5-({[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}[3-carbamoylbenzyl]amino)pentanoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: 5-({[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}[3-carbamoylbenzyl]amino)pentanoic acid
• 英文别名: 5-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl-[(3-carbamoylphenyl)methyl]amino]pentanoic acid
• 化学式: C₂₃H₂₉N₇O₆
• 分子量: 499.527
• InChiKey: HBCURXCNASSDGN-VZKMNXCRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.6
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  203
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-(氯羰基)苯甲酸甲酯 在 重铬酸吡啶 、 二异丁基氢化铝 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 正己烷 、 二氯甲烷 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 5-({[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}[3-carbamoylbenzyl]amino)pentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  具有增强活性的烟酰胺N-甲基转移酶（NNMT）的双底物抑制剂。

  摘要：

  烟酰胺N-甲基转移酶（NNMT）催化烟酰胺的甲基化以形成N-甲基烟酰胺。NNMT的过度表达与多种疾病（包括许多癌症和代谢紊乱）有关，这表明NNMT作为潜在的治疗靶标具有重要作用。通过对先前在我们小组中开发的NNMT抑制剂的结构进行修饰，我们制备了多种抑制剂库来探测酶活性位点的不同区域。这项研究表明，旨在通过π-π堆积相互作用结合疏水烟酰胺结合口袋的萘部分的引入显着提高了双底物样NNMT抑制剂的活性（半数最大抑制浓度为1.41μM）。这些发现得到了等温滴定量热结合试验和模型研究的进一步支持。在本研究中鉴定出的最具活性的NNMT抑制剂对HSC-2人口腔癌细胞系的细胞增殖表现出剂量依赖性抑制作用。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b00413

文献信息

• Bisubstrate Inhibitors of Nicotinamide <i>N</i>-Methyltransferase (NNMT) with Enhanced Activity
  作者：Yongzhi Gao、Matthijs J. van Haren、Ed E. Moret、Johannes J. M. Rood、Davide Sartini、Alessia Salvucci、Monica Emanuelli、Pierrick Craveur、Nicolas Babault、Jian Jin、Nathaniel I. Martin

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00413

  日期：2019.7.25

  potential therapeutic target. By structural modification of a lead NNMT inhibitor previously developed in our group, we prepared a diverse library of inhibitors to probe the different regions of the enzyme's active site. This investigation revealed that incorporation of a naphthalene moiety, intended to bind the hydrophobic nicotinamide binding pocket via π-π stacking interactions, significantly increases

  烟酰胺N-甲基转移酶（NNMT）催化烟酰胺的甲基化以形成N-甲基烟酰胺。NNMT的过度表达与多种疾病（包括许多癌症和代谢紊乱）有关，这表明NNMT作为潜在的治疗靶标具有重要作用。通过对先前在我们小组中开发的NNMT抑制剂的结构进行修饰，我们制备了多种抑制剂库来探测酶活性位点的不同区域。这项研究表明，旨在通过π-π堆积相互作用结合疏水烟酰胺结合口袋的萘部分的引入显着提高了双底物样NNMT抑制剂的活性（半数最大抑制浓度为1.41μM）。这些发现得到了等温滴定量热结合试验和模型研究的进一步支持。在本研究中鉴定出的最具活性的NNMT抑制剂对HSC-2人口腔癌细胞系的细胞增殖表现出剂量依赖性抑制作用。