mesaconate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: mesaconate
• 英文别名: (E)-2-methylbut-2-enedioate
• 化学式: C₅H₄O₄
• 分子量: 128.084
• InChiKey: HNEGQIOMVPPMNR-NSCUHMNNSA-L

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  80.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  mesaconate 在 PfFHΔ40 作用下， 生成 S-citramalate
  参考文献：
  名称：

  富马酸疟原虫水合酶的生化特性和必要性。

  摘要：

  疟疾的病原体恶性疟原虫（Pf）具有含铁硫簇的I类富马酸盐水合酶（FH），可催化富马酸盐向苹果酸的相互转化，这是三羧酸循环中众所周知的反应。在人类中，相同的反应由II类FH催化，它与来自富马酸疟原虫的I类酶没有序列或结构同源性，在寄生虫中作为AMP合成的副产物大量产生，并由FH转化为苹果酸然后用于关键代谢产物草酰乙酸，天冬氨酸和丙酮酸的生成。先前的研究已经确定FH反应是恶性疟原虫必不可少的，但是缺乏PfFH的生化特性，可能为开发特定的抑制剂提供线索。这里，我们报告了纯化的重组PfFH的动力学特性，大肠杆菌中fh缺乏的功能互补以及寄生虫中的线粒体定位。我们发现底物类似物巯基琥珀酸是一种有效的PfFH抑制剂，Ki值在纳摩尔范围内。将转染子导入BALB / c小鼠后，无法在伯氏疟原虫中敲除fh基因。但是，当以C57BL / 6小鼠为宿主时，fh基因敲除是成功的，这表明fh基因对寄生虫的必要性取决于小鼠品系。将转染子导入BALB

  DOI：

  10.1074/jbc.m117.816298
• 作为产物：
  描述：

  threo-3-methyl-L-aspartate(1-) 生成 mesaconate 、 铵
  参考文献：
  名称：

  C-3氢交换的机理和3-甲基天冬氨酸氨裂解酶中氨的消除。

  摘要：

  3-甲基天冬氨酸氨分解酶（EC 4.3.1.2）催化底物（2S，3S）-3-甲基天冬氨酸的C-3氢与溶剂氢的交换。使用（2S，3S）-3-甲基天冬氨酸及其C-3-氘代异位异构体探讨了交换反应的机理。在tri水中进行温育可以测量measured从基材上清除pro或氘的速率。在基本上为Vmax的条件下（[S]远大于Km）进行交换时，氘的主要同位素同位素效应在pH 9.0、7.6和6.5时分别为1.6、1.5和1.5。在相同的温育条件下用分光光度法测量的脱氨反应显示出在pH 9.0、7.6和6.5时同位素效应分别为1.7、1.6和1.4，与先前报道的DV和D（V / K）值一致[Botting，NP ，阿赫塔尔·M。，科恩·M。A。，＆Gani，D。（1988）Biochemistry 27，2956-2959]。然而，交换速率与脱氨速率之比随pH值变化很大。结合两个反应的主要同位素效应的相同值

  DOI：

  10.1021/bi00120a031

文献信息

• Engineering methylaspartate ammonia lyase for the asymmetric synthesis of unnatural amino acids
  作者：Hans Raj、Wiktor Szymański、Jandré de Villiers、Henriëtte J. Rozeboom、Vinod Puthan Veetil、Carlos R. Reis、Marianne de Villiers、Frank J. Dekker、Stefaan de Wildeman、Wim J. Quax、Andy-Mark W. H. Thunnissen、Ben L. Feringa、Dick B. Janssen、Gerrit J. Poelarends

  DOI：10.1038/nchem.1338

  日期：2012.6

  predefined transformation remains a major challenge in protein engineering. Here, we describe the structure-based engineering of methylaspartate ammonia lyase (which in nature catalyses the conversion of 3-methylaspartate to ammonia and 2-methylfumarate) to accept a variety of substituted amines and fumarates and catalyse the asymmetric synthesis of aspartic acid derivatives. We obtained two single-active-site

