(R)-3-(((allyloxy)carbonyl)amino)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoic acid | 179251-60-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (R)-3-(((allyloxy)carbonyl)amino)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoic acid
• 英文别名: Boc-D-dap(aloc)-OH；(2R)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-3-(prop-2-enoxycarbonylamino)propanoic acid
• CAS: 179251-60-6
• 化学式: C₁₂H₂₀N₂O₆
• 分子量: 288.301
• InChiKey: AUPOSBLDRPESJX-MRVPVSSYSA-N

物化性质

• 沸点：
  470.5±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.194±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  114
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-3-(((allyloxy)carbonyl)amino)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoic acid 在 四(三苯基膦)钯 、 potassium carbonate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 methyl 2-((4S,7R)-7-(aminomethyl)-4-(dimethylcarbamoyl)-11,11-dimethyl-6,9-dioxo-10-oxa-2-thia-5,8-diazadodecyl)benzoate
  参考文献：
  名称：

  在优化 Keap1–Nrf2 蛋白-蛋白相互作用的大环抑制剂时揭示结合位点水合和柔韧性的重要性

  摘要：

  通过抑制与其负调节因子 Keap1 的相互作用来上调转录因子 Nrf2 构成了治疗由氧化应激引起的疾病的机会。我们报告了从天然产物衍生的大环铅中获得的一系列结构独特的纳摩尔级 Keap1 抑制剂。对先导化合物的构效关系进行初步探索，然后进行结构导向优化，使抑制效力提高了 100 倍。纳摩尔抑制剂的大环核心定位三个药效团单元，用于与 Keap1 的关键残基（包括 R415、R483 和 Y572）进行有效相互作用。配体优化导致配位水分子从 Keap1 结合位点移位，并显着改变热力学曲线。此外，R415 和 R483 的微小重组伴随着配体之间亲和力的重大差异。因此，本研究表明在设计高亲和力配体时考虑 Keap1 结合位点的水合作用和灵活性的重要性。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c01975
• 作为产物：
  描述：

  丁氧羰基-D-二氨基二酸羟基 、 氯甲酸烯丙酯 在 potassium carbonate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 16.0h， 以85%的产率得到(R)-3-(((allyloxy)carbonyl)amino)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoic acid
  参考文献：
  名称：

  在优化 Keap1–Nrf2 蛋白-蛋白相互作用的大环抑制剂时揭示结合位点水合和柔韧性的重要性

  摘要：

  通过抑制与其负调节因子 Keap1 的相互作用来上调转录因子 Nrf2 构成了治疗由氧化应激引起的疾病的机会。我们报告了从天然产物衍生的大环铅中获得的一系列结构独特的纳摩尔级 Keap1 抑制剂。对先导化合物的构效关系进行初步探索，然后进行结构导向优化，使抑制效力提高了 100 倍。纳摩尔抑制剂的大环核心定位三个药效团单元，用于与 Keap1 的关键残基（包括 R415、R483 和 Y572）进行有效相互作用。配体优化导致配位水分子从 Keap1 结合位点移位，并显着改变热力学曲线。此外，R415 和 R483 的微小重组伴随着配体之间亲和力的重大差异。因此，本研究表明在设计高亲和力配体时考虑 Keap1 结合位点的水合作用和灵活性的重要性。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c01975

文献信息

• Importance of Binding Site Hydration and Flexibility Revealed When Optimizing a Macrocyclic Inhibitor of the Keap1–Nrf2 Protein–Protein Interaction
  作者：Fabio Begnini、Stefan Geschwindner、Patrik Johansson、Lisa Wissler、Richard J. Lewis、Emma Danelius、Andreas Luttens、Pierre Matricon、Jens Carlsson、Stijn Lenders、Beate König、Anna Friedel、Peter Sjö、Stefan Schiesser、Jan Kihlberg

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c01975

  日期：2022.2.24

  Upregulation of the transcription factor Nrf2 by inhibition of the interaction with its negative regulator Keap1 constitutes an opportunity for the treatment of disease caused by oxidative stress. We report a structurally unique series of nanomolar Keap1 inhibitors obtained from a natural product-derived macrocyclic lead. Initial exploration of the structure-activity relationship of the lead, followed

  通过抑制与其负调节因子 Keap1 的相互作用来上调转录因子 Nrf2 构成了治疗由氧化应激引起的疾病的机会。我们报告了从天然产物衍生的大环铅中获得的一系列结构独特的纳摩尔级 Keap1 抑制剂。对先导化合物的构效关系进行初步探索，然后进行结构导向优化，使抑制效力提高了 100 倍。纳摩尔抑制剂的大环核心定位三个药效团单元，用于与 Keap1 的关键残基（包括 R415、R483 和 Y572）进行有效相互作用。配体优化导致配位水分子从 Keap1 结合位点移位，并显着改变热力学曲线。此外，R415 和 R483 的微小重组伴随着配体之间亲和力的重大差异。因此，本研究表明在设计高亲和力配体时考虑 Keap1 结合位点的水合作用和灵活性的重要性。