N-芴甲氧羰基-L-丝氨酸五氟苯基酯 | 86061-05-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: N-芴甲氧羰基-L-丝氨酸五氟苯基酯
• 英文名称: N^α-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-L-serine pentafluorophenyl ester
• 英文别名: N^α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-L-serine pentafluorophenyl ester；(2,3,4,5,6-pentafluorophenyl) (2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-hydroxypropanoate
• CAS: 86061-05-4
• 化学式: C₂₄H₁₆F₅NO₅
• 分子量: 493.387
• InChiKey: FFLYZEMXCTVVQO-INIZCTEOSA-N

物化性质

• 熔点：
  124-126 °C
• 沸点：
  634.3±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.485±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.4
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  84.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-芴甲氧羰基-L-丝氨酸五氟苯基酯 在 3 A molecular sieve 、 silver trifluoromethanesulfonate 、 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 N^α-Fmoc-Ser(Ac3-β-D-GlcNAc)-OPfp
  参考文献：
  名称：

  从 N-二硫代琥珀酰保护衍生物合成 2-乙酰氨基-2-脱氧-β-d-吡喃葡萄糖O-糖肽1-3

  摘要：

  2-乙酰氨基-2-脱氧-β-d-吡喃葡萄糖 (β-d-GlcpNAc)，在与丝氨酸 (Ser) 和苏氨酸 (Thr) 残基侧链羟基的 O-糖苷键中，经常在细胞核和细胞质中发现蛋白质。固相糖肽合成的“活性酯”方法需要 Nα-(9-芴基甲氧羰基)氨基酸五氟苯基酯 (Nα-Fmoc-AA-OPfp's) 的直接糖基化。所需的 Ser(β-d-GlcpNAc) 和 Thr(β-d-GlcpNAc) 结构单元的合成带来了由相应糖基供体中的 2-氨基取代基引起的特殊问题。用 2-N-酰基基团激活供体提供了相对不活泼的恶唑啉中间体，而原本有希望的邻苯二甲酰基 (Phth) 基团需要在高温下长时间进行碱处理才能将其去除，并且经常遇到不完全脱保护。二硫代琥珀酰基 (Dts) 基团以与 Phth 基团相同的方式提供二价保护，但具有在温和条件下快速去除的优点...

  DOI：

  10.1021/ja953529i
• 作为产物：
  描述：

  FMOC-O-叔丁基-L-丝氨酸五氟苯酯 在 三氟乙酸 作用下， 反应 0.5h， 以94%的产率得到N-芴甲氧羰基-L-丝氨酸五氟苯基酯
  参考文献：
  名称：

  Vargas-Berenguel, Antonio; Meldal, Morten; Paulsen, Hans, Journal of the Chemical Society. Perkin transactions I, 1994, # 18, p. 2615 - 2620

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Azido Acids in a Novel Method of Solid-Phase Peptide Synthesis.
  作者：Morten Meldal*、Maria A Juliano、Anita M Jansson

  DOI：10.1016/s0040-4039(97)00393-6

  日期：1997.4

  in a novel method of solid-phase synthesis. The azido acids were transformed into the highly activated acid chlorides and used synthesis of extremely hindered peptides containing up to four successive diphenyl glycine or Aib residues. By reaction of the genetically encoded amino acids with TfN3 and then SOCl2 they were transformed into α-azido acid chlorides used in solid-phase peptide synthesis without

  通过用NBS进行α-溴化，然后用叠氮化钠取代，由α-支链酸生产出叠氮酸，并将其用于新的固相合成方法。叠氮基酸被转化为高度活化的酰氯，并用于合成高度受阻的肽，该肽包含多达四个连续的二苯基甘氨酸或Aib残基。通过遗传编码的氨基酸与TfN 3然后与SOCl 2的反应，它们被转化为用于固相肽合成的α-叠氮酰氯，而没有消旋作用。©1997爱思唯尔科学有限公司。
• Studies directed toward the synthesis of protein-bound GPI anchor
  作者：Yasuko Tanaka、Yuko Nakahara、Hironobu Hojo、Yoshiaki Nakahara

  DOI：10.1016/s0040-4020(03)00615-x

  日期：2003.6

  Mannobioside-linked phosphoethanolamine 10, a prototype model of the GPI anchor, was synthesized via glycosidation of the monosaccharide donor and acceptor, and subsequent phosphorylation. In order to test the reactivity of the amino group involved in 10 against the activated amino acid esters, 10 was reacted with N-protected amino acid pentafluorophenyl esters in the presence of HOBt. The reactions

  通过单糖供体和受体的糖基化和随后的磷酸化，合成了甘露糖苷连接的磷酸乙醇胺10（GPI锚的原型模型）。为了测试10所涉及的氨基对活化的氨基酸酯的反应性，在HOBt的存在下使10与N-保护的氨基酸五氟苯基酯反应。反应以中等收率得到氨基酰化产物。当将Fmoc-SER-OPFP 12和Fmoc-半胱氨酸（SBU吨）-OPFP 14与进行反应10，副产物19，20和21衍生自N-和O-酰化反应。相反，用AgNO 3，HOSu和DIEA促进10和N-保护的氨基酸硫酯的反应，以提供偶联产物而没有不希望的O-酰化。在肽硫酯方法的片段偶联条件以及天然化学连接的片段偶联条件下，用合成的寡肽硫酯24和27的10的肽基化也是成功的。
• An Orthogonally Protected <i>α</i><i>,</i><i>α</i>-Bis(aminomethyl)-<i>β</i><i>-</i>alanine Building Block for the Construction of Glycoconjugates on a Solid Support
  作者：Johanna Katajisto、Tuomas Karskela、Petri Heinonen、Harri Lönnberg

