基于已知的选择性 Mcl-1
抑制剂 6-
氯-3-(3-(4-
氯-3,5-二
甲基苯氧基)丙基)-1H-
吲哚-2-羧酸,我们采用基于片段的方法获得延伸到
BH3 凹槽 p1 口袋的新分子,然后表现出对 Mcl-1 的结合选择性,而不是 Bcl-2 蛋白。在我们从母体分子中解构出 1H-
吲哚-2-羧酸后,根据 X 射线鉴定的母体分子的结合模式,在 1 位取代了
苯磺酰基以采用优选的几何形状来访问 p1 口袋晶体学。在分子生长以占据 p1 口袋的过程中,
配体结合的自由能 (ΔG) 与非
氢重原子数 (HAC) 之间保持线性关系。最后,我们不仅得到了化合物 12 的 7。对 Mcl-1 的选择性比 Bcl-2(Ki = 3.6 µM)高 5 倍(荧光偏振的 Ki = 0.48 µM),但也提供了证据表明 p1 口袋的额外占用对 Mcl-1 比对 Bcl-更有利2 结合,对 Mcl-1 抑制的贡献大于对