benzyloxycarbonyltryptophan sec-butyl amide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: benzyloxycarbonyltryptophan sec-butyl amide
• 英文别名: benzyl N-[1-(butan-2-ylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl]carbamate
• 化学式: C₂₃H₂₇N₃O₃
• 分子量: 393.486
• InChiKey: CXETXBXHSOPDLH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  83.2
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyloxycarbonyltryptophan sec-butyl amide 在 10% Pd/C 、 ammonium formate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 0.5h， 以75%的产率得到tryptophan sec-butyl amide
  参考文献：
  名称：

  Lavendamycin抗肿瘤剂：基于结构的设计，合成和NAD（P）H：醌氧化还原酶1（NQO1）模型验证，以及分子对接和生物学研究。

  摘要：

  已开发了基于1H69晶体结构的NAD（P）H：醌氧化还原酶1（NQO1）活性位点的计算机模型，以促进NQO1指导的拉达霉素抗肿瘤剂的开发。利用基于结构的设计标准将拉文霉素类似物设计为NQO1底物。使用该模型进行了计算对接研究，以预测NQO1底物特异性。通过Pictet-Spengler缩合反应合成了设计的N-酰基十一碳金霉素酯和酰胺。用重组人NQO1和人结肠腺癌细胞（缺乏NQO1的BE和富含NQO1的BE-NQ）对类似物进行代谢和细胞毒性研究。发现对接物和生物学数据是相关的，其中类似物12、13、14、15和16分别被分类为好，差，差，差和好NQO1底物。我们的结果证明配体设计标准是有效的，从而导致发现了两种良好的NQO1底物。对接和生物学数据之间观察到的一致性表明该模型具有实用的预测能力。

  DOI：

  10.1021/jm701066a
• 作为产物：
  描述：

  仲丁胺 、 benzyloxycarbonyltryptophan succinimide ester 在 三乙胺 作用下， 以 乙醇 、 氯仿 为溶剂， 反应 2.0h， 以90%的产率得到benzyloxycarbonyltryptophan sec-butyl amide
  参考文献：
  名称：

  Lavendamycin抗肿瘤剂：基于结构的设计，合成和NAD（P）H：醌氧化还原酶1（NQO1）模型验证，以及分子对接和生物学研究。

  摘要：

  已开发了基于1H69晶体结构的NAD（P）H：醌氧化还原酶1（NQO1）活性位点的计算机模型，以促进NQO1指导的拉达霉素抗肿瘤剂的开发。利用基于结构的设计标准将拉文霉素类似物设计为NQO1底物。使用该模型进行了计算对接研究，以预测NQO1底物特异性。通过Pictet-Spengler缩合反应合成了设计的N-酰基十一碳金霉素酯和酰胺。用重组人NQO1和人结肠腺癌细胞（缺乏NQO1的BE和富含NQO1的BE-NQ）对类似物进行代谢和细胞毒性研究。发现对接物和生物学数据是相关的，其中类似物12、13、14、15和16分别被分类为好，差，差，差和好NQO1底物。我们的结果证明配体设计标准是有效的，从而导致发现了两种良好的NQO1底物。对接和生物学数据之间观察到的一致性表明该模型具有实用的预测能力。

  DOI：

  10.1021/jm701066a

文献信息

• Lavendamycin Antitumor Agents: Structure-Based Design, Synthesis, and NAD(P)H:Quinone Oxidoreductase 1 (NQO1) Model Validation with Molecular Docking and Biological Studies
  作者：Mary Hassani、Wen Cai、Katherine H. Koelsch、David C. Holley、Anthony S. Rose、Fatemeh Olang、Jayana P. Lineswala、William G. Holloway、John M. Gerdes、Mohammad Behforouz、Howard D. Beall

  DOI：10.1021/jm701066a

  日期：2008.6.1

  A 1H69 crystal structure-based in silico model of the NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1 (NQO1) active site has been developed to facilitate NQO1-directed lavendamycin antitumor agent development. Lavendamycin analogues were designed as NQO1 substrates utilizing structure-based design criteria. Computational docking studies were performed using the model to predict NQO1 substrate specificity. Designed

  已开发了基于1H69晶体结构的NAD（P）H：醌氧化还原酶1（NQO1）活性位点的计算机模型，以促进NQO1指导的拉达霉素抗肿瘤剂的开发。利用基于结构的设计标准将拉文霉素类似物设计为NQO1底物。使用该模型进行了计算对接研究，以预测NQO1底物特异性。通过Pictet-Spengler缩合反应合成了设计的N-酰基十一碳金霉素酯和酰胺。用重组人NQO1和人结肠腺癌细胞（缺乏NQO1的BE和富含NQO1的BE-NQ）对类似物进行代谢和细胞毒性研究。发现对接物和生物学数据是相关的，其中类似物12、13、14、15和16分别被分类为好，差，差，差和好NQO1底物。我们的结果证明配体设计标准是有效的，从而导致发现了两种良好的NQO1底物。对接和生物学数据之间观察到的一致性表明该模型具有实用的预测能力。