1-[N-(3-t-butoxycarbonylaminopropyl)carbamoyl]-5-fluorouracil

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-[N-(3-t-butoxycarbonylaminopropyl)carbamoyl]-5-fluorouracil
• 英文别名: tert-butyl N-[3-[(5-fluoro-2,4-dioxopyrimidine-1-carbonyl)amino]propyl]carbamate
• 化学式: C₁₃H₁₉FN₄O₅
• 分子量: 330.316
• InChiKey: JVAPPACYBYCPSW-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[N-(3-t-butoxycarbonylaminopropyl)carbamoyl]-5-fluorouracil 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 N-(3-(5-fluoro-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-1-carboxamido)propyl)-1H-indole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  通过卡莫氟结构引导的命中到先导优化发现抗病毒 SARS-CoV-2 主要蛋白酶抑制剂

  摘要：

  严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 主要蛋白酶 (M pro ) 已成为开发针对 COVID-19 感染的抗 SARS-CoV-2 药物的目标，因为 M pro处理必需的病毒多蛋白并发挥关键作用在 SARS-CoV-2 复制中的作用。在这项研究中，我们报告了源自卡莫氟的新型 SARS-CoV-2 M pro抑制剂的开发，卡莫氟是一种先前鉴定的化合物，作为 SARS-CoV-2 M pro的共价抑制剂显示出中等效力。为了采用结构引导的药物设计策略，首先通过对接模拟预测了卡莫氟在 M pro催化活性位点上的假定完整结合模式。基于预测的结合模式，对一系列旨在占据M pro底物结合区域的卡莫氟衍生物进行了构效关系分析。结果， 发现了一种基于吲哚的衍生物，推测与 S4 结合袋相互作用， 21b (IC 50 = 1.5 ± 0.1 μM)。通过结合对接模拟、自由能扰动计算和子口

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2023.115720
• 作为产物：
  描述：

  N-BOC-GAMMA-氨基丁酸 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 、 氯甲酸甲酯 作用下， 以 丙酮 、 甲苯 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 1-[N-(3-t-butoxycarbonylaminopropyl)carbamoyl]-5-fluorouracil
  参考文献：
  名称：

  通过卡莫氟结构引导的命中到先导优化发现抗病毒 SARS-CoV-2 主要蛋白酶抑制剂

  摘要：

  严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 主要蛋白酶 (M pro ) 已成为开发针对 COVID-19 感染的抗 SARS-CoV-2 药物的目标，因为 M pro处理必需的病毒多蛋白并发挥关键作用在 SARS-CoV-2 复制中的作用。在这项研究中，我们报告了源自卡莫氟的新型 SARS-CoV-2 M pro抑制剂的开发，卡莫氟是一种先前鉴定的化合物，作为 SARS-CoV-2 M pro的共价抑制剂显示出中等效力。为了采用结构引导的药物设计策略，首先通过对接模拟预测了卡莫氟在 M pro催化活性位点上的假定完整结合模式。基于预测的结合模式，对一系列旨在占据M pro底物结合区域的卡莫氟衍生物进行了构效关系分析。结果， 发现了一种基于吲哚的衍生物，推测与 S4 结合袋相互作用， 21b (IC 50 = 1.5 ± 0.1 μM)。通过结合对接模拟、自由能扰动计算和子口

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2023.115720

文献信息

• 5-Fluorouracil derivatives, and their pharmaceutical compositions
  申请人：Fujisawa Pharmaceutical Company, Ltd.

  公开号：US04349552A1

  公开（公告）日：1982-09-14

  A compound of the formula: ##STR1## wherein R is a bridged alicyclic group selected from the group consisting of norbornyl, norbornenyl, bicyclo[2,2,2]-heptyl and adamantyl optionally substituted by at least one substituent selected from the group consisting of lower alkyl, carboxy, lower alkoxycarbonyl, alkylidenedioxy, N,N-di(lower)alkylcarbamoyl, amino, loweralkoxycarbonylamino and halogen. The present compound is useful in the therapeutic treatment of cancer in human beings and animals.

