[S-(R*,R*)]-3-叠氮基-2-[[芴甲氧羰基]氨基]丁酸 | 131669-42-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: [S-(R*,R*)]-3-叠氮基-2-[[芴甲氧羰基]氨基]丁酸
• 英文名称: (2S,3S)-3-azido-2-(fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)butyric acid
• 英文别名: (2S,3S)-Fmoc-abu(3-n3)-oh；(2S,3S)-3-azido-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)butanoic acid
• CAS: 131669-42-6
• 化学式: C₁₉H₁₈N₄O₄
• 分子量: 366.376
• InChiKey: LLJMYBCJYQGZOS-GTNSWQLSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  90
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

安全信息

• WGK Germany：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [S-(R*,R*)]-3-叠氮基-2-[[芴甲氧羰基]氨基]丁酸 在 钯 氢气 、 potassium hydrogencarbonate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 (2S,3S)-3-(tert-butoxycarbonylamino)-2-(fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)butyric acid
  参考文献：
  名称：

  拉维霉素：全合成和构型分配

  摘要：

  从淡紫色链霉菌亚种的培养滤液中分离出的（–）-拉维霉素，一种毒性很低的强效抗生素六肽。巴西利亚已经合成。

  DOI：

  10.1039/c39900001216
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-Thr-OH 在 盐酸 、 N,N-bis[2-oxo-3-oxazolidinyl]phosphorodiamidic chloride 、 三(2-氯乙基)胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 38.0h， 生成 [S-(R*,R*)]-3-叠氮基-2-[[芴甲氧羰基]氨基]丁酸
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Enantiomerically Pure and Compatibly Protected (2S,3R)- and (2S,3S)-Diaminobutyric Acids

  摘要：

  (2S,3R)-和(2S,3S)-2, 3-二氨基丁酸具有 Fmoc 保护的 δ-氨基基团和兼容保护的 ²-氨基基团[(2S,3R)-和 (2S、(2S,3R)-和(2S,3S)-3-(叔丁氧羰基氨基)-2-(芴-9-甲氧羰基氨基)丁酸]可以从 L-苏氨酸和 L-异苏氨酸通过相应的酰肼经 Mitsunobu 反应制备成十克量。

  DOI：

  10.1055/s-1992-26332

文献信息

• The effect of replacing the ester bond with an amide bond and of overall stereochemistry on the activity of daptomycin
  作者：Ryan Moreira、Ghufran Barnawi、David Beriashvili、Michael Palmer、Scott D. Taylor

  DOI：10.1016/j.bmc.2018.12.004

  日期：2019.1

  daptomycin’s activity. ent-Dap-K6-E12-W13 was found to be at least 133-fold less active than Dap-K6-E12-W13, indicating that a chiral interaction with a chiral target is essential to daptomycin’s activity. Studies examining the binding of Dap-K6-E12-W13 and ent-Dap-K6-E12-W13 to model liposomes consisting of phosphatidylglycerol (PG) and phosphatidylcholine suggest that the stereochemistry of PG plays

  自2003年以来，达托霉素（一种环状脂肽肽抗生素）已在临床上用于治疗由革兰氏阳性细菌引起的严重感染。尽管达托霉素的发现已经过去了37年，但其作用机理仍存在争议。在本报告中，研究了用酰胺键取代酯键的效果以及总体立体化学对达托霉素生物活性的影响。制备了两种肽，其中活性达托霉素类似物Dap-K6-E12-W13中的苏氨酸4残基被（2 S，3 R）-二氨基丁酸（（2 S，3 R）-DABA）或其差向异构体取代（2秒，3秒-DABA）将闭环酯键转变成酰胺键。发现这两种肽的活性均显着低于Dap-K6-E12-W13。这些结果，加上我们先前对其他达托霉素类似物的研究，使我们得出结论，酯键对达托霉素的活性至关重要。发现ent -Dap-K6-E12-W13的活性至少比Dap-K6-E12-W13低133倍，这表明与手性靶的手性相互作用对于达托霉素的活性是必不可少的。研究检查Dap-K6-E12-W13和ent
• Synthesis and Evaluation of Dolastatin 10 Analogues Containing Heteroatoms on the Amino Acid Side Chains
  作者：Julien Dugal-Tessier、Stuart D. Barnscher、Akira Kanai、Brian A. Mendelsohn

  DOI：10.1021/acs.jnatprod.7b00359

  日期：2017.9.22

  dolastatin 10 core scaffold has mainly focused on modifications of the P1, N-terminus, and P5, C-terminus, with minimal attention to the P2 subunit. In this paper we discuss the introduction of heteroatoms to the P2 side chain, which results in potent activity in vitro. The most active compounds contained azides in the P2 unit and required a phenylalanine-derived P5 subunit.

