3-((6-(ethoxycarbonyl)-5-methylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino)benzoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 3-((6-(ethoxycarbonyl)-5-methylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino)benzoic acid
• 英文别名: 3-{[6-(Ethoxycarbonyl)-5-methylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}benzoic acid；3-[(6-ethoxycarbonyl-5-methylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]benzoic acid
• 化学式: C₁₇H₁₅N₃O₄S
• 分子量: 357.39
• InChiKey: VEOXARFZSNLUJS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  130
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-((6-(ethoxycarbonyl)-5-methylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino)benzoic acid 在 氯化亚砜 作用下， 以80%的产率得到ethyl 4-((3-(chlorocarbonyl)phenyl)amino)-5-methylthieno[2,3-d]pyrimidine-6-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  发现有效的噻吩并 [2,3-d] 嘧啶 VEGFR-2 抑制剂：分子动力学模拟支持的设计、合成和酶抑制评估

  摘要：

  血管内皮生长因子受体 (VEGFR) 是众所周知的控制血管生成和癌症进展的靶标之一。在这项研究中，我们报告了一系列 4-取代的噻吩并[2,3- d ]嘧啶衍生物作为 VEGFR-2 抑制剂的设计、合成和生物学评价。这些化合物的设计基于从有效吡咯并[3,2- d ]嘧啶抑制剂VIII与 VEGFR-2 (PDB: 3VHE) 的晶体结构中提取的相互作用。除了这些相互作用之外，新化合物还被设计为与溶剂可及区域中的残基相互作用，例如 Asn923。因此，合成噻吩并嘧啶目标化合物并进行VEGFR-2酶抑制测定。几种目标化合物（7d-f、8b-c、8e-g和15c ) 表现出对 VEGFR-2 的有效抑制活性，IC 50值在低纳摩尔范围内。化合物8b和8e显示出异常有效的抑制活性，IC 50 分别为5和3.9  nM。还进行了分子对接分析和分子动力学模拟，以进一步研究这些发现。

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2021.105019
• 作为产物：
  描述：

  5-甲基-4-氧代-3,4-二氢噻吩并[2,3-d]-嘧啶-6-羧酸乙酯 在 五氯化磷 、 三氯氧磷 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 3-((6-(ethoxycarbonyl)-5-methylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino)benzoic acid
  参考文献：
  名称：

  基于4-氨基噻吩并[2,3-d]嘧啶的新型蛋白激酶CK2抑制剂的设计与合成

  摘要：

  我们先前研究工作的扩展已导致在4-氨基噻吩并[2,3-d]嘧啶衍生物中鉴定出许多新的与ATP竞争的CK2抑制剂。在研究过程中获得的活性最高的化合物是3-（5-对甲苯基-噻吩并[2,3-d]嘧啶-4-基氨基）苯甲酸5e（NHTP23，IC 50  = 0.01μM）， 3-（5-苯基-噻吩并[2,3-d]嘧啶-4-基氨基）-苯甲酸，5g（NHTP25，IC 50  = 0.065μM）和3-（6-甲基-5-苯基-噻吩并[2 ，3-d]嘧啶-4-基氨基）-苯甲酸，5n（NHTP33，IC 50 = 0.008μM）。研究了测试的4-氨基噻吩并[2,3-d]嘧啶衍生物的结构-活性关系，并提出了它们与CK2 ATP受体位点的结合方式。讨论了分子内氢键对化合物结构的负面影响。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2016.03.004

文献信息

• Design and synthesis of novel protein kinase CK2 inhibitors on the base of 4-aminothieno[2,3-d]pyrimidines
  作者：Olga V. Ostrynska、Anatoliy O. Balanda、Volodymyr G. Bdzhola、Andriy G. Golub、Igor M. Kotey、Olexander P. Kukharenko、Andrii A. Gryshchenko、Nadiia V. Briukhovetska、Sergiy M. Yarmoluk

  DOI：10.1016/j.ejmech.2016.03.004

  日期：2016.6

  research work has resulted in a number of new ATP-competitive CK2 inhibitors that have been identified among 4-aminothieno[2,3-d]pyrimidine derivatives. The most active compounds obtained in the course of the research are 3-(5-p-tolyl-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-ylamino)-benzoic acid, 5e (NHTP23, IC50 = 0.01 μM), 3-(5-phenyl-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-ylamino)-benzoic acid, 5g (NHTP25, IC50 = 0.065 μM) and 3

  我们先前研究工作的扩展已导致在4-氨基噻吩并[2,3-d]嘧啶衍生物中鉴定出许多新的与ATP竞争的CK2抑制剂。在研究过程中获得的活性最高的化合物是3-（5-对甲苯基-噻吩并[2,3-d]嘧啶-4-基氨基）苯甲酸5e（NHTP23，IC 50  = 0.01μM）， 3-（5-苯基-噻吩并[2,3-d]嘧啶-4-基氨基）-苯甲酸，5g（NHTP25，IC 50  = 0.065μM）和3-（6-甲基-5-苯基-噻吩并[2 ，3-d]嘧啶-4-基氨基）-苯甲酸，5n（NHTP33，IC 50 = 0.008μM）。研究了测试的4-氨基噻吩并[2,3-d]嘧啶衍生物的结构-活性关系，并提出了它们与CK2 ATP受体位点的结合方式。讨论了分子内氢键对化合物结构的负面影响。
• Discovery of potent thieno[2,3-d]pyrimidine VEGFR-2 inhibitors: Design, synthesis and enzyme inhibitory evaluation supported by molecular dynamics simulations
  作者：Eman Z. Elrazaz、Rabah A.T. Serya、Nasser S.M. Ismail、Amgad Albohy、Dalal A. Abou El Ella、Khaled A.M. Abouzid

  DOI：10.1016/j.bioorg.2021.105019

  日期：2021.8

  angiogenesis and cancer progression. In this study, we are reporting the design, synthesis and biological evaluation of a series of 4-substituted thieno[2,3-d]pyrimidine derivatives as VEGFR-2 inhibitors. The design of these compounds was based on interactions extracted from crystal structure of potent pyrrolo[3,2-d]pyrimidine inhibitor VIII with VEGFR-2 (PDB: 3VHE). In addition to these interactions, the

  血管内皮生长因子受体 (VEGFR) 是众所周知的控制血管生成和癌症进展的靶标之一。在这项研究中，我们报告了一系列 4-取代的噻吩并[2,3- d ]嘧啶衍生物作为 VEGFR-2 抑制剂的设计、合成和生物学评价。这些化合物的设计基于从有效吡咯并[3,2- d ]嘧啶抑制剂VIII与 VEGFR-2 (PDB: 3VHE) 的晶体结构中提取的相互作用。除了这些相互作用之外，新化合物还被设计为与溶剂可及区域中的残基相互作用，例如 Asn923。因此，合成噻吩并嘧啶目标化合物并进行VEGFR-2酶抑制测定。几种目标化合物（7d-f、8b-c、8e-g和15c ) 表现出对 VEGFR-2 的有效抑制活性，IC 50值在低纳摩尔范围内。化合物8b和8e显示出异常有效的抑制活性，IC 50 分别为5和3.9  nM。还进行了分子对接分析和分子动力学模拟，以进一步研究这些发现。