanoic acid
• CAS: 704910-17-8
• 化学式: C₂₁H₂₁NO₅
• 分子量: 367.401
• InChiKey: BFEBKKIRUYSHKY-IBGZPJMESA-N

物化性质

• 沸点：
  590.2±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.250±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  84.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  2-8°C

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-Fmoc-O-allylserine 在 喹哪啶酸 、 cyclopentadienylruthenium(II) trisacetonitrile hexafluorophosphate 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 Fmoc-Ser-Phe-OtBu
  参考文献：
  名称：

  CpRuIIPF6 /喹啉酸催化的化学选择性烯丙基醚裂解。一种简单实用的羟基脱保护方法。

  摘要：

  阳离子CpRu（II）配合物与奎宁酸组合显示出高反应活性和化学选择性，可催化脱保护作为烯丙基醚的羟基。该催化剂在醇溶剂中操作，不需要任何其他亲核试剂，满足了操作简便，安全和环境友好的实际要求。该脱保护策略对包括肽和核苷在内的多种多功能分子的广泛应用，可能在保护基化学中提供新的机会。[结构：见文字]

  DOI：

  10.1021/ol0493397
• 作为产物：
  描述：

  O-烯丙基-N-(叔丁氧羰基)-L-丝氨酸 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.5h， 生成 N-Fmoc-O-allylserine
  参考文献：
  名称：

  Towards the sequence-specific multivalent molecular recognition of cyclodextrin oligomers

  摘要：

  特异性序列多价分子识别在生物过程中发挥重要作用。此外，近年来，序列特异性识别基序已被用于各种人工系统中，例如，模拟生物过程或构建具有高度特异性识别结构域的新材料。在本文中，我们介绍了基于环糊精（CD）的链和修饰有客体分子的互补和非互补链的制备，并通过等温滴定量热法（ITC）研究它们之间的络合行为。作为互补结合基序，选择了n-丁基和α-CD以及脱氢脂肪烷和β-CD。发现通过使用宿主-客体化学可以实现特异性序列分子识别，但识别基序以及连接必须非常谨慎选择。在三价系统中，必须包含一个脱氢脂肪烷基团以诱导首选形成1:1加合物。由于n-丁基和α-CD之间的相互作用过弱，这些系统具有负螯合协同性，优先形成开放的加合物。一旦存在两个脱氢脂肪烷基团，互补系统具有正螯合协同性，双链结构优于开放的加合物。在这个系统中，n-丁基基团对α-CD和β-CD提供的区分不足，没有观察到序列特异性。通过三个脱氢脂肪烷基团的组合，可以产生序列特异性。仅与互补CD序列一起形成双链结构，而与非互补链形成高摩尔配位聚集体。

  DOI：

  10.3762/bjoc.10.253

文献信息

• Alpha-Ketoamide Inhibitors Of Cysteine Proteases
  申请人：Phelix Therapeutics

  公开号：US20190085024A1

  公开（公告）日：2019-03-21

  The disclosure provides compounds comprising a α-ketoamide linkage that is terminated on each end by an amino acid, such as compounds of Formula (I), wherein RA-RC are defined herein. Also provided are compositions containing these compounds and methods of inhibiting calpain activity, treating a calpain-mediated disorder, inhibiting cathepsin-B, cathepsin-L, cathepsin-S, or cathepsin-L activity, and methods of treating a cathepsin-B, cathepsin-L, cathepsin-S, or cathepsin-L mediated disorder using these compounds and compositions.

  该披露提供了包含α-酮酰胺键的化合物，该键在每端由氨基酸终止，例如式(I)中的化合物，其中RA-RC在此处定义。还提供了含有这些化合物的组合物以及抑制钙蛋白酶活性、治疗钙蛋白酶介导的疾病、抑制卡托普西-B、卡托普西-L、卡托普西-S或卡托普西-L活性的方法，以及使用这些化合物和组合物治疗卡托普西-B、卡托普西-L、卡托普西-S或卡托普西-L介导的疾病的方法。
• Macrocyclic BACE1 inhibitors with hydrophobic cross-linked structures: Optimization of ring size and ring structure
  作者：Takuya Otani、Yasunao Hattori、Kenichi Akaji、Kazuya Kobayashi

  DOI：10.1016/j.bmc.2021.116517

  日期：2021.12

  Based on the X-ray crystallography of recombinant BACE1 and a hydroxyethylamine-type peptidic inhibitor, we introduced a cross-linked structure between the P1 and P3 side chains of the inhibitor to enhance its inhibitory activity. The P1 and P3 fragments bearing terminal alkenes were synthesized, and a ring-closing metathesis of these alkenes was used to construct the cross-linked structure. Evaluation

