3-[{2-[(4-carbamimidoyl-2-fluoro-phenylamino)methyl]-1-ethyl-1H-benzoimidazole-5-carbonyl}(2,4-difluoro-phenyl)amino]propionic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 3-[{2-[(4-carbamimidoyl-2-fluoro-phenylamino)methyl]-1-ethyl-1H-benzoimidazole-5-carbonyl}(2,4-difluoro-phenyl)amino]propionic acid
• 英文别名: 3-[{2-[(4-carbamimidoyl-2-fluorophenylamino)methyl]-1-ethyl-1H-benzoimidazole-5-carbonyl}-(2,4-difluorophenyl)amino]propionic acid；3-(N-[2-[(4-carbamimidoyl-2-fluoroanilino)methyl]-1-ethylbenzimidazole-5-carbonyl]-2,4-difluoroanilino)propanoic acid
• 化学式: C₂₇H₂₅F₃N₆O₃
• 分子量: 538.529
• InChiKey: MTADMTSGJVTOBB-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-氟-4-氨基苯腈 在 盐酸羟胺 、 1-羟基苯并三唑 、 溶剂黄146 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 3-[{2-[(4-carbamimidoyl-2-fluoro-phenylamino)methyl]-1-ethyl-1H-benzoimidazole-5-carbonyl}(2,4-difluoro-phenyl)amino]propionic acid
  参考文献：
  名称：

  氟化达比加群类似物的分子设计，合成和抗凝活性评估。

  摘要：

  在本研究中，通过计算机辅助模拟设计了一系列未报告的氟化达比加群类似物，这些类似物基于达比加群的结构支架。筛选并合成了十五种氟化达比加群类似物。所有目标化合物均通过（1）H NMR，（13）C NMR，（19）F NMR和HRMS进行表征。根据初步的抑制率筛选结果，评估了11种类似物（抑制率> 90％）的体外抗凝血酶活性（IC50）。测试结果表明，所有类似物均显示出对凝血酶的有效抑制活性。尤其是化合物8f，8k和8o，其IC50值分别为1.81、3.21和2.16nM，显示出显着的抗凝活性，在参考药物达比加群范围内（IC50 = 1.23nM）。而且，开发了化合物8k和8o以研究其在体内的抗凝活性。在那些部分中，化合物8o对动静脉血栓形成具有相当强的抑制作用，抑制率为84.66％，与达比加群（85.07％）相当。对接模拟表明，这些化合物可作为进一步开发新型抗凝药物的候选药物。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2016.04.038

文献信息

• Design, synthesis, biological evaluation and molecular docking of novel substituted 1-ethyl-1H-benzimidazole fluorinated derivatives as thrombin inhibitors
  作者：Fei Wang、Yu-Jie Ren

  DOI：10.1007/s13738-016-0830-1

  日期：2016.6

  Six novel substituted 1-ethyl-1H-benzimidazole fluorinated derivatives were designed and synthesised based on computer-aided simulation. The structures of the target compounds were characterised by 1H NMR, 13C NMR, 19F NMR and FT-ICR-MS. The preliminary screening inhibition rate data of synthesised compounds were more than 80 %. Compounds 12a and 12f were evaluated for their anti-thrombin activity

  在计算机辅助模拟的基础上，设计合成了六种新型的取代的1-乙基-1 H-苯并咪唑氟化衍生物。目标化合物的结构通过1 H NMR，13 C NMR，19 F NMR和FT-ICR-MS进行表征。合成化合物的初步筛选抑制率数据超过80％。评价化合物12a和12f的体外抗凝血酶活性（IC 50）。测试数据表明，该化合物显示出比参考药物阿加曲班更好的凝血酶抑制活性（9.88±2.26 nM）。尤其是，化合物12f是IC 50最强的衍生物 浓度为3.21±0.57 nM，可作为进一步研究凝血酶抑制剂的候选化合物。