作者:Richard Trilles、Dmitri Beglov、Qiujia Chen、Hongzhen He、Randall Wireman、April Reed、Spandan Chennamadhavuni、James S. Panek、Lauren E. Brown、Sandor Vajda、John A. Porco、Mark R. Kelley、Millie M. Georgiadis
DOI:10.1021/acs.jmedchem.8b01529
日期:2019.2.28
for inhibition of APE1 endonuclease activity. In an iterative process, hot-spot-guided docking, characterization of inhibition of APE1 endonuclease, and cytotoxicity of cancer cells were used to design next generation macrocycles. To assess target selectivity in cells, selected macrocycles were analyzed for modulation of DNA damage. Taken together, our studies suggest that macrocycles represent a promising
apurinic / apyrimidinic核酸内切酶1(APE1)是必不可少的碱基切除修复酶,在许多癌症中均被上调,有助于对用DNA烷化剂或氧化剂治疗的肿瘤产生抵抗力,并且最近被确定为重要的治疗靶点。在这项工作中,我们通过实验确定了APE1高分辨率晶体结构中小有机分子结合的热点,并通过使用FTMAP分析(http://ftmap.bu.edu/)进行了计算。在这些热点的引导下,停靠了一个类似药物的大环化合物文库,然后筛选了对APE1核酸内切酶活性的抑制作用。在迭代过程中,热点引导对接,APE1核酸内切酶抑制作用的表征以及癌细胞的细胞毒性被用于设计下一代大环化合物。为了评估细胞中的靶标选择性,分析了选定的大环化合物对DNA损伤的调节作用。综上所述,我们的研究表明,大环化合物代表了一种有前途的抑制癌细胞中APE1的化合物。