tris(N-[2-hydroxypyridin-3-yl-carbonyl]-2-aminoethyl)amine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: tris(N-[2-hydroxypyridin-3-yl-carbonyl]-2-aminoethyl)amine
• 英文别名: tris[[(2-hydroxynicotinyl)carbonyl]-2-aminoethyl]amine；N-[2-[bis[2-[(2-oxo-1H-pyridine-3-carbonyl)amino]ethyl]amino]ethyl]-2-oxo-1H-pyridine-3-carboxamide
• 化学式: C₂₄H₂₇N₇O₆
• 分子量: 509.522
• InChiKey: ZGRCDCJVEYNBFF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  178
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-羟基烟酸 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 38.0h， 生成 tris(N-[2-hydroxypyridin-3-yl-carbonyl]-2-aminoethyl)amine
  参考文献：
  名称：

  Tripodal trisamides based on nicotinic and picolinic acid derivatives

  摘要：

  一些多齿芳胺配体已通过将各种无环三脚架或线性多胺与烟酸和吡啶甲酸衍生物偶联而制备。本研究采用了两种合成方法；三{[(2-羟基烟酰基)羰基]-2-氨基乙基}胺（H₃NICTREN）通过方法A，即HOSu/DCC方法制备，而本研究中的其他芳胺通过方法B，即CDI方法制备。方法A涉及N-羟基琥珀酰亚胺与2-羟基烟酸（在二环己基碳二亚胺（DCC）存在下作为脱水偶联试剂）反应形成琥珀酰亚胺酯，然后与TREN反应生成H₃NICTREN。方法B涉及羧酸（2-羟基烟酸、3-羟基吡啶甲酸、烟酸或吡啶甲酸）与羰基二咪唑（CDI）反应形成N-酰基咪唑，然后与胺（TREN、TAME、精胺或TRPN）反应生成所需的芳胺。确定了1,1,1-三{[(3-羟基吡啶基)羰基]-2-氨基甲基}乙烷（H₃PICTAME）的X射线结构；H₃PICTAME的晶体为单斜晶系，a = 10.257(2)，b = 15.572(3)，c = 15.208(2) Å，β = 96.124(15)°，Z = 4，空间群P2₁/a。该结构通过直接方法解决，并通过全矩阵最小二乘法精化至R = 0.041和R_w = 0.038，对于I >= 3 sigma (I)的2506个反射。在固态中，H₃PICTAME包含广泛的氢键网络，每个分子有八个分子内和一个分子间氢键；配体部分预组织以供金属离子螯合。已确定了H₃NICTREN和1,1,1-三{[(2-羟基烟酰基)羰基]-2-氨基甲基}乙烷（H₃NICTAME）的酸解离常数；H₃NICTREN（H₃NICTAME）的pK_a1 = 11.2（10.68），pK_a2 = 10.7（10.58），pK_a3 = 10.0（9.71），pK_a4 = 6.25；高酚pK_a值与固态中观察到的氢键结合一致。关键词：芳胺，氢键，预组织。

  DOI：

  10.1139/v98-030

文献信息

• The influence of linkages between 1-hydroxy-2(1H)-pyridinone coordinating groups and a tris(2-aminoethyl)amine core in a novel series of synthetic hexadentate iron(III) chelators on antimicrobial activity
  作者：David G. Workman、Michael Hunter、Shuning Wang、Jérémy Brandel、Véronique Hubscher、Lynn G. Dover、David Tétard

  DOI：10.1016/j.bioorg.2019.103465

  日期：2020.1

  have investigated synthetic iron chelators based on hydroxy-pyridinone ligands as novel bacteriostatic agents. Herein we describe our synthesis of several useful building blocks based on the 1-hydroxy-2(1H)-pyridinone moiety, including a novel formyl derivative, which were combined with a tris(2-aminoethyl)amine core to obtain a series of new high-affinity hexadentate Fe(III) chelators. The design principle

  病原体对抗菌素的耐药性是当前主要的医疗保健问题。在一系列相关研究中，我们研究了基于羟基吡啶酮配体作为新型抑菌剂的合成铁螯合剂。在本文中，我们描述了基于1-羟基-2（1H）-吡啶酮部分的几种有用结构单元的合成，包括新型甲酰基衍生