[[5-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基]甲氧基羟基磷酰]氧基膦酸 | 800-73-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物 - 有机含氧阴离子化合物
• 中文名称: [[5-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基]甲氧基羟基磷酰]氧基膦酸
• 中文别名: 三碘化-碘汞(1:1)亚砷
• 英文名称: dCDP
• 英文别名: Deoxycytidine diphosphate；[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 800-73-7
• 化学式: C₉H₁₅N₃O₁₀P₂
• 分子量: 387.18
• InChiKey: FTDHDKPUHBLBTL-SHYZEUOFSA-N

物化性质

• 物理描述：
  Solid
• 碰撞截面：
  174.5 Ų [M+Na]+ [CCS Type: DT, Method: single field calibrated with Agilent tune mix (Agilent)]

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.5
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  201
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [[5-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基]甲氧基羟基磷酰]氧基膦酸 在 phospho(enol)pyruvate 、 pyruvate kinase from rabbit muscle (EC 2.7.1.40) 、 potassium chloride 作用下， 以 phosphate buffer 为溶剂， 生成 2'-脱氧胞苷三磷酸
  参考文献：
  名称：

  Cihlar, Tomas; Chen, Ming S., Molecular Pharmacology, 1996, vol. 50, # 6, p. 1502 - 1510

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  胞苷-5’-二磷酸 在 adenosylcobalamin 、 full-length enzyme NrdJd-wt from Stackebrandtia nassauensis 、 2'-脱氧腺苷 5'-三磷酸酯 、 magnesium chloride 、 Cleland's reagent 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 [[5-(4-氨基-2-氧代嘧啶-1-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基]甲氧基羟基磷酰]氧基膦酸
  参考文献：
  名称：

  存在于大多数II类核糖核苷酸还原酶中的独特的富含半胱氨酸的锌指结构域介导催化转换。

  摘要：

  核糖核苷酸还原酶（RNR）催化核糖核苷酸还原为相应的脱氧核糖核苷酸，用于DNA合成和修复。两种不同的机制有助于将所需的电子传递到RNR活性位点。甲酸酯可直接在活性位点用作还原剂，或戊二醛毒素或硫氧还蛋白还原C端半胱氨酸对，然后将电子传递至活性位点。在这里，我们表征了一个新颖的富含半胱氨酸的C末端结构域（CRD），它存在于微生物中发现的大多数II类RNR中。来自nassauensis Stackebrandtia nassauensis细菌的NrdJd型RNR被用作模型酶。我们表明CRD参与较高的低聚物状态形成和电子转移到活性位点。高聚物（例如四聚物和六聚物）的CRD依赖性形成 通过添加dATP或dGTP而不是dTTP或dCTP来诱导细胞凋亡。电子转移是由在C末端的六个半胱氨酸残基阵列介导的，这些残基也与锌原子配位。电子转移也可能发生在亚基之间，具体取决于酶的低聚状态。对系统天然还原剂的研究

  DOI：

  10.1074/jbc.m117.806331

文献信息

• Nucleotide mimics and their prodrugs
  申请人：——

  公开号：US20040059104A1

  公开（公告）日：2004-03-25

  The present invention relates to nucleoside diphosphate mimics and nucleoside triphosphate mimics, which contain diphosphate or triphosphate moiety mimics and optionally sugar-modifications and/or base-modifications. The nucleotide mimics of the present invention, in a form of a pharmaceutically acceptable salt, a pharmaceutically acceptable prodrug, or a pharmaceutical formulation, are useful as antiviral, antimicrobial, and anticancer agents. The present invention provides a method for the treatment of viral infections, microbial infections, and proliferative disorders. The present invention also relates to pharmaceutical compositions comprising the compounds of the present invention optionally in combination with other pharmaceutically active agents.

  本发明涉及核苷二磷酸模拟物和核苷三磷酸模拟物，其中包含二磷酸或三磷酸基团模拟物，以及可选的糖修饰和/或碱基修饰。本发明的核苷酸模拟物，以药学上可接受的盐、药学上可接受的前药或药物配方的形式，可用作抗病毒、抗微生物和抗癌剂。本发明提供了一种治疗病毒感染、微生物感染和增生性疾病的方法。本发明还涉及包含本发明化合物的药物组合物，可选地与其他药理活性剂结合。
• Probe for mass spectrometry of liquid sample
  申请人：——

  公开号：US20040142378A1

  公开（公告）日：2004-07-22

  Disclosed is a probe for mass spectrometry of liquid samples, which may effectively ionize the sample without adding a protic solvent to the mobile phase in the ionization method in mass spectrometry of liquid samples. The probe according to the present invention has a structure represented by the Formula [I]: R 2 -A-R  [I] (wherein R 1 represents an ionic functional group which becomes an ion in a solvent, R 2 represents a structure which can bind to other substance, and A represents an arbitrary spacer moiety).

