FragLites—Minimal, Halogenated Fragments Displaying Pharmacophore Doublets. An Efficient Approach to Druggability Assessment and Hit Generation
作者:Daniel J. Wood、J. Daniel Lopez-Fernandez、Leanne E. Knight、Islam Al-Khawaldeh、Conghao Gai、Shengying Lin、Mathew P. Martin、Duncan C. Miller、Céline Cano、Jane A. Endicott、Ian R. Hardcastle、Martin E. M. Noble、Michael J. Waring
DOI:10.1021/acs.jmedchem.9b00304
日期:2019.4.11
efficient start points for the de novo design of hit molecules incorporating the interacting motifs. The approach is illustrated by mapping cyclin-dependent kinase 2, which successfully identifies orthosteric and allosteric sites. The hits were rapidly elaborated to develop efficient lead-like molecules. Hence, the approach provides a new method of identifying ligand sites, assessing tractability and
鉴定蛋白质上的配体结合位点是基于靶标的药物发现中的关键步骤。当前的解决方法要求对铅样或片段分子的大型文库进行资源密集型筛选。在这里,我们描述了一种高效而有效的实验方法,用于使用一组表达成对的氢键基序的卤化化合物(称为FragLite)来绘制相互作用位点。FragLite利用卤素取代基的反常散射,识别出类似于药物的生产性相互作用,通过X射线晶体学可以灵敏而明确地识别出这种相互作用。蛋白质相互作用表面的这种作图提供了可药用性的评估,并且可以为结合相互作用基序的命中分子的从头设计确定有效的起点。通过对细胞周期蛋白依赖性激酶2作图来说明该方法,该激酶成功鉴定了正构和变构位点。命中被迅速完善,以开发有效的铅样分子。因此,该方法提供了一种识别配体位点,评估易加工性和发现新线索的新方法。