rhodopeptin C1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: rhodopeptin C1
• 英文别名: (3S,6S,13R)-6-(3-aminopropyl)-13-(7-methylnonyl)-3-propan-2-yl-1,4,7,10-tetrazacyclotridecane-2,5,8,11-tetrone
• 化学式: C₂₅H₄₇N₅O₄
• 分子量: 481.679
• InChiKey: BCORRXOGBNOQQU-KOUBEBKOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.84
• 拓扑面积：
  142
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  rhodopeptin C1 在 盐酸 作用下， 反应 24.0h， 生成 3-amino-10-methyldodecanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Rhodopeptins, Novel Cyclic Tetrapeptides with Antifungal Activities from Rhodococcus sp. II. Structure Elucidation.

  摘要：

  根据对完整分子及其酸水解物的物理化学分析，确定了新型抗真菌肽--荷多肽的结构。经测定，根瘤肽 Cl、C2、C3、C4 和 B5 的结构为环状（-Gly-L-Orn-L-Val-3-amino-10-methyldodecanoyl-）、环状（-Gly-L-Orn-L-Ile-3-amino-10-methyldodecanoyl-）、环状（-Gly-L-Orn-L-Ile-3-amino-10-methyldodecanoyl-）和环状（-Gly-L-Orn-L-Val-3-amino-10-methyldodecanoyl-）、分别是 cyclo (-Gly-L-Orn-L-Val-3-amino-12-methyltridecanoyl-), cyclo (-Gly-L-Orn-L-Val-3-amino-12-methyltetradecanoyl-) 和 cyclo (-Gly-L-Lys-L-Val-3-amino-13-methyltetradecanoyl-)。它们是含有亲脂性β-氨基酸的新型环状四肽。

  DOI：

  10.7164/antibiotics.52.700

文献信息

• Rhodopeptins, Novel Cyclic Tetrapeptides with Antifungal Activities from Rhodococcus sp. II. Structure Elucidation.
  作者：HIROYUKI CHIBA、HITOSI AGEMATU、KAZUYUKI DOBASHI、TAKEO YOSHIOKA

  DOI：10.7164/antibiotics.52.700

  日期：——

  The structures of rhodopeptins, novel antifungal peptides, were determined on the basis of physico-chemical analyses of the intact molecules and their acid hydrolysates. The structures of rhodopeptins Cl, C2, C3, C4 and B5 were determined to be cyclo (-Gly-L-Orn-L-Val-3-amino-10-methyldodecanoyl-), cyclo (-Gly-L-Orn-L-Ile-3-amino-10-methyldodecanoyl-), cyclo (-Gly-L-Orn-L-Val-3-amino-12-methyltridecanoyl-), cyclo (-Gly-L-Orn-L-Val-3 -amino-12-methyltetradecanoyl-) and cyclo (-Gly-L-Lys-L-Val-3-amino-13-methyltetradecanoyl-), respectively. They are novel cyclic tetrapeptides containing a lipophilic β-amino acid.

  根据对完整分子及其酸水解物的物理化学分析，确定了新型抗真菌肽--荷多肽的结构。经测定，根瘤肽 Cl、C2、C3、C4 和 B5 的结构为环状（-Gly-L-Orn-L-Val-3-amino-10-methyldodecanoyl-）、环状（-Gly-L-Orn-L-Ile-3-amino-10-methyldodecanoyl-）、环状（-Gly-L-Orn-L-Ile-3-amino-10-methyldodecanoyl-）和环状（-Gly-L-Orn-L-Val-3-amino-10-methyldodecanoyl-）、分别是 cyclo (-Gly-L-Orn-L-Val-3-amino-12-methyltridecanoyl-), cyclo (-Gly-L-Orn-L-Val-3-amino-12-methyltetradecanoyl-) 和 cyclo (-Gly-L-Lys-L-Val-3-amino-13-methyltetradecanoyl-)。它们是含有亲脂性β-氨基酸的新型环状四肽。