  分子式为：##STR1## 其中R是从诺博烯基，诺博烯基，双环[2,2,2]-庚烷基和金刚烷基中选择的桥式脂环基，可以选择性地被至少一种取代基所取代，所述取代基选择自下列群体：低碳基，羧基，低碳基氧羰基，烷基二氧基，N，N-二（低）烷基氨基甲酰基，氨基，低碳基氧羰基氨基和卤素。该化合物在治疗人类和动物的癌症中有用。
• 5-Fluorouracil derivatives, preparation thereof and their pharmaceutical compositions
  申请人：FUJISAWA PHARMACEUTICAL CO., LTD.

  公开号：EP0010941A1

  公开（公告）日：1980-05-14

  The present invention provides compounds of the general formula:- wherein R is an optionally substituted bridged alicyclic radical or a substituted lower alkyl radical, the substituent being an optionally substituted bridged alicyclic group, an amino, protected amino, lower alkoxy, acyl, lower alkylthio, cyano(lower)alkylthio, arylthio or optionally substituted heterocyclic radical or a carboxy and esterified carboxy group, with the proviso, that when the substituent is a carboxy or esterified carboxy group then the lower alkyl radical contains 3 to 6 carbon atoms; or an unsubstituted or substituted lower alkenyl radical, the substituent being an optionally substituted bridged alicyclic group, an optionally substituted aryl radical or an optionally substituted heterocyclic radical; or a halophenyl radical; or an optionally substituted heterocyclic radical. 'The present invention also provides processes for the preparation of these compounds and pharmaceutical composition containing them. Furthermore, the present invention is concerned with a method of treating cancer which comprises administering these compounds to mammals suffering from cancer.

  本发明提供通式为：- 的化合物。 其中 R 是任选取代的桥式脂环基或取代的低级烷基，取代基是任选取代的桥式脂环基、氨基、保护氨基、低级烷氧基、酰基、低级烷硫基、氰基（低级）烷硫基、芳硫基或任选取代的杂环基或羧基和酯化羧基，但条件是当取代基是羧基或酯化羧基时，低级烷基含有 3 至 6 个碳原子；或未取代或取代的低级烯基，取代基为任选取代的桥式脂环基、任选取代的芳基或任选取代的杂环基；或卤代苯基；或任选取代的杂环基。 '本发明还提供了制备这些化合物和含有这些化合物的药物组合物的工艺。此外，本发明还涉及一种治疗癌症的方法，该方法包括对患有癌症的哺乳动物施用这些化合物。
• US4349552A
  申请人：——

  公开号：US4349552A

  公开（公告）日：1982-09-14
• Discovery of antiviral SARS-CoV-2 main protease inhibitors by structure-guided hit-to-lead optimization of carmofur
  作者：Koon Mook Kang、Yejin Jang、Sang Soo Lee、Mi Sun Jin、Chang-Duk Jun、Meehyein Kim、Yong-Chul Kim

  DOI：10.1016/j.ejmech.2023.115720

  日期：2023.11

  result, an indole-based derivative, speculated to interact with the S4 binding pocket, 21b (IC50 = 1.5 ± 0.1 μM) was discovered. Its structure was further modified and evaluated in silico by combining docking simulation, free energy perturbation calculation and subpocket interaction analysis to optimize the interactions at the S2 and S4 binding pockets. Among the newly designed novel derivatives, 21h

  严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 主要蛋白酶 (M pro ) 已成为开发针对 COVID-19 感染的抗 SARS-CoV-2 药物的目标，因为 M pro处理必需的病毒多蛋白并发挥关键作用在 SARS-CoV-2 复制中的作用。在这项研究中，我们报告了源自卡莫氟的新型 SARS-CoV-2 M pro抑制剂的开发，卡莫氟是一种先前鉴定的化合物，作为 SARS-CoV-2 M pro的共价抑制剂显示出中等效力。为了采用结构引导的药物设计策略，首先通过对接模拟预测了卡莫氟在 M pro催化活性位点上的假定完整结合模式。基于预测的结合模式，对一系列旨在占据M pro底物结合区域的卡莫氟衍生物进行了构效关系分析。结果， 发现了一种基于吲哚的衍生物，推测与 S4 结合袋相互作用， 21b (IC 50 = 1.5 ± 0.1 μM)。通过结合对接模拟、自由能扰动计算和子口