Bay 41-4109 | 298708-81-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: Bay 41-4109
• 英文别名: 5-Pyrimidinecarboxylic acid, 4-(2-chloro-4-fluorophenyl)-2-(3,5-difluoro-2-pyridinyl)-1,4-dihydro-6-methyl-, methyl ester, (4R)-；methyl (4R)-4-(2-chloro-4-fluorophenyl)-2-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-6-methyl-1,4-dihydropyrimidine-5-carboxylate
• CAS: 298708-81-3
• 化学式: C₁₈H₁₃ClF₃N₃O₂
• 分子量: 395.768
• InChiKey: FVNJBPMQWSIGJK-HNNXBMFYSA-N

物化性质

• 沸点：
  475.3±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.46±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  DMSO：100 mg/mL (252.68 mM)；水：< 0.1 mg/mL（不溶）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  63.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 储存条件：
  2-8℃

制备方法与用途

生物活性

BAY 41-4109 是一种有效的人乙型肝炎病毒 (HBV) 抑制剂，其 IC50 值为 53 nM。

靶点

IC50 & Target: 53 nM (HBV)

体外研究

BAY 41-4109 能够加速并引导衣壳组装 (in vitro)。它稳定预形成的衣壳，比例可达每两个二聚体一个抑制分子。BAY 41-4109 在 HepG2.2.15 细胞中以 IC50 值为 32.6 nM 抑制 HBV DNA 释放，并以 132 nM 的 IC50 值抑制细胞质中的 HBcAg 水平。HBV DNA 和 HBcAg 的抑制作用呈剂量依赖性，表明抗-HBV 机制与 HBcAg 抑制速率相关。

体内研究

BAY 41-4109 可以剂量依赖地减少肝脏和血浆中的病毒 DNA，其疗效与 3TC 相当。它还可以降低乙型肝炎病毒核心抗原 (HBcAg) 在 HBV 转基因小鼠肝脏中的水平。在小鼠中的药代动力学研究显示快速吸收、生物利用度为 30%，并表现出剂量比例的血浆浓度，大约 60% 的浓度存在于大鼠和狗中。BAY41-4109 通过靶向病毒衣壳抑制病毒生产 (in vivo)。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Bay 41-4109 在 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氯化碳 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 (S)-4-[(R)-6-(2-chloro-4-fluoro-phenyl)-2-(3,5-difluoro-pyridin-2-yl)-5-methoxycarbonyl-3,6-dihydro-pyrimidin-4-ylmethyl]-morpholine-3-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  Discovery and Pre-Clinical Characterization of Third-Generation 4-H Heteroaryldihydropyrimidine (HAP) Analogues as Hepatitis B Virus (HBV) Capsid Inhibitors

  摘要：

  Described herein are the discovery and structure activity relationship (SAR) studies of the third-generation 4-H heteroaryldihydropyrimidines (4-H HAPs) featuring the introduction of a C6 carboxyl group as novel HBV capsid inhibitors. This new series of 4-H HAPs showed improved anti-HBV activity and better drug-like properties compared to the first- and second-generation 4-H HAPs. X-ray crystallographic study of.analogue 12 (HAP_iR01) with Cp149 Y132A mutant hexamer clearly elucidated the role of C6 carboxyl group played for the increased binding affinity, which formed strong hydrogen' onding interactions with capsid protein and coordinated waters. The representative analogue 10 (HAP_R10) was extensively characterized in vitro (ADMET) and in vivo (mouse PK and PD) and subsequently selected for further devehipffientas oral anti-HBV infection agent.

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.7b00083
• 作为产物：
  描述：

  海湾41-4109外消旋 在 Chiralpak AS-H 作用下， 以 乙醇 、 正己烷 为溶剂， 生成 Bay 41-4109 、 methyl 4-(2-chloro-4-fluorophenyl)-2-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-6-methyl-1,4-dihydropyrimidine-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  [EN] HETEROARYLDIHYDROPYRIMIDINE DERIVATIVES AND METHODS OF TREATING HEPATITIS B INFECTIONS
  [FR] DÉRIVÉS D'HÉTÉROARYLDIHYDROPYRIMIDINE ET PROCÉDÉS DE TRAITEMENT D'INFECTIONS PAR LE VIRUS DE L'HÉPATITE B

  摘要：

  本文提供了一些对需要治疗HBV感染的受试者有用的化合物，以及它们的药物组成和抑制、抑制或预防受试者HBV感染的方法。

  公开号：

  WO2021121363A1

文献信息

• DIHYDROPYRIMIDO LOOP DERIVATIVE AS HBV INHIBITOR
  申请人：MEDSHINE DISCOVERY INC.

  公开号：US20170197986A1

  公开（公告）日：2017-07-13

  Disclosed is a dihydropyrimido fused ring derivative as a HBV inhibitor, and in particular relates to a compound shown as formula (I) or a pharmaceutically acceptable salt thereof.

  本发明公开了一种二氢嘧啶并环衍生物作为HBV抑制剂，特别涉及一种如下式（I）所示的化合物或其药用可接受的盐。
• Dihydropyrimidines
  申请人：Stoltefuss Jurgen

  公开号：US20070117812A1

  公开（公告）日：2007-05-24

  The invention relates to compounds of the formulae

  该发明涉及公式的化合物。
• COMBINATIONS AND METHODS COMPRISING A CAPSID ASSEMBLY INHIBITOR
  申请人：Novira Therapeutics Inc.

  公开号：EP3848026A1

  公开（公告）日：2021-07-14

  The present disclosure is directed to capsid assembly inhibitor compositions and methods for use in the treatment of hepatitis B virus infection.

  本公开涉及用于治疗乙型肝炎病毒感染的囊膜组装抑制剂组合物和方法。
• Crystal form, preparation method and intermediate of dihydropyrido ring compound
  申请人：QILU PHARMACEUTICAL CO., LTD.

  公开号：US10253030B2

  公开（公告）日：2019-04-09

  Disclosed in the present disclosure are a crystal form of a dihydropyrido ring compound, and preparation method and intermediate thereof.

  本公开披露了一种二氢吡啶环化合物的晶型及其制备方法和中间体。
• Combinations and methods comprising a capsid assembly inhibitor
  申请人：Novira Therapeutics, Inc.

  公开号：US10441589B2

  公开（公告）日：2019-10-15

  The present disclosure is directed to capsid assembly inhibitor compositions and methods for use in the treatment of hepatitis B virus infection.

  本公开涉及用于治疗乙型肝炎病毒感染的囊膜组装抑制剂组合物和方法。