  基于重组 BACE1 和羟乙胺型肽抑制剂的 X 射线晶体学，我们在抑制剂的 P1 和 P3 侧链之间引入了交联结构，以增强其抑制活性。合成了带有末端烯烃的P1和P3片段，并使用这些烯烃的闭环复分解来构建交联结构。使用具有不同侧链长度的 P1 和 P3 片段评估环大小表明，13 元环是最佳的，尽管它们的活性与母体化合物相比有所降低。此外，发现最佳环结构是在 P3 β 位具有二甲基支链取代基的大环，其活性比未取代的大环高约 100 倍。此外，
• Design of α-<i>S</i>-Neoglycopeptides Derived from MUC1 with a Flexible and Solvent-Exposed Sugar Moiety
  作者：Víctor Rojas-Ocáriz、Ismael Compañón、Carlos Aydillo、Jorge Castro-Loṕez、Jesús Jiménez-Barbero、Ramón Hurtado-Guerrero、Alberto Avenoza、María M. Zurbano、Jesús M. Peregrina、Jesús H. Busto、Francisco Corzana

  DOI：10.1021/acs.joc.6b00833

  日期：2016.7.15

  linker between the carbohydrate (GalNAc) and the peptide backbone. The main conformations of these molecules in solution have been evaluated by combining NMR experiments and molecular dynamics simulations. The linker plays a key role in the modulation of the conformation of these compounds at different levels, blocking a direct contact between the sugar moiety and the backbone, promoting a helix-like conformation

  使用基于MUC1糖肽的疫苗是治疗癌症的有前途的方法。我们在本文中提出了几种并入MUC1序列的磺胺类Tn抗原，它们在碳水化合物（GalNAc）和肽主链之间具有可变的接头。这些分子在溶液中的主要构象已经通过结合NMR实验和分子动力学模拟进行了评估。接头在调节这些化合物在不同水平上的构象，阻止糖部分与骨架之间的直接接触，促进糖基化残基的螺旋状构象并促进糖单元的正确呈递中起关键作用。用于分子识别事件。这些新化合物作为MUC1抗原模拟物的可行性已通过与抗MUC1单克隆抗体复合的这些非天然衍生物之一的X射线衍射结构进行了验证。这些特征以及潜在的缺乏免疫抑制的特性使得这些非天然糖肽成为有希望的候选者，用于设计针对癌症的替代性治疗疫苗。
• In Search of the Optimal Macrocyclization Site for Neurotensin
  作者：Marc Sousbie、Élie Besserer-Offroy、Rebecca L. Brouillette、Jean-Michel Longpré、Richard Leduc、Philippe Sarret、Éric Marsault

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.7b00500

  日期：2018.3.8

  following activation of its cognate GPCRs. In this study, we describe a systematic exploration, using structure-based design, of conformationally constraining neurotensin (8–13) with the help of macrocyclization and the resulting impacts on binding affinity, signaling, and proteolytic stability. This exploratory study led to a macrocyclic scaffold with submicromolar binding affinity, agonist activity

  激活其相关的GPCR后，神经降压素发挥有效的镇痛作用。在这项研究中，我们描述了基于结构设计的系统探索，借助大环化对构象约束神经降压素（8-13）及其对结合亲和力，信号传导和蛋白水解稳定性的影响。这项探索性研究导致了具有亚微摩尔结合亲和力，激动剂活性并大大改善了血浆稳定性的大环支架。
• Drug Design Inspired by Nature: Crystallographic Detection of an Auto‐Tailored Protease Inhibitor Template
  作者：Flavio M. Gall、Deborah Hohl、David Frasson、Tobias Wermelinger、Peer R. E. Mittl、Martin Sievers、Rainer Riedl

  DOI：10.1002/anie.201812348

  日期：2019.3.18

  from the endogenous tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMPs). The incorporation of non‐proteinogenic amino acids in combination with a cyclization strategy proved to be key for the de novo design of TIMP peptidomimetics. The optimized cyclic peptide 4 (ZHAWOC7726) is membrane permeable with an IC50 of 21 nm for MMP‐13 and an attractive selectivity profile with respect to a polypharmacology approach

  从头开始发现药物仍然是寻找治疗相关靶蛋白的有效和选择性调节剂的挑战。在这里，我们揭示了X射线晶体学法意外发现的肽配体1，它是由治疗靶点MMP-13通过部分自降解和随后基于结构的优化自动构建为高效的选择性β-片层的拟肽抑制剂，衍生自金属蛋白酶的内源性组织抑制剂。事实证明，结合非蛋白原性氨基酸和环化策略是TIMP拟肽模拟设计的关键。优化的环肽4（ZHAWOC7726）具有21 n m IC 50的膜渗透性MMP-13的选择性和相对于多药理学方法的诱人的选择性，包​​括抗癌靶标MMP-2（IC 50：170 n m）和MMP-9（IC 50：140 n m）。