New aziridine-based inhibitors of cathepsin L-like cysteine proteases with selectivity for the Leishmania cysteine protease LmCPB2.8
作者:Philipp Fey、Roula Chartomatsidou、Werner Kiefer、Jeremy C. Mottram、Christian Kersten、Tanja Schirmeister
DOI:10.1016/j.ejmech.2018.07.012
日期:2018.8
In the present work a series of aziridine-2,3-dicarboxylate inhibitors of papain-like cysteine proteases was designed, synthesized and tested. The compounds displayed selectivity for the parasitic protozoon Leishmania mexicana cathepsin L-like cysteine protease LmCPB2.8. The computational methods of homology modelling and molecular docking predicted some significant differences in the S2 pocket of
在本工作中,设计,合成和测试了一系列木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶的氮丙啶-2,3-二羧酸酯系列抑制剂。化合物显示选择性的寄生原虫墨西哥利什曼原虫组织蛋白酶L-类半胱氨酸蛋白酶LmCPB2.8。同源性建模和分子对接的计算方法预测了LmCPB2.8的S2口袋和Cruzain(一种来自克鲁氏锥虫的相关酶)的一些显着差异。由于LmCPB2.8中存在Tyr209而不是在空间要求很高的十字形果糖中存在Glu208,因此亲脂性酯基(抑制剂7d,9d,12d和14d)预计会占据利什曼原虫的S2口袋蛋白酶,但不会在Cruzain中形成有利的相互作用,这与我们的实验结果相同。此外,带有连接至氮丙啶部分的游离羧酸的抑制剂18显示出对LmCPB2.8的时间依赖性抑制(K i = 0.41μM ;k 2nd = 190,569 M -1 min -1)。对接结果表明与活性位点的带正电的His163有很强的离子相