The effects of varying the substituent and DNA sequence on the stability of 4-substituted DNA-naphthalimide complexes
作者:Elizabeth A. Jolley、Laura K.E. Hardebeck、Yi Ren、Miranda S. Adams、Michael Lewis、Brent M. Znosko
DOI:10.1016/j.bpc.2018.04.008
日期:2018.8
the DNA-intercalator complexes, resulting in ΔTm values. The ΔTm values demonstrated that the substituents on the intercalator affect the stability of the DNA-intercalator complex. From the results of this study and comparison to results from previous work, we conclude that the substituent type and position on the core intercalator molecule affect the stability of the complex it forms with DNA.
DNA双链体通过许多相互作用而稳定,其中之一是核酸碱基之间的堆叠相互作用。这些相互作用对于设计与DNA结合的小分子很有用。萘二甲酰亚胺嵌入剂已被证明是有价值的抗癌剂,可堆叠在DNA碱基之间并表现出稳定作用。仍然需要设计嵌入剂,它们将表现出这些稳定作用,同时对DNA结合更具选择性。这项工作研究具有不同官能团的4-取代的萘二甲酰亚胺及其与核酸双链体的相互作用。结合的方式通过波长扫描,圆二色性和粘度测量来确定。使用光学熔融实验来测量样品的吸光度随温度的变化。从DNA-嵌入剂复合物得到的Tm值减去从DNA双链体得到的Tm值,得到ΔTm值。ΔTm值表明嵌入剂上的取代基影响DNA-嵌入剂复合物的稳定性。从这项研究的结果以及与先前工作的比较,我们得出结论,核心嵌入剂分子上的取代基类型和位置会影响其与DNA形成的复合物的稳定性。