2-((3-aminophenyl)(2-(piperidin-1-yl)ethoxy)-methyl)thieno[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 噻吩并吡啶类
• 英文名称: 2-((3-aminophenyl)(2-(piperidin-1-yl)ethoxy)-methyl)thieno[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid
• 英文别名: 2-[(3-Aminophenyl)-(2-piperidin-1-ylethoxy)methyl]thieno[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid；2-[(3-aminophenyl)-(2-piperidin-1-ylethoxy)methyl]thieno[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid
• 化学式: C₂₂H₂₅N₃O₃S
• 分子量: 411.525
• InChiKey: FTKYSFLMVOPKTH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-((3-aminophenyl)(2-(piperidin-1-yl)ethoxy)-methyl)thieno[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid 在 三甲基氯硅烷 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 醋酸异丙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.67h， 生成 isopropyl (E)-2-((3-(4-(dimethylamino)but-2-enamido)phenyl)(2-(piperidin-1-yl)ethoxy)methyl)thieno[3,2-b]-pyridine-7-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  针对组蛋白赖氨酸脱甲基酶KDM5A的不可逆抑制剂的基于结构的工程设计。

  摘要：

  数百种人类α-酮戊二酸（αKG）和Fe（II）依赖的双加氧酶的活性位点保存得非常好，这对选择性抑制剂的设计提出了挑战。我们在KDM5组蛋白H3赖氨酸4脱甲基酶的活性位点附近发现了一种非催化性半胱氨酸（在KDM5A中为Cys481），在其他组蛋白脱甲基酶家族中不存在，可以探索与半胱氨酸反应性亲电丙烯酰胺的相互作用。我们合成了噻吩并吡啶类抑制剂化学型的类似物，即2-（（3-氨基苯基）（2-（哌啶-1-基）乙氧基）甲基）噻吩并[3,2 - b ]吡啶-7-羧酸（N70）和含有（二甲基氨基）丁-2-烯氨基）苯基部分的衍生物（N71），旨在与Cys481形成共价相互作用。我们表征了对KDM5A的抑制和结合活性，并确定了与N70和N71配合的KDM5A催化结构域的共晶体结构。非共价抑制剂N70表现出可以在透析后逆转的αKG竞争性抑制作用，而N71的抑制作用取决于酶的浓度，甚至在透析后仍然存在，与共价修饰一致。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.8b01219
• 作为产物：
  描述：

  (3-甲酰基苯基)-氨基甲酸叔丁酯 在 甲烷磺酸 、 双二甲胺基乙基醚 、 异丙基氯化镁 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 28.0h， 生成 2-((3-aminophenyl)(2-(piperidin-1-yl)ethoxy)-methyl)thieno[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  针对组蛋白赖氨酸脱甲基酶KDM5A的不可逆抑制剂的基于结构的工程设计。

  摘要：

  数百种人类α-酮戊二酸（αKG）和Fe（II）依赖的双加氧酶的活性位点保存得非常好，这对选择性抑制剂的设计提出了挑战。我们在KDM5组蛋白H3赖氨酸4脱甲基酶的活性位点附近发现了一种非催化性半胱氨酸（在KDM5A中为Cys481），在其他组蛋白脱甲基酶家族中不存在，可以探索与半胱氨酸反应性亲电丙烯酰胺的相互作用。我们合成了噻吩并吡啶类抑制剂化学型的类似物，即2-（（3-氨基苯基）（2-（哌啶-1-基）乙氧基）甲基）噻吩并[3,2 - b ]吡啶-7-羧酸（N70）和含有（二甲基氨基）丁-2-烯氨基）苯基部分的衍生物（N71），旨在与Cys481形成共价相互作用。我们表征了对KDM5A的抑制和结合活性，并确定了与N70和N71配合的KDM5A催化结构域的共晶体结构。非共价抑制剂N70表现出可以在透析后逆转的αKG竞争性抑制作用，而N71的抑制作用取决于酶的浓度，甚至在透析后仍然存在，与共价修饰一致。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.8b01219