  揭示了一种用于液体样品质谱的探针，可以在液体样品的质谱离子化方法中有效离子化样品，而无需向移动相中添加质子溶剂。根据本发明的探针具有以下式所表示的结构： R2-A-R [I] （其中R1代表在溶剂中成为离子的离子功能团，R2代表可以结合到其他物质的结构，A代表任意的间隔基团）。
• REAGENTS AND METHODS FOR REPLICATION, TRANSCRIPTION, AND TRANSLATION IN SEMI-SYNTHETIC ORGANISMS
  申请人：The Scripps Research Institute

  公开号：US20200392550A1

  公开（公告）日：2020-12-17

  Disclosed herein are compositions, methods, cells, engineered microorganisms, and kits for increasing the production of proteins or polypeptides comprising one or more unnatural amino acids. Further provided are compositions, cells, engineered microorganisms, and kits for increasing the retention of unnatural nucleic acids encoding the unnatural amino acids in an engineered cell, or semi-synthetic organism.

  本文揭示了一种用于增加含有一个或多个非天然氨基酸的蛋白质或多肽的生产的组合物、方法、细胞、工程微生物和试剂盒。此外，还提供了一种用于增加编码非天然氨基酸的非天然核酸在工程细胞或半合成生物体中的保留的组合物、细胞、工程微生物和试剂盒。
• INORGANIC-ORGANIC HYBRID COMPOUNDS INCLUDING ORGANIC PLATINUM-CONTAINING ANIONS, FOR USE IN MEDICINE
  申请人：Karlsruher Institut fur Technologie

  公开号：US20210292353A1

  公开（公告）日：2021-09-23

  The present invention relates to inorganic-organic hybrid compounds for use in medicine or for use as medication, consisting of an inorganic metal cation and an organic platinum-containing cytostatic anion, in particular also a cisplatin derivative.

  本发明涉及用于医学或作为药物使用的无机-有机杂化化合物，包括无机金属阳离子和含有铂的细胞静止阴离子，特别是顺铂衍生物。
• Broad specificity of human phosphoglycerate kinase for antiviral nucleoside analogs
  作者：Sarah Gallois-Montbrun、Abdesslem Faraj、Edward Seclaman、Jean-Pierre Sommadossi、Dominique Deville-Bonne、Michel Véron

  DOI：10.1016/j.bcp.2004.06.012

  日期：2004.11

  the activation of L-nucleoside analogs, a new class of anticancer and antiviral agents. J Biol Chem 2003;278:36726-32]. In the present work, we extended the enzymatic study of human PGK specificity to purine and pyrimidine nucleotide derivatives in both D- and L-configuration. Human PGK demonstrated catalytic efficiencies in the 10(4)-10(5)M(-1)s(-1) range for purine ribo-, deoxyribo- and dideoxyribonucleotide

  抗病毒治疗中使用的核苷类似物需要磷酸化为三磷酸对应物，才能在其细胞靶标上具有活性。最近报道了人磷酸甘油酸激酶（hPGK）参与胞苷L-核苷酸衍生物的磷酸化的最后步骤[Krishnan PGE，Lam W，Dutschman GE，Grill SP，Cheng YC。3-磷酸​​甘油酸激酶（一种糖酵解酶）在新型抗癌和抗病毒药物L-核苷类似物的激活中具有新作用。生物化学杂志2003； 278：36726-32]。在目前的工作中，我们将人PGK特异性的酶学研究扩展到了D-和L-构型的嘌呤和嘧啶核苷酸衍生物。人类PGK对嘌呤核糖，脱氧核糖和双脱氧核糖核苷酸衍生物的催化效率在10（4）-10（5）M（-1）s（-1）范围内，在D或L配置中。相反，它与天然嘧啶D-核苷酸（少于10（3）M（-1）s（-1））的活性差。嘧啶L对映体是有希望的针对B型肝炎的治疗类似物，其底物是其D对映体的2-25倍。人类PG