Machine learning prioritizes synthesis of primaquine ureidoamides with high antimalarial activity and attenuated cytotoxicity
作者:Jurica Levatić、Kristina Pavić、Ivana Perković、Lidija Uzelac、Katja Ester、Marijeta Kralj、Marcel Kaiser、Matthias Rottmann、Fran Supek、Branka Zorc
DOI:10.1016/j.ejmech.2018.01.062
日期:2018.2
Primaquine (PQ) is a commonly used drug that can prevent the transmission of Plasmodium falciparum malaria, however toxicity limits its use. We prepared five groups of PQ derivatives: amides 1a-k, ureas 2a-k, semicarbazides 3a,b, acylsemicarbazides 4a-k and bis-ureas 5a-v, and evaluated them for antimalarial activity in vitro against the erythrocytic stage of P. falciparum NF54. Particular substituents
primaquine(PQ)是一种常用药物,可以预防恶性疟原虫疟疾的传播,但是毒性限制了它的使用。我们制备了五组PQ衍生物:酰胺1a-k,脲2a-k,氨基脲3a,b,酰基氨基脲4a-k和双脲5a-v,并评估了它们在体外对P红细胞阶段的抗疟活性。恶性肿瘤NF54。特定的取代基,例如三苯甲基(在2j和5r中)和甲氧基苯甲基(在3b和5v中))与良好的细胞毒性/活性比相关。为了将PQ衍生物的结构特征与抗血浆活性系统地联系起来,我们使用支持向量机机器学习方法进行了定量构效关系(QSAR)研究。这产生了一个高度准确的统计模型( 交叉验证中的R 2 = 0.776),该模型用于确定新的候选化合物的优先级。合成了七个新颖的PQ-脲基酰胺10a-g,并对其活性进行了评估,突出了衍生自对氯苯基甘氨酸的苯甲基脲基酰胺10e和10f。在人类细胞系上进行的进一步实验表明,10e和10f在体外具有比PQ低一个数量级