(5Z)-5-((1-methyl-1H-indol-3-yl)methylene)-2-thioxoimidazolidin-4-one

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (5Z)-5-((1-methyl-1H-indol-3-yl)methylene)-2-thioxoimidazolidin-4-one
• 英文别名: 5-[(Z)-1-(1-Methyl-1H-indol-3-YL)methylidene]-2-thioxodihydro-1H-imidazol-4-one；(5Z)-5-[(1-methylindol-3-yl)methylidene]-2-sulfanylideneimidazolidin-4-one
• 化学式: C₁₃H₁₁N₃OS
• 分子量: 257.316
• InChiKey: WJDPOFAZTZQTRZ-POHAHGRESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.08
• 拓扑面积：
  78.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-硫代乙内酰脲 、 1-甲基吲哚-3-甲醛 在 ammonium acetate 、 溶剂黄146 作用下， 反应 0.08h， 以89%的产率得到(5Z)-5-((1-methyl-1H-indol-3-yl)methylene)-2-thioxoimidazolidin-4-one
  参考文献：
  名称：

  特权支架或混杂粘合剂：罗丹宁及其相关杂环在药物化学中的比较研究

  摘要：

  罗丹宁和具有多个杂原子的相关五元杂环最近因在筛选活动中表现为“频繁的杀手”而成为非选择性化合物，因此在药物发现中几乎没有价值。但是，这种判断似乎主要是基于轶事证据。在筛选活动中鉴定出多种罗丹宁和相关化合物后，我们决定对它们的滥交进行系统的研究。合成了163种罗丹宁，乙内酰脲，硫代乙内酰脲和噻唑烷二酮，并针对几个目标进行了测试。还针对聚集和亲电反应性对化合物进行了表征，并分析了罗丹宁与相关化合物在已发表的X射线共晶结构中的结合模式。结果表明，环外，若丹宁和硫代乙内酰脲中的双键硫原子除具有其他结构特征外，还为极性相互作用和氢键提供了特别高的相互作用位点密度。这会导致“筛选范围”内浓度的混杂行为，但不应视为将此类筛选命中排除在进一步开发之外的一般剔除标准。建议将针对靶标亲和力和选择性的特殊标准应用于这些类型的化合物，并因此以有用的方式利用其特殊和潜在有价值的生物分子结合特性。这会导致“筛选范围”

  DOI：

  10.1021/jm201243p

文献信息

• Non-Peptidic Inhibitors of AKAP/PKA Interaction
  申请人：Klussmann Enno

  公开号：US20090176773A1

  公开（公告）日：2009-07-09

  The invention relates to non-peptidic molecules which modulate, especially inhibit, the interaction of protein kinase A (PKA) and A kinase anchor proteins (AKAP) and to a host or target organism that comprises said non-peptidic compounds or recognition molecules directed to said compounds, such as e.g. antibodies or chelating agents. The invention also relates to a pharmaceutical agent, especially for use in the treatment of diseases that are associated with a disturbance of the cAMP signal path, especially insipid diabetes, hypertonia, pancreatic diabetes, duodenal ulcer, asthma, heart failure, obesity, AIDS, edema, hepatic cirrhosis, schizophrenia and others. The invention also relates to the use of the inventive molecules.
• Privileged Scaffolds or Promiscuous Binders: A Comparative Study on Rhodanines and Related Heterocycles in Medicinal Chemistry
  作者：Thomas Mendgen、Christian Steuer、Christian D. Klein

  DOI：10.1021/jm201243p

  日期：2012.1.26

  campaigns, we decided to perform a systematic study on their promiscuity. An amount of 163 rhodanines, hydantoins, thiohydantoins, and thiazolidinediones were synthesized and tested against several targets. The compounds were also characterized with respect to aggregation and electrophilic reactivity, and the binding modes of rhodanines and related compounds in published X-ray cocrystal structures were analyzed

  罗丹宁和具有多个杂原子的相关五元杂环最近因在筛选活动中表现为“频繁的杀手”而成为非选择性化合物，因此在药物发现中几乎没有价值。但是，这种判断似乎主要是基于轶事证据。在筛选活动中鉴定出多种罗丹宁和相关化合物后，我们决定对它们的滥交进行系统的研究。合成了163种罗丹宁，乙内酰脲，硫代乙内酰脲和噻唑烷二酮，并针对几个目标进行了测试。还针对聚集和亲电反应性对化合物进行了表征，并分析了罗丹宁与相关化合物在已发表的X射线共晶结构中的结合模式。结果表明，环外，若丹宁和硫代乙内酰脲中的双键硫原子除具有其他结构特征外，还为极性相互作用和氢键提供了特别高的相互作用位点密度。这会导致“筛选范围”内浓度的混杂行为，但不应视为将此类筛选命中排除在进一步开发之外的一般剔除标准。建议将针对靶标亲和力和选择性的特殊标准应用于这些类型的化合物，并因此以有用的方式利用其特殊和潜在有价值的生物分子结合特性。这会导致“筛选范围”