已经开发了
天冬氨酸半
醛脱氢酶酶的
抑制剂,
天冬氨酸半
醛脱氢酶是产生新型抗生素化合物的关键
生物学靶标。为了研究
抑制剂系列中结合的改进,研究了通过构象限制降低熵屏障对结合的影响。生成了线性和环状底物类似物的库,并使用计算对接来辅助结构选择。因此鉴定出环状
膦酸酯
抑制剂18与酶活性位点互补。合成和体外抑制分析表明,其对天然底物的K(i)为3.8 mM,其中18的线性类似物(化合物15)以前没有抑制活性。两种其他
抑制剂,
磷酸盐类似物非对映异构体17a和17b,合成,并且还发现具有较低的毫摩尔K(i)值。作为计算对接研究的结果,发现了一种新型的底物结合相互作用:底物(
磷酸氢氧根作为氢键供体)与
NADPH辅因子(2'-氧作为氢键受体)之间的氢键结合。