  DOI：10.1021/jo026053b

  日期：2002.11.1

  the study of carbohydrate binding. We herein report the synthesis of an orthogonally protected building block, N-Alloc-N'-Boc-N' '-Fmoc-alpha,alpha-bis(aminomethyl)-beta-alanine (1), and its use in the preparation of triantennary peptide glycoclusters (21-24) on a solid support. The assembly of the clusters involves removal of the amino protections of the solid-supported branching unit 1 in the order

  合成的糖簇被广泛用作各种糖生物学应用中的天然存在的多价碳水化合物配体的模拟物。然而，它们的制备并非易事，它仍然是研究碳水化合物结合的限制因素。我们在此报告了正交保护的结构单元N-Alloc-N'-Boc-N''-Fmoc-α，α-双（氨基甲基）-β-丙氨酸（1）的合成及其在制备以下化合物中的用途固体支持物上的三天线肽糖簇（21-24）。簇的组装涉及以Fmoc，Boc和Alloc的顺序除去固相支持的支化单元1的氨基保护基，并随后将过乙酰化的O-（甘露糖基）-N-Fmoc-L-丝氨酸五氟苯基酯偶联（半乳糖，葡萄糖，甘露糖和核糖）暴露给每个氨基。
• Positional Scanning MUC1 Glycopeptide Library Reveals the Importance of PDTR Epitope Glycosylation for Lectin Binding
  作者：YashoNandini Singh、Maria C. Rodriguez Benavente、Mohammed H. Al-Huniti、Donella Beckwith、Ramya Ayyalasomayajula、Eric Patino、William S. Miranda、Alex Wade、Maré Cudic

  DOI：10.1021/acs.joc.9b02396

  日期：2020.2.7

  screen PS-SGCL against two plant lectins, Glycine max soybean agglutinin and Vicia villosa. The results revealed a carbohydrate density-dependent affinity trend and site-specific glycosylation requirements for high affinity binding to these lectins. Hence, PS-SGCLs provide a platform to systematically elucidate MUC1-lectin binding specificities, which in the long term may provide a rational design for

  解释基于聚糖的改变在癌症中的功能重要性的主要障碍之一是在癌细胞表面上发现的天然表位异质性。为了帮助解决这一知识鸿沟，我们专注于设计合成工具，以探索与凝集素相关的MUC1肿瘤相关聚糖在转移形成中的作用。在这项研究中，我们首次合成了MUC1衍生的位置扫描合成糖肽组合文库（PS-SGCL），该文库使用“茶袋”方法改变了癌症相关Tn抗原的数量和位置。确定了将（糖）氨基酸混合物等摩尔掺入树脂结合的氨基酸所必需的等速比，以及开发一种用于O-乙酰基树脂脱保护的有效方案。使用酶联凝集素测定法针对两种植物凝集素Glycine max大豆凝集素和蚕豆Vicia筛选PS-SGCL。结果揭示了碳水化合物密度依赖性亲和趋势和对这些凝集素的高亲和力结合的位点特异性糖基化要求。因此，PS-SGCL为系统地阐明MUC1-凝集素结合特异性提供了一个平台，从长远来看，它可以为涉及肿瘤扩散和基于糖肽的癌症疫苗中的MUC1-凝集
• Dithiasuccinoyl (Dts) amino-protecting group used in syntheses of 1,2-trans-amino sugar glycosides
  作者：Ernst Meinjohanns、Morten Meldal、Hans Paulsen、Klaus Bock

  DOI：10.1039/p19950000405

  日期：——

  N-dithiasuccinoyl protecting group was easy to remove by thiolysis using 2-sulfanylethanol or dithiothreitol or reductively using sodium boranuide, thus affording, after N-acetylation, the corresponding N-acetyl-β-D-glucosamine glycosides. It has been demonstrated that it is possible to reduce the Dts group in the presence of an azido group selectively by sodium boranuide or the Dts- and the azido group simultaneously

  具有氨基官能团的N-二硫代琥珀酰（N- Dts）保护基的合适的受保护的D-葡糖胺衍生物已经以新的替代途径应用于1，2-反式-糖基化。所述ø - （3,4,6-三- ø -乙酰基-2-脱氧-2- dithiasuccinoylamino-β- d吡喃葡萄糖基）三- chloroacetimidate 7已被用于制备相应的以良好的收率由路易斯酸促进β糖苷。所述Ñ -dithiasuccinoyl保护基团是很容易通过硫解使用2- sulfanylethanol或二硫苏糖醇或还原使用boranuide钠，从而得到去除，之后Ñ-乙酰化，相应的N-乙酰基-β - D-葡糖胺糖苷。已经证明，可以在使用叠氮基的情况下，通过硼氢化钠选择性地还原Dts基团，或者通过二硫苏糖醇通过二硫苏糖醇同时还原Dts-和叠氮基团，使用二异丙基乙胺作为催化剂。构建块的合成。Ñ α -Fmoc-SER（AC 3 -β- d -GlcNDts）-OPfp