Small Molecule Sequestration of the Intrinsically Disordered Protein, p27Kip1, Within Soluble Oligomers
作者:Luigi I. Iconaru、Sourav Das、Amanda Nourse、Anang A. Shelat、Jian Zuo、Richard W. Kriwacki
DOI:10.1016/j.jmb.2021.167120
日期:2021.9
we previously discovered small, drug-like molecules that bind specifically, albeit weakly, to dynamic clusters of aromatic residues within p27Kip1 (p27), an archetypal disordered protein involved in cell cycle regulation. Here, using synthetic chemistry, NMR spectroscopy and other biophysical methods, we discovered elaborated analogs of our previously reported molecules with 30-fold increased affinity
表现出内在无序区域 (IDR) 的蛋白质在人类蛋白质组中普遍存在,并具有多种生物学功能,包括信号传导和调节。由于这些重要作用,内在无序蛋白质 (IDP) 的错误调节与无数人类疾病有关,包括神经退行性疾病和癌症。IDP 固有的灵活性限制了传统的基于结构的药物设计范式的适用性;因此,长期以来,国内流离失所者一直被认为是“不可吸毒的”。使用核磁共振波谱和其他方法,我们之前发现了小的药物样分子,它们与 p27 Kip1内的芳香族残基动态簇特异性结合,尽管很弱(p27),一种参与细胞周期调节的典型无序蛋白。在这里,使用合成化学、NMR 光谱学和其他生物物理方法,我们发现了我们先前报道的分子的精细类似物,其对 p27 的亲和力增加了 30 倍(表观 K d = 57 ± 19 μM)。引人注目的是,使用分析超速离心方法,我们发现亲和力最高的化合物导致 p27 形成可溶的、无序的低聚物。基于这些观察,