  天然存在的dolastatin 10的合成类似物因其强大的体外活性以及在抗体药物偶联物（ADC）中的有效负载而在癌症中引起了极大的兴趣。dolastatin 10核心支架的修饰主要集中在P1，N末端和P5，C末端的修饰，而对P2亚基的关注却很少。在本文中，我们讨论了将杂原子引入P2侧链的方法，该方法可在体外产生有效的活性。活性最高的化合物在P2单元中包含叠氮化物，并且需要苯丙氨酸衍生的P5亚基。
• Total Synthesis of Malacidin A by β‐Hydroxyaspartic Acid Ligation‐Mediated Cyclization and Absolute Structure Establishment
  作者：Zhenquan Sun、Zhuo Shang、Nicholas Forelli、Kathy Hiu Laam Po、Sheng Chen、Sean F. Brady、Xuechen Li

  DOI：10.1002/anie.202009092

  日期：2020.11.2

  action is distinct from classical CDAs. However, the absolute structure of malacidin A has not been established. Herein, the total syntheses of malacidin A and its analogues are reported by a combination of Fmoc‐based solid‐phase peptide synthesis (SPPS) and β‐hydroxyaspartic acid ligation‐mediated peptide cyclization. The total synthesis enabled us to establish the absolute configuration of malacidin

  新型抗生素的开发对于对抗日益增多的耐药病原体至关重要。Malacidin A 是钙依赖性抗生素 (CDA) 家族的新成员，具有抗抗生素耐药性病原体的活性。它的作用方式不同于经典的 CDA。然而，尚未确定马拉西丁 A 的绝对结构。在此，通过基于 Fmoc 的固相肽合成 (SPPS) 和 β-羟基天冬氨酸连接介导的肽环化的组合报道了 Malacidin A 及其类似物的全合成。全合成使我们能够建立马拉西丁 A 的绝对构型，这与我们研究中高级 Marfey 分析证实的天然马拉西丁 A 的构型一致。
• The Total Synthesis of Antrimycin D_v; II:¹Synthesis of Tetrahydropyridazinecarboxylic Acid and Its Incorporation into Peptides
  作者：Ulrich Schmidt、Bernd Riedl

  DOI：10.1055/s-1993-25947

  日期：——

  Appropriately protected di- and tripeptides containing (R, S)-tetra -hydropyridazine-3-carboxylic acids were synthesized via protected γ-formyl-α-hydrazinobutyric acids. The latter compounds are obtained from acetals of either ethyl γ-formylbutyrate or ethyl γ-formyl-α-oxobutyrate.

  通过受保护的δ-α-肼丁酸合成了含有(R, S)-四氢哒嗪-3-羧酸的经适当保护的二肽和三肽。后一种化合物是从δ-甲酰基丁酸乙酯或δ-甲酰基-δ-氧代丁酸乙酯的缩醛中获得的。
• Rational Design of a Highly Potent and Selective Peptide Inhibitor of PACE4 by Salt Bridge Interaction with D160 at Position P3
  作者：Vahid Dianati、Azar Shamloo、Anna Kwiatkowska、Roxane Desjardins、Armand Soldera、Robert Day、Yves L. Dory

  DOI：10.1002/cmdc.201700300

  日期：2017.8.8

  PACE4, a member of the proprotein convertases (PCs) family of serine proteases, is a validated target for prostate cancer. Our group has developed a potent and selective PACE4 inhibitor: Ac-LLLLRVKR-NH2 . In seeking for modifications to increase the selectivity of this ligand toward PACE4, we replaced one of its P3 Val methyl groups with a basic group capable of forming a salt bridge with D160 of PACE4

  PACE4是丝氨酸蛋白酶的前蛋白转化酶（PCs）家族的成员，是前列腺癌的有效靶标。我们小组开发了一种有效且选择性的PACE4抑制剂：Ac-LLLLRVKR-NH2。在寻求修饰以增加该配体对PACE4的选择性时，我们用能够与PACE4的D160形成盐桥的碱性基团取代了其P3 Val甲基之一。所得抑制剂的效力是P3 Val母体抑制剂的八倍，选择性是弗林蛋白酶的两倍，因为与弗林蛋白酶E257的等效盐桥不是最佳的。而且，新的P3残基的β-分支性质有利于通常与蛋白酶底物有关的扩展的β-折叠构象。