2-(2-methyl benzo[d]thiazol-3-ium-3-yl)acetate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 2-(2-methyl benzo[d]thiazol-3-ium-3-yl)acetate
• 英文别名: 2-(2-methylbenzo[d]thiazol-3-ium-3-yl)acetate；2-(2-Methyl-1,3-benzothiazol-3-ium-3-yl)acetate
• 化学式: C₁₀H₉NO₂S
• 分子量: 207.253
• InChiKey: FPJMVQJCUMUWRN-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  72.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(2-methyl benzo[d]thiazol-3-ium-3-yl)acetate 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 48.08h， 生成
  参考文献：
  名称：

  双链 DNA 和 RNA 中极简非规范位点的筛选揭示了荧光碱基探针的背景和基序选择性结合

  摘要：

  一种半理性方法可检测双链 DNA 和 RNA 中非规范对 (NCP) 位点的低亲和力结合。针对具有单脱碱基、单 NCP 和串联 NCP 位点的 dsDNA 和 dsRNA 筛选一组带有非生物（三嗪、嘧啶）和天然 RNA 碱基的荧光噻唑橙探针。荧光探针的结合揭示了与 NCP 的新颖且选择性的碱基相互作用，为靶向 RNA 中非规范基序的新策略奠定了基础。

  DOI：

  10.1002/chem.202103616
• 作为产物：
  描述：

  2-甲基苯并噻唑 、 溴乙酸 以 甲苯 为溶剂， 反应 12.0h， 以95%的产率得到2-(2-methyl benzo[d]thiazol-3-ium-3-yl)acetate
  参考文献：
  名称：

  基因编码的双色点亮RNA传感器启用的MicroRNA比例成像

  摘要：

  MicroRNA（miRNA）在调节基因表达和细胞命运中起着至关重要的作用。然而，在活细胞中高精度成像miRNA仍然是一个巨大的挑战。在这里，我们报告了一种新颖的遗传编码双色点亮RNA传感器，用于使用Mango作为内部参考和SRB2作为传感器模块对miRNA进行比例成像。通过在单个启动子下表达内部参考和传感器模块的可拆分融合来设计此遗传编码传感器。这种设计策略允许以可忽略的干扰同步表达两个模块。活细胞成像研究表明，遗传编码的比率式RNA传感器对mir-224有特殊反应。而且，传感器与芒果的荧光比与mir-224的浓度线性相关，证实了它们确定活细胞中mir-224浓度的能力。我们的遗传编码发光RNA传感器还可以对不同细胞系中的mir-224进行比例成像。该策略可以为细胞内RNA的比例成像提供一种通用的方法，为研究活细胞中RNA的功能和丰度提供强大的工具。

  DOI：

  10.1021/acs.analchem.0c04588

文献信息

• Genetically Encoded Dual-Color Light-Up RNA Sensor Enabled Ratiometric Imaging of MicroRNA
  作者：Cai-Xia Dou、Chaoyang Liu、Zhan-Ming Ying、Wanrong Dong、Fenglin Wang、Jian-Hui Jiang

  DOI：10.1021/acs.analchem.0c04588

  日期：2021.2.2

  it remains a great challenge to image miRNAs with high accuracy in living cells. Here, we report a novel genetically encoded dual-color light-up RNA sensor for ratiometric imaging of miRNAs using Mango as an internal reference and SRB2 as the sensor module. This genetically encoded sensor is designed by expressing a splittable fusion of the internal reference and sensor module under a single promoter

  MicroRNA（miRNA）在调节基因表达和细胞命运中起着至关重要的作用。然而，在活细胞中高精度成像miRNA仍然是一个巨大的挑战。在这里，我们报告了一种新颖的遗传编码双色点亮RNA传感器，用于使用Mango作为内部参考和SRB2作为传感器模块对miRNA进行比例成像。通过在单个启动子下表达内部参考和传感器模块的可拆分融合来设计此遗传编码传感器。这种设计策略允许以可忽略的干扰同步表达两个模块。活细胞成像研究表明，遗传编码的比率式RNA传感器对mir-224有特殊反应。而且，传感器与芒果的荧光比与mir-224的浓度线性相关，证实了它们确定活细胞中mir-224浓度的能力。我们的遗传编码发光RNA传感器还可以对不同细胞系中的mir-224进行比例成像。该策略可以为细胞内RNA的比例成像提供一种通用的方法，为研究活细胞中RNA的功能和丰度提供强大的工具。
• [EN] BIFACIAL PEPTIDE NUCLEIC ACID PROBES AND METHODS OF USING THEREOF<br/>[FR] SONDES D'ACIDES NUCLÉIQUES PEPTIDIQUES BIFACIALES ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：[en]OHIO STATE INNOVATION FOUNDATION

  公开号：WO2024010977A1

  公开（公告）日：2024-01-11

  Disclosed herein are bifacial peptide nucleic acid probes. These probes can include a triplex hybrid forming moiety (e.g., a plurality of binding motifs disposed along a peptidyl backbone) conjugated to a prosthetic group. The triplex hybrid forming moiety can bind to a non-canonical base pairing site in a target nucleic acid via triplex hybridization. In this way, a variety of prosthetic groups (e.g., dyes, labels, reactive groups, etc.) can be selectively delivered to a target nucleic acid (e.g.,in vivo,in vitro, orex vivo).
• Screening of Minimalist Noncanonical Sites in Duplex DNA and RNA Reveals Context and Motif‐Selective Binding by Fluorogenic Base Probes
  作者：Yufeng Liang、Shiqin Miao、Jie Mao、Shekaraiah Devari、Maricarmen Gonzalez、Dennis Bong

  DOI：10.1002/chem.202103616

  日期：2022.1.10

  A semi-rational approach to detect low affinity binding to noncanonical pair (NCP) sites in duplex DNA and RNA has been developed. A set of fluorogenic thiazole orange probes bearing abiotic (triazines, pyrimidines) and native RNA bases was screened against dsDNAs and dsRNAs with single abasic, single NCP and tandem NCP sites. Fluorogenic probe engagement revealed novel and selective base interactions

  一种半理性方法可检测双链 DNA 和 RNA 中非规范对 (NCP) 位点的低亲和力结合。针对具有单脱碱基、单 NCP 和串联 NCP 位点的 dsDNA 和 dsRNA 筛选一组带有非生物（三嗪、嘧啶）和天然 RNA 碱基的荧光噻唑橙探针。荧光探针的结合揭示了与 NCP 的新颖且选择性的碱基相互作用，为靶向 RNA 中非规范基序的新策略奠定了基础。
• A far red emissive RNA aptamer–fluorophore system for demethylase FTO detection: design and optimization
  作者：Wenjuan Gao、Liren Xu、Jing Jing、Xiaoling Zhang

  DOI：10.1039/d3nj00043e

  日期：——

  A universal strategy for demethylase detection in the far red region, relying on the affinity between an RNA aptamer and an organic fluorophore.

  一种在远红外区域检测去甲基化酶的通用策略，依赖于 RNA aptamer 与有机荧光团之间的亲和力。