S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-4-羟基-3-膦酰氧基四氢呋喃-2-基]甲氧基-羟基磷酰]氧基-羟基磷酰]氧基-2-羟基-3,3-二甲基丁酰基]氨基]丙酰氨基]乙基](2S)-2-羟基硫代十八烷酸酯 | 38861-93-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 中文名称: S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-4-羟基-3-膦酰氧基四氢呋喃-2-基]甲氧基-羟基磷酰]氧基-羟基磷酰]氧基-2-羟基-3,3-二甲基丁酰基]氨基]丙酰氨基]乙基](2S)-2-羟基硫代十八烷酸酯
• 英文名称: 2-hydroxyoctadecanoyl-CoA
• 英文别名: S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] 2-hydroxyoctadecanethioate
• CAS: 38861-93-7
• 化学式: C₃₉H₇₀N₇O₁₈P₃S
• 分子量: 1050.01
• InChiKey: OJQMIXCIJFLULT-WRPLWBMRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  68
• 可旋转键数：
  36
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  409
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  23

安全信息

• WGK Germany：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-4-羟基-3-膦酰氧基四氢呋喃-2-基]甲氧基-羟基磷酰]氧基-羟基磷酰]氧基-2-羟基-3,3-二甲基丁酰基]氨基]丙酰氨基]乙基](2S)-2-羟基硫代十八烷酸酯 在 2-hydroxyacyl-CoA lyase 、 焦磷酸硫胺素 、 magnesium chloride 、 BSA 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 0.08h， 生成 十七碳醛
  参考文献：
  名称：

  脂肪醛的 RP-HPLC-荧光分析：应用于醛生成酶 HACL1 和 SGPL1。

  摘要：

  长链醛通常在各种过程中产生，例如长链 3-甲基支化和 2-羟基脂肪酸的过氧化物酶体 α-氧化和磷酸化鞘氨醇碱基的微粒体分解。参与这些过程的醛生成步骤的酶分别是 2-羟酰基辅酶 A 裂解酶 (HACL1) 和 1-磷酸鞘氨醇裂解酶 (SGPL1)。在目前的工作中，使用 Hantzsch 反应开发了对这些酶的非放射性测定。选择十三醛 (C13-al) 和十七醛 (C17-al) 作为模型化合物，选择环己烷-1,3-二酮作为 1,3-二酮，并通过反相 (RP)-HPLC 分析荧光衍生物。针对 C13-al 和 C17-al 优化了测定混合物组成以及 pH 值和加热。在优化条件下，这些醛可以在皮摩尔范围内定量，不同的长链醛衍生物可以通过 RP-HPLC 的线性梯度洗脱得到很好的分离。通过这种方法可以很容易地检测到重组酶产生的醛。此外，该测定允许在没有提取步骤的情况下记录组织匀浆和成纤维细胞裂解物中的活性或缺陷。总之，开发了一种用于研究

  DOI：

  10.1194/jlr.d044230

文献信息

• RP-HPLC-fluorescence analysis of aliphatic aldehydes: application to aldehyde-generating enzymes HACL1 and SGPL1
  作者：Serena Mezzar、Evelyn de Schryver、Paul P. Van Veldhoven

  DOI：10.1194/jlr.d044230

  日期：2014.3

  heating, were optimized for C13-al and C17-al. Under optimized conditions, these aldehydes could be quantified in picomolar range and different long-chain aldehyde derivatives were well resolved with a linear gradient elution by RP-HPLC. Aldehydes generated by recombinant enzymes could easily be detected via this method. Moreover, the assay allowed to document activity or deficiency in tissue homogenates

  长链醛通常在各种过程中产生，例如长链 3-甲基支化和 2-羟基脂肪酸的过氧化物酶体 α-氧化和磷酸化鞘氨醇碱基的微粒体分解。参与这些过程的醛生成步骤的酶分别是 2-羟酰基辅酶 A 裂解酶 (HACL1) 和 1-磷酸鞘氨醇裂解酶 (SGPL1)。在目前的工作中，使用 Hantzsch 反应开发了对这些酶的非放射性测定。选择十三醛 (C13-al) 和十七醛 (C17-al) 作为模型化合物，选择环己烷-1,3-二酮作为 1,3-二酮，并通过反相 (RP)-HPLC 分析荧光衍生物。针对 C13-al 和 C17-al 优化了测定混合物组成以及 pH 值和加热。在优化条件下，这些醛可以在皮摩尔范围内定量，不同的长链醛衍生物可以通过 RP-HPLC 的线性梯度洗脱得到很好的分离。通过这种方法可以很容易地检测到重组酶产生的醛。此外，该测定允许在没有提取步骤的情况下记录组织匀浆和成纤维细胞裂解物中的活性或缺陷。总之，开发了一种用于研究