4-[2-[(E)-2-[3,3-dimethyl-1-[6-(2-methylidene-5-oxopyrrolidin-1-yl)oxy-6-oxohexyl]indol-1-ium-2-yl]ethenyl]-6-[(2E)-2-[3,3-dimethyl-1-(4-sulfobutyl)indol-2-ylidene]ethylidene]cyclohexen-1-yl]oxybenzenesulfonic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 4-[2-[(E)-2-[3,3-dimethyl-1-[6-(2-methylidene-5-oxopyrrolidin-1-yl)oxy-6-oxohexyl]indol-1-ium-2-yl]ethenyl]-6-[(2E)-2-[3,3-dimethyl-1-(4-sulfobutyl)indol-2-ylidene]ethylidene]cyclohexen-1-yl]oxybenzenesulfonic acid
• 化学式: C51H60N3O10S2+
• 分子量: 939.2
• InChiKey: FQNVXAGGSFKIKQ-UHFFFAOYSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.7
• 重原子数：
  66
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  188
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

文献信息

• CYANINE DYES AND METHODS OF USE
  申请人：Peng Xinzhan

  公开号：US20070042398A1

  公开（公告）日：2007-02-22

  The present invention provides for cyanine dyes as near IR quenchers. The cyanine dyes have absorption wavelengths in the near-infrared region of about 650-900 nm and are essentially non-fluorescent. The dyes of the invention have at least one linking group. The present invention also provides substantially non-fluorescent, NIR probes. Biological assays based on these novel, substantially non-fluorescent, NIR probes are also provided.

  本发明提供了靠近红外熄灭剂的靛青染料。这些靛青染料在近红外区域具有吸收波长，约为650-900纳米，并且基本上不发光。本发明的染料具有至少一个连接基团。本发明还提供了基本上不发光的近红外探针。基于这些新型、基本上不发光的近红外探针的生物测定也提供了。