  重新设计酶以生产用于预定转化的催化剂仍然是蛋白质工程中的主要挑战。在这里，我们描述了甲基天冬氨酸解氨酶（其在自然界中催化 3-甲基天冬氨酸转化为氨和 2-甲基富马酸）的基于结构的工程，以接受各种取代的胺和富马酸盐并催化天冬氨酸衍生物的不对称合成。我们获得了两种单活性位点突变体，一种具有广泛的亲核试剂范围，包括结构多样的线性和环状烷基胺，另一种具有广泛的亲电子试剂范围，包括在 C2 位置具有烷基、芳基、烷氧基、芳氧基、烷硫基和芳硫基取代基的富马酸酯衍生物。两种突变体都有一个扩大的活性位点，可以容纳新的底物，同时保留野生型酶的高立体选择性和区域选择性。例如，我们展示了高度对映和非对映选择性合成threo -3-benzyloxyaspartate（大脑中神经元兴奋性谷氨酸转运蛋白的重要抑制剂）。
• A Methylaspartate Cycle in Haloarchaea
  作者：Maria Khomyakova、Özlem Bükmez、Lorenz K. Thomas、Tobias J. Erb、Ivan A. Berg

  DOI：10.1126/science.1196544

  日期：2011.1.21

  Salt-loving microbes have patched together an alternative carbon assimilation cycle.

  嗨！“Salt-loving microbes have patched together an alternative carbon assimilation cycle.”的中文翻译为：“嗜盐微生物已经拼凑出了一种替代的碳同化循环。”
• Mechanism of C-3 hydrogen exchange and the elimination of ammonia in the 3-methylaspartate ammonia-lyase reaction
  作者：Nigel P. Botting、David Gani

  DOI：10.1021/bi00120a031

  日期：1992.2.11

  (1988) Biochemistry 27, 2956-2959]. The ratio of the rate of exchange to the rate of deamination, however, varied widely with pH. Together with the identical values of the primary isotope effects for the two reactions, this result indicates that the partition between reaction pathways occurs after the slowest steps in the common part of the reaction coordinate pathway, almost certainly after the cleavage

  3-甲基天冬氨酸氨分解酶（EC 4.3.1.2）催化底物（2S，3S）-3-甲基天冬氨酸的C-3氢与溶剂氢的交换。使用（2S，3S）-3-甲基天冬氨酸及其C-3-氘代异位异构体探讨了交换反应的机理。在tri水中进行温育可以测量measured从基材上清除pro或氘的速率。在基本上为Vmax的条件下（[S]远大于Km）进行交换时，氘的主要同位素同位素效应在pH 9.0、7.6和6.5时分别为1.6、1.5和1.5。在相同的温育条件下用分光光度法测量的脱氨反应显示出在pH 9.0、7.6和6.5时同位素效应分别为1.7、1.6和1.4，与先前报道的DV和D（V / K）值一致[Botting，NP ，阿赫塔尔·M。，科恩·M。A。，＆Gani，D。（1988）Biochemistry 27，2956-2959]。然而，交换速率与脱氨速率之比随pH值变化很大。结合两个反应的主要同位素效应的相同值
• Alteration of the Diastereoselectivity of 3-Methylaspartate Ammonia Lyase by Using Structure-Based Mutagenesis
  作者：Hans Raj、Barbara Weiner、Vinod Puthan Veetil、Carlos R. Reis、Wim J. Quax、Dick B. Janssen、Ben L. Feringa、Gerrit J. Poelarends

  DOI：10.1002/cbic.200900311

  日期：2009.9.4

  Selective shopping at the MAL(L): The diastereoselectivity of 3‐methylaspartate ammonia‐lyase (MAL) can be strongly enhanced by mutation of the active‐site residues His194, Lys331, and Gln329. The enhancement of the stereoselectivity should make it possible to utilize single amino acid variants of MAL in stereo‐ and regioselective amination reactions to produce 3‐ and N‐substituted aspartic acid derivatives

  在MAL（L）处的选择性购物：通过激活位点残基His194，Lys331和Gln329的突变，可以大大提高3-甲基天冬氨酸氨解酶（MAL）的非对映选择性。立体选择性的增强应该使在立体和区域选择性胺化反应中利用MAL的单个氨基酸变体产生非对映体过量非常高的3和N取代的天冬氨酸衍生物成为可能。
• Wang C.C.; Barker H.A., J Biol Chem, 1969, 0021-9258, 2516-26
  作者：Wang C.C.、Barker H.A.

  DOI：——

  日期：——