三磷酸吉西他滨 | 110988-86-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 三磷酸吉西他滨
• 英文名称: gemcitabine triphosphate
• 英文别名: dFdCTP；2',2'-difluorodeoxycytidine 5'-triphosphate；gemcitabine 5'-triphosphate；[[(2R,3R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-4,4-difluoro-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 110988-86-8
• 化学式: C₉H₁₄F₂N₃O₁₃P₃
• 分子量: 503.141
• InChiKey: YMOXEIOKAJSRQX-QPPQHZFASA-N

物化性质

• 沸点：
  797.7±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.43±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  甲醇（微溶）、水（微溶）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.2
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  248
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 tris(tetra-n-butylammonium) hydrogen pyrophosphate 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 0.12h， 生成 三磷酸吉西他滨
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of gemcitabine triphosphate (dFdCTP) as a tris(triethylammonium) salt

  摘要：

  First synthesis of gemcitabine triphosphate (dFdCTP) as a tris(triethylammonium) salt is reported. Published by Elsevier Ltd.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2008.03.063

文献信息

• Inactivation of <i>Lactobacillus leichmannii</i> Ribonucleotide Reductase by 2′,2′-Difluoro-2′-deoxycytidine 5′-Triphosphate: Covalent Modification
  作者：Gregory J. S. Lohman、JoAnne Stubbe

  DOI：10.1021/bi902132u

  日期：2010.2.23

  nucleoside triphosphates to deoxynucleotides and is rapidly (<30 s) inactivated by 1 equiv of 2′,2′-difluoro-2′-deoxycytidine 5′-triphosphate (F2CTP). [1′-3H]- and [5-3H]F2CTP were synthesized and used independently to inactivate RNR. Sephadex G-50 chromatography of the inactivation mixture revealed that 0.47 equiv of a sugar was covalently bound to RNR and that 0.71 equiv of cytosine was released. Alternatively

  来自莱希曼乳杆菌的核糖核苷酸还原酶 (RNR) 是一种 76 kDa 单体，使用腺苷钴胺素 (AdoCbl) 作为辅助因子，催化核苷三磷酸转化为脱氧核苷酸，并被 1 当量的 2',2'-二氟快速（<30 秒）灭活-2'-脱氧胞苷5'-三磷酸（F 2 CTP）。合成了[1'- 3 H]-和[5- 3 H]F 2 CTP并独立用于灭活RNR。灭活混合物的 Sephadex G-50 色谱显示，0.47 当量的糖与 RNR 共价结合，并且释放了 0.71 当量的胞嘧啶。或者，在未煮沸的情况下通过 SDS-PAGE 对失活的 RNR 进行分析，导致 33% 的 RNR 迁移为 110 kDa 蛋白质。用 [1'- 3 H]F 2 CTP 和 [1'- 2 H]F 2 CTP的混合物灭活 RNR ，然后用 NaBH 4还原，用碘乙酰胺烷基化，胰蛋白酶消化，并对所得肽进行 HPLC 分离通过MALDI-TOF质谱(MS)分离鉴定出RNR
• [EN] NOVEL PHOSPHOROUS (V)-BASED REAGENTS, PROCESSES FOR THE PREPARATION THEREOF, AND THEIR USE IN MAKING STEREO-DEFINED ORGANOPHOSHOROUS (V) COMPOUNDS<br/>[FR] NOUVEAUX RÉACTIFS À BASE DE PHOSPHORE (V), LEURS PROCÉDÉS DE PRÉPARATION ET LEUR UTILISATION DANS LA FABRICATION DE COMPOSÉS ORGANOPHOSHOREUX (V) STÉRÉODÉFINIS
  申请人：BRISTOL MYERS SQUIBB CO

  公开号：WO2019200273A1

  公开（公告）日：2019-10-17

  The present invention relates to novel phosphorous (V) (P(V)) reagents, methods for preparing thereof, and methods for preparing organophosphorous (V) compounds by using the novel reagents.

  本发明涉及新型磷（V）（P(V)）试剂，其制备方法以及利用这种新型试剂制备有机磷（V）化合物的方法。
• Facile Small Scale Synthesis of Nucleoside 5′-Phosphate Mixtures
  作者：Robert S. Jansen、Hilde Rosing、Jan HM Schellens、Jos H. Beijnen

  DOI：10.1080/15257770903451546

  日期：2010.1

  phosphorylate small amounts of nucleosides (0.05 μmol) into mixtures of their 5′-mono-, di-, and triphosphates in a one-pot reaction. The nucleosides were first converted into their dichlorophosphates using a large excess (15–18 equivalents) of phosphorous oxychloride in trimethylphosphate. The large excess resulted in good dichlorophosphate yields (46–76%) for the four nucleosides tested. Upon the addition

  我们提出了一种简便的方法，可以在一锅反应中将少量的核苷（0.05μmol）磷酸化为5'-单-，二-和三磷酸的混合物。首先使用磷酸三甲酯中大量过量的氯氧化磷（15-18当量）将核苷转化为其二氯磷酸酯。大量过量导致所测试的四种核苷的二氯磷酸酯收率良好（46–76％）。在将磷酸三丁铵与另外的三丁胺（均20当量）一起加入后，将二氯磷酸酯转化为含有等量的单磷酸酯，二磷酸酯和三磷酸酯的混合物。所提出的方法已成功地应用于合成稳定同位素标记的核苷酸的混合物，该混合物可用作定量质谱分析中的内标。
• New Mechanism of Gemcitabine and Its Phosphates: DNA Polymerization Disruption via 3′–5′ Exonuclease Inhibition
  作者：Shuzhang Yang、Danyan Luo、Na Li、Chuncheng Li、Shuo Tang、Zhen Huang

  DOI：10.1021/acs.biochem.0c00543

  日期：2020.11.17

  Gemcitabine (dFdC), a modified deoxycytidine (dC) widely used in tumor treatment, is a prodrug that is phosphorylated to generate mono-, di-, and triphosphates. The triphosphate (dFdCTP) is incorporated into DNA to terminate DNA synthesis in cancer. Some incorporated dFdC nucleotides can be partially removed by the 3′–5′ exonuclease activity, namely its editing function, and the others escape the editing

  吉西他滨（dFdC）是一种广泛用于肿瘤治疗的修饰的脱氧胞苷（dC），是一种被磷酸化以生成一磷酸，二磷酸和三磷酸的前药。将三磷酸酯（dFdCTP）掺入DNA以终止癌症中的DNA合成。一些掺入的dFdC核苷酸可以通过3'-5'核酸外切酶活性（即其编辑功能）部分除去，而其他的则可以逃避编辑。但是，尚不清楚dFdC是否有逃逸编辑的有效机制。我们首先发现，与dFdC不同，其单磷酸，二磷酸和三磷酸可以抑制DNA聚合酶I的3'–5'核酸外切酶，抑制编辑并允许有效的转义机制，而其聚合酶活性并未受到明显影响。因此，这些磷酸盐可防止去除掺入的dFdC残留物，从而积极阻断DNA的延伸和合成。这些磷酸盐的抑制效率遵循吉西他滨的单磷酸，二磷酸和三磷酸的增加顺序（dFdC
• Nucleotides for the treatment of liver cancer
  申请人：IDENIX PHARMACEUTICALS LLC

  公开号：US10030044B2

  公开（公告）日：2018-07-24

  Provided herein are compounds, compositions and methods for the treatment of liver cancer such as hepatocellular carcinoma, cholangiocarcinoma, or biliary tract cancer. In certain embodiments, compounds and compositions of nucleoside derivatives are disclosed, which can be administered either alone or in combination with other anti-cancer agents. In certain embodiments, the compounds are nucleoside analogs of Formula I: (I); or a pharmaceutically acceptable salt thereof, wherein Base, Z1, Z2, Z3, Z4, V, W, X, Ar, R1 and R2 are as described herein.

  本文提供了用于治疗肝癌（如肝细胞癌、胆管癌或胆道癌）的化合物、组合物和方法。 在某些实施方案中，公开了核苷衍生物的化合物和组合物，可单独或与其他抗癌剂联合使用。 在某些实施方案中，所述化合物为式I的核苷类似物：(I)；或其药学上可接受的盐，其中Base、Z1、Z2、Z3、Z4、V、W、X、Ar、R1和R2如本文所述。