N,N'-NH2-Abu-Hph-rhodamine 110 | 1140465-70-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N,N'-NH2-Abu-Hph-rhodamine 110
• 英文别名: (H2N-Abu-Hph)2-Rd；(NH2-aminobutyric-homophenylalanine)2-rhodamine；N,N'-NH2-Abu-Hph-rhodamine110；(2S)-2-[[(2S)-2-aminobutanoyl]amino]-N-[6'-[[(2S)-2-[[(2S)-2-aminobutanoyl]amino]-4-phenylbutanoyl]amino]-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-3'-yl]-4-phenylbutanamide
• CAS: 1140465-70-8
• 化学式: C₄₈H₅₀N₆O₇
• 分子量: 822.961
• InChiKey: OKEPMBGGEDSSFJ-YKKXUYLKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.9
• 重原子数：
  61
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  204
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N,N'-Boc-Abu-Hph-rhodamine 110 、 三氟乙酸 以 1,1-二氯乙烷 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N,N'-NH2-Abu-Hph-rhodamine 110
  参考文献：
  名称：

  Substrate optimization for monitoring cathepsin C activity in live cells

  摘要：

  A series of peptidic fluorogenic substrates were synthesized to develop a flow cytometry assay (FACS) to monitor the proteolytic activity of cathepsin C in live cells. Of the 16 substrates tested, (NH2-aminobutyric-homophenylalanine)(2)-rhodamine demonstrated the best reactivity and selectivity profile in the FACS assay using the B721 human B-lymphoblastoid cell line. The resulting FACS assay was validated through correlation of the IC50 values with a competitive radiolabeling assay against a series of small molecule inhibitors of cathepsin C. (C) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2008.02.002