5-(1-hydroxyethyl)-2'-deoxycytidine | 1251467-95-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-(1-hydroxyethyl)-2'-deoxycytidine
• 英文别名: 4-amino-5-(1-hydroxyethyl)-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 1251467-95-4
• 化学式: C₁₁H₁₇N₃O₅
• 分子量: 271.273
• InChiKey: ZCVVFQXGFCOSOM-BLYALZSPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.7
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3',5'-(tertbutyldimethylsilyl)-5-(formyl)deoxycytidine 在 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 5-(1-hydroxyethyl)-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  合成 5-羟甲基胞嘧啶和 5-甲酰基胞嘧啶的新型衍生物作为表观遗传学的工具。

  摘要：

  在这项工作中，我们首次展示了新型 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 和 5-甲酰基胞嘧啶 (5fC) 衍生物的合成，它们可用作新兴的表观遗传学领域的工具，用于破译 TET 介导过程的化学生物学。

  DOI：

  10.3762/bjoc.10.2

文献信息

• DERIVATIZATION OF BIOMOLECULES BY COVALENT COUPLING OF NON-COFACTOR COMPOUNDS USING METHYLTRANSFERASES
  申请人：Biotechnologijos Institutas

  公开号：EP2414528A1

  公开（公告）日：2012-02-08
• US8822146B2
  申请人：——

  公开号：US8822146B2

  公开（公告）日：2014-09-02
• [EN] DERIVATIZATION OF BIOMOLECULES BY COVALENT COUPLING OF NON-COFACTOR COMPOUNDS USING METHYLTRANSFERASES<br/>[FR] DÉRIVATION DE BIOMOLÉCULES PAR COUPLAGE COVALENT DE COMPOSÉS NON-COFACTEURS À L'AIDE DE MÉTHYLTRANSFÉRASES
  申请人：BIOTECHNOLOGIJOS INST

  公开号：WO2010115846A1

  公开（公告）日：2010-10-14

  The present invention relates to a use of non-cofactor compounds, represented by formulas (I) or (II) wherein R and Z are independently selected from H, D, C1-C12-alkyl, preferably C1-C4- alkyl, alkenyl, alkinyl, phenyl or -LX, wherein X represents a functional group or a reporter group attached via a linker group L, and QH is selected from -SH, -SeH, - NHNH2 or -ONH2, for a targeted modification or derivatization of a biomolecule by covalent coupling to the biomolecule in the presence of a directing methyltransferase. Further development of the method of targeted modification and derivatization are the method for targeted labeling a biomolecule and method for detecting unmethylated target sites in a biomolecule comprising modification of the biomolecule according to the present invention.
• Synthesis of novel derivatives of 5-hydroxymethylcytosine and 5-formylcytosine as tools for epigenetics
  作者：Anna Chentsova、Era Kapourani、Athanassios Giannis

  DOI：10.3762/bjoc.10.2

  日期：——

  In this work we present for the first time the synthesis of novel 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) and 5-formylcytosine (5fC) derivatives that can be used as tools in the emerging field of epigenetics for deciphering chemical biology of TET-mediated processes.

  在这项工作中，我们首次展示了新型 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 和 5-甲酰基胞嘧啶 (5fC) 衍生物的合成，它们可用作新兴的表观遗传学领域的工具，用于破译 TET 介导过程的化学生物学。