4-[3-(Trifluoromethyl)diazirin-3-yl]benzoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 4-[3-(Trifluoromethyl)diazirin-3-yl]benzoate
• 化学式: C₉H₄F₃N₂O₂
• 分子量: 229.138
• InChiKey: CZPAJVBVULSLGG-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  64.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-[3-(Trifluoromethyl)diazirin-3-yl]benzoate 在 Escherichia coli outer membrane porin protein OmpF 、 ammonium acetate 、 辛基-D-吡喃葡萄糖苷 作用下， 以 水 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  碳足迹显示多聚体跨膜蛋白的结合界面。

  摘要：

  绘制跨膜蛋白之间的相互作用位点是结构生物学中的关键挑战。在这项研究中，开发了卡宾足迹法，并将其应用于识别溶解在胶束中的三聚体完整膜蛋白OmpF的界面位点。基于二嗪胺的足迹探针可被胶束有效隔离，并掺入胶束中，从而在349 nm辐射下有效标记蛋白质的跨膜区域。三聚体亚基之间与蛋白质-蛋白质相互作用相关的区域仍未标记，从而揭示了它们的位置。

  DOI：

  10.1002/anie.201708254

文献信息

• Carbene Footprinting Reveals Binding Interfaces of a Multimeric Membrane-Spanning Protein
  作者：Lucio Manzi、Andrew S. Barrow、Jonathan T. S. Hopper、Renata Kaminska、Colin Kleanthous、Carol V. Robinson、John E. Moses、Neil J. Oldham

  DOI：10.1002/anie.201708254

  日期：2017.11.20

  Mapping the interaction sites between membrane‐spanning proteins is a key challenge in structural biology. In this study a carbene‐footprinting approach was developed and applied to identify the interfacial sites of a trimeric, integral membrane protein, OmpF, solubilised in micelles. The diazirine‐based footprinting probe is effectively sequestered by, and incorporated into, the micelles, thus leading

  绘制跨膜蛋白之间的相互作用位点是结构生物学中的关键挑战。在这项研究中，开发了卡宾足迹法，并将其应用于识别溶解在胶束中的三聚体完整膜蛋白OmpF的界面位点。基于二嗪胺的足迹探针可被胶束有效隔离，并掺入胶束中，从而在349 nm辐射下有效标记蛋白质的跨膜区域。三聚体亚基之间与蛋白质-蛋白质相互作用相关的区域仍未标记，从而揭示了它们的位置。