3-[{2-[(4-carbamimidoyl-2-fluoro-phenylamino)methyl]-1-ethyl-1H-benzoimidazole-5-carbonyl}(2,4-difluoro-phenyl)amino]propionic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 3-[{2-[(4-carbamimidoyl-2-fluoro-phenylamino)methyl]-1-ethyl-1H-benzoimidazole-5-carbonyl}(2,4-difluoro-phenyl)amino]propionic acid
• 英文别名: 3-[{2-[(4-carbamimidoyl-2-fluorophenylamino)methyl]-1-ethyl-1H-benzoimidazole-5-carbonyl}-(2,4-difluorophenyl)amino]propionic acid；3-(N-[2-[(4-carbamimidoyl-2-fluoroanilino)methyl]-1-ethylbenzimidazole-5-carbonyl]-2,4-difluoroanilino)propanoic acid
• 化学式: C₂₇H₂₅F₃N₆O₃
• 分子量: 538.529
• InChiKey: MTADMTSGJVTOBB-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-氟-4-氨基苯腈 在 盐酸羟胺 、 1-羟基苯并三唑 、 溶剂黄146 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 3-[{2-[(4-carbamimidoyl-2-fluoro-phenylamino)methyl]-1-ethyl-1H-benzoimidazole-5-carbonyl}(2,4-difluoro-phenyl)amino]propionic acid
  参考文献：
  名称：

  氟化达比加群类似物的分子设计，合成和抗凝活性评估。

  摘要：

  在本研究中，通过计算机辅助模拟设计了一系列未报告的氟化达比加群类似物，这些类似物基于达比加群的结构支架。筛选并合成了十五种氟化达比加群类似物。所有目标化合物均通过（1）H NMR，（13）C NMR，（19）F NMR和HRMS进行表征。根据初步的抑制率筛选结果，评估了11种类似物（抑制率> 90％）的体外抗凝血酶活性（IC50）。测试结果表明，所有类似物均显示出对凝血酶的有效抑制活性。尤其是化合物8f，8k和8o，其IC50值分别为1.81、3.21和2.16nM，显示出显着的抗凝活性，在参考药物达比加群范围内（IC50 = 1.23nM）。而且，开发了化合物8k和8o以研究其在体内的抗凝活性。在那些部分中，化合物8o对动静脉血栓形成具有相当强的抑制作用，抑制率为84.66％，与达比加群（85.07％）相当。对接模拟表明，这些化合物可作为进一步开发新型抗凝药物的候选药物。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2016.04.038

文献信息

• Design, synthesis, biological evaluation and molecular docking of novel substituted 1-ethyl-1H-benzimidazole fluorinated derivatives as thrombin inhibitors
  作者：Fei Wang、Yu-Jie Ren

  DOI：10.1007/s13738-016-0830-1

  日期：2016.6

  Six novel substituted 1-ethyl-1H-benzimidazole fluorinated derivatives were designed and synthesised based on computer-aided simulation. The structures of the target compounds were characterised by 1H NMR, 13C NMR, 19F NMR and FT-ICR-MS. The preliminary screening inhibition rate data of synthesised compounds were more than 80 %. Compounds 12a and 12f were evaluated for their anti-thrombin activity

  在计算机辅助模拟的基础上，设计合成了六种新型的取代的1-乙基-1 H-苯并咪唑氟化衍生物。目标化合物的结构通过1 H NMR，13 C NMR，19 F NMR和FT-ICR-MS进行表征。合成化合物的初步筛选抑制率数据超过80％。评价化合物12a和12f的体外抗凝血酶活性（IC 50）。测试数据表明，该化合物显示出比参考药物阿加曲班更好的凝血酶抑制活性（9.88±2.26 nM）。尤其是，化合物12f是IC 50最强的衍生物 浓度为3.21±0.57 nM，可作为进一步研究凝血酶抑制剂的候选化合物。
• Molecular design, synthesis and anticoagulant activity evaluation of fluorinated dabigatran analogues
  作者：Fei Wang、Yu-Jie Ren、Ming-Hui Dong

  DOI：10.1016/j.bmc.2016.04.038

  日期：2016.6

  fluorinated dabigatran analogues, which were based on the structural scaffold of dabigatran, were designed by computer-aided simulation. Fifteen fluorinated dabigatran analogues were screened and synthesized. All target compounds were characterized by (1)H NMR, (13)C NMR, (19)F NMR and HRMS. According to the preliminary screening results of inhibition ratio, eleven analogues (inhibition ratio >90%)

  在本研究中，通过计算机辅助模拟设计了一系列未报告的氟化达比加群类似物，这些类似物基于达比加群的结构支架。筛选并合成了十五种氟化达比加群类似物。所有目标化合物均通过（1）H NMR，（13）C NMR，（19）F NMR和HRMS进行表征。根据初步的抑制率筛选结果，评估了11种类似物（抑制率> 90％）的体外抗凝血酶活性（IC50）。测试结果表明，所有类似物均显示出对凝血酶的有效抑制活性。尤其是化合物8f，8k和8o，其IC50值分别为1.81、3.21和2.16nM，显示出显着的抗凝活性，在参考药物达比加群范围内（IC50 = 1.23nM）。而且，开发了化合物8k和8o以研究其在体内的抗凝活性。在那些部分中，化合物8o对动静脉血栓形成具有相当强的抑制作用，抑制率为84.66％，与达比加群（85.07％）相当。对接模拟表明，这些化合物可作为进一步开发新型抗凝药物的候选药物。