1-<2',3'-Dideoxy-3'-C-hydroxymethyl-β-D-threo-pentofuranosyl>cytosine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-<2',3'-Dideoxy-3'-C-hydroxymethyl-β-D-threo-pentofuranosyl>cytosine
• 英文别名: 1-(2',3'-dideoxy-3'-hydroxymethyl-β-D-threo-pentofuranosyl)cytosine；1-(2',3'-Dideoxy-3'-C-hydroxymethyl-β-D-threo-pentofuranosyl)cytosine；4-amino-1-[(2R,4S,5S)-4,5-bis(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• 化学式: C₁₀H₁₅N₃O₄
• 分子量: 241.247
• InChiKey: WZGBNAXNHRMYLG-LKEWCRSYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.1
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-<5'-O-(MMTr)-2',3'-dideoxy-3'-(S)-hydroxymethyl-3'-nitro-β-D-pentofuranosyl>uracil 在 吡啶 、 三乙烯二胺 、 4-二甲氨基吡啶 、 2,4,6-三甲基苯磺酰氯 、 2-(2-cyanopropan-2-yldiazenyl)-2-methylpropanenitrile 、 氨 、 三正丁基氢锡 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 苯 为溶剂， 反应 78.5h， 生成 1-<2',3'-Dideoxy-3'-C-hydroxymethyl-β-D-threo-pentofuranosyl>cytosine
  参考文献：
  名称：

  3'-取代核苷的新合成

  摘要：

  2'，3'-二脱氧-3'-硝基胸苷1或-尿苷2的C-3'与多聚甲醛，甲基乙烯基酮，丙烯腈和丙酸乙酯的碱催化加成反应生成了各种1-（2'， 3′-二脱氧-3′-取代的3′-硝基-β-D-戊呋喃糖基）嘧啶核苷3 – 26 [α-取代（主要）；β-取代（次要）]。反应中形成的产物的立体化学清楚地表明，C3'处的初始碳负离子优先从糖环的α面攻击缺电子的试剂。随后，从3'-硝基3，14，17，22和25是由布的作用除去3 SNH和AIBN，得到3'-取代的核苷27 – 44 [苏式（主要）和赤式（次要）]，表明中间的3'-碳自由基优先从α面提取氢原子。通过NMR光谱的详细结构分析确定了碱催化的加成反应和自由基促进的脱硝反应的产物的立体化学。本文介绍的结果是在核苷糖基部分的硝基官能团的α-碳上使用碱催化加成反应制备-支链核苷的第一个实例。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)81883-4

文献信息

• Synthesis of 2′,3′-dideoxy-3′-hydroxymethylcytidine; a unique antiviral nucleoside
  作者：Margaret M. Faul、Bret E. Huff、Steven E. Dunlap、Scott A. Frank、James E. Fritz、Stephen W. Kaldor、Michael E. LeTourneau、Michael A. Staszak、Jeffrey A. Ward、John A. Werner、Leonard L. Winneroski

  DOI：10.1016/s0040-4020(97)00500-0

  日期：1997.6

  The synthesis of 2′,3′-dideoxy-3′-hydroxymethylcytidine 1 was accomplished using two different approaches. First, uridine and cytidine were used to prepare the key intermediate epoxides 15 and 31 which were opened with cyanide, deoxygenated by elimination to vinyl nitriles 17 and 36, and reduced by 1,4 hydride addition to the saturated nitriles 18 and 37. Secondly, a novel Rh-catalyzed hydroformylation

  2'，3'-二脱氧-3'-羟甲基胞苷1的合成使用两种不同的方法完成。首先，尿苷和胞苷用于制备关键的中间环氧化物15和31，其用氰化物打开，通过消除成乙烯基腈17和36而脱氧，并通过向饱和腈18和37中加1,4氢化物还原。其次，使用新颖的Rh催化的2′，3′-二氢二氢-2′，3′-二脱氧胞苷46的加氢甲酰化反应以四个步骤制备1。还讨论了尝试使用2'-脱氧尿苷和2'-脱氧胞苷制备1。