5-azidomethyl-2-methylpyrimidine-4-ylamine | 63423-50-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 5-azidomethyl-2-methylpyrimidine-4-ylamine
• 英文别名: 5-azidomethyl-2-methylpyrimidin-4-amine；2-methyl-4-amino-5-azidomethylpyrimidine；5‐(azidomethyl)‐2‐methylpyrimidin‐4‐amine；5-(Azidomethyl)-2-Methylpyrimidin-4-Amine；5-(azidomethyl)-2-methylpyrimidin-4-amine
• CAS: 63423-50-7
• 化学式: C₆H₈N₆
• 分子量: 164.17
• InChiKey: HRZOZFYDZBEQQQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  66.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-azidomethyl-2-methylpyrimidine-4-ylamine 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 以100 %的产率得到4-氨基-2-甲基-5-(氨甲基)嘧啶
  参考文献：
  名称：

  用于抑制二磷酸硫胺素 (ThDP) 依赖性酶的硫胺素类似物的设计：通过支架跳跃和 C2 功能化进行系统研究

  摘要：

  二磷酸硫胺素 (ThDP) 是维生素 B 1的生物活性形式，是所有生物体细胞代谢过程所需的必需辅酶。尽管各个酶在底物偏好和生化反应方面存在显着差异，但 ThDP 依赖性酶都需要 ThDP 作为催化活性的辅酶。通过化学抑制研究这些酶的作用的一种流行方法是使用硫胺素/ThDP 类似物，其通常具有中性芳香环代替 ThDP 带正电的噻唑鎓环。虽然 ThDP 类似物有助于理解酶家族的结构和机制方面的工作，但有关配体设计策略的至少两个关键问题仍未解决：1）哪个是最好的芳环？2）我们如何才能实现对特定 ThDP 依赖性酶的选择性？在这项工作中，我们合成了这些类似物的衍生物，涵盖了过去十年中使用的所有中心芳环，并对所有化合物作为几种 ThDP 依赖性酶的抑制剂进行了头对头比较。因此，我们建立了中心环的性质与这些 ThDP 竞争性酶抑制剂的抑制谱之间的关系。我们还证明，在中心环上引入 C2 取代基来探索独特

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2023.106602
• 作为产物：
  描述：

  盐酸硫胺 在 sodium azide 、 sodium sulfite 作用下， 以 水 为溶剂， 以30 %的产率得到5-azidomethyl-2-methylpyrimidine-4-ylamine
  参考文献：
  名称：

  Furan-based inhibitors of pyruvate dehydrogenase: SAR study, biochemical evaluation and computational analysis

  摘要：

  许多噻吩类硫胺素的中性衍生物被测试，以探索两个硫胺素焦磷酸盐（TPP）结合口袋和底物结合C2口袋的SAR：最佳抑制剂的结合力比TPP高77倍。

  DOI：

  10.1039/d2ob02272a

文献信息

• Design, Synthesis, and Potency of Pyruvate Dehydrogenase Complex E1 Inhibitors against Cyanobacteria
  作者：Yuan Zhou、Jiangtao Feng、Hongwu He、Leifeng Hou、Wen Jiang、Dan Xie、Lingling Feng、Meng Cai、Hao Peng

  DOI：10.1021/acs.biochem.7b00636

  日期：2017.12.12

  designed and synthesized. A part of 10, 17, and 21 displayed potent inhibition of Escherichia coli pyruvate dehydrogenase complex E1 (E. coli PDHc-E1) (IC50 = 2.12–18.06 μM) and good inhibition of Synechocystis sp. PCC 6803 (EC50 = 0.7–7.1 μM) and Microcystis sp. FACH 905 (EC50 = 3.7–7.6 μM). The algaecidal activity of these compounds positively correlated with their inhibition of E. coli PDHc-E1. In particular

  需要安全有效的除藻剂来控制具有农业和环境意义的藻类。四个系列（6，10，17，和21 29新的4-氨基嘧啶衍生物）的合理设计和合成。的一部分10，17，和21中显示的有效抑制大肠杆菌丙酮酸脱氢酶复合物E1（大肠杆菌PDHC-E1）（IC 50 = 2.12-18.06μM）和抑制良好的集胞藻属。PCC 6803（EC 50 = 0.7–7.1μM）和微囊藻。FACH 905（EC 50= 3.7–7.6μM）。这些化合物的杀藻活性与它们对大肠杆菌PDHc-E1的抑制作用正相关。特别是21l和10b表现出对PCC 6803的强效杀藻活性（分别为EC 50 = 0.7和0.8μM），其值是硫酸铜（EC 50 = 1.8μM）的2倍，并且表现最佳抑制蓝细菌PDHc-E1（IC 50分别为5.10和6.06μM ）。17h和21e是大肠杆菌的最佳抑制剂通过分子对接，定点诱变和酶促测定研究了PDHc
• The design, synthesis and biological evaluation of novel thiamin diphosphate analog inhibitors against the pyruvate dehydrogenase multienzyme complex E1 from Escherichia coli
  作者：Lingling Feng、Junbo He、Haifeng He、Lulu Zhao、Lingfu Deng、Li Zhang、Lin Zhang、Yanliang Ren、Jian Wan、Hongwu He

  DOI：10.1039/c4ob01347f

  日期：——

  Pyruvate dehydrogenase multienzyme complex E1 (PDHc E1) is a potential target enzyme when looking for inhibitors to combat microbial disease. In this study, we designed and synthesized a series of novel thiamin diphosphate (ThDP) analogs with triazole ring and oxime ether moieties as potential inhibitors of PDHc E1. Their inhibitory activities against PDHc E1 were examined both in vitro and in vivo

  丙酮酸脱氢酶多酶复合物E1（PDHc E1）是寻找与微生物疾病作斗争的抑制剂时潜在的目标酶。在这项研究中，我们设计和合成了一系列新颖的硫胺二磷酸（ThDP）类似物，它们具有三唑环和肟醚部分作为PDHc E1的潜在抑制剂。他们的抑制活性对PDHc E1进行了体外和体内检查。大多数测试化合物对PDHc E1表现出中等抑制作用（IC 50 = 6.1–75.5μM）。强大的抑制剂4g，4h和4j在体外具有较强的抑制活性，对PDHc E1的IC 50值为6.7、6.9和6.1μM并且在100μgmL -1的体内对玉米赤霉病菌的体内抑制率分别为35％，50％和33％。通过分子对接法分析了4j与PDHc E1的结合方式。此外，通过定点诱变，酶促测定和光谱荧光研究检查了PDHc E1重要残基与化合物4j的可能相互作用。理论和实验结果吻合良好，表明化合物4j可用作进一步优化的先导化合物，并且可能具有作为新型杀菌剂的潜力。
• Thiamine analogues and their use as antibiotics
  申请人：Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn

  公开号：EP2626356A1

  公开（公告）日：2013-08-14

  The present invention relates to compounds according to general formula (I), pharmaceutical compositions comprising compounds according to general formula (I) and the use of the compounds for the treatment of a bacterial infection, particularly for use as an antibiotic.

  这项发明涉及符合一般式(I)的化合物，包括含有符合一般式(I)的化合物的药物组合物，以及利用这些化合物治疗细菌感染，特别是用作抗生素的用途。
• Synthesis and biological evaluation of pyrophosphate mimics of thiamine pyrophosphate based on a triazole scaffold
  作者：Karl M. Erixon、Chester L. Dabalos、Finian J. Leeper

  DOI：10.1039/b806580b

  日期：——

  extremely potent triazole inhibitors with K(I) values down to 20 pM, compared to a K(D) value of 0.35 microM for TPP. This triazole scaffold was used for further investigation and six analogues containing mimics of the pyrophosphate group were synthesised and tested for inhibition of PDC. Several effective analogues were found with K(I) values down to around 1 nM.

  合成了硫胺素焦磷酸盐（TPP）的新型基于三唑的焦磷酸盐类似物，并测试了其对运动发酵单胞菌（Zymomonas mobilis）丙酮酸脱羧酶（PDC）的抑制作用。在有效的两步操作中，将硫胺素的噻唑鎓环替换为三唑。然后，焦磷酸化作用可制得非常有效的三唑抑制剂，其K（I）值低至20 pM，而TPP的K（D）值为0.35 microM。该三唑支架用于进一步研究，合成了六种含有焦磷酸盐基团模拟物的类似物，并测试了其对PDC的抑制作用。发现了几种有效的类似物，其K（I）值低至约1 nM。
• [EN] THIAMINE DERIVATIVES AND THEIR USE AS ANTIBIOTICS<br/>[FR] DÉRIVÉS DE THIAMINE ET LEUR UTILISATION COMME ANTIBIOTIQUES
  申请人：UNIV BONN

  公开号：WO2013117559A1

  公开（公告）日：2013-08-15

  The present invention relates to compounds according to general formula (I), pharmaceutical compositions comprising compounds according to general formula (I) and the use of the compounds for the treatment of a bacterial infection, particularly for use as an antibiotic.

  本发明涉及符合通式（I）的化合物，包括含有符合通式（I）的化合物的药物组合物，以及利用这些化合物治疗细菌感染，特别是用作抗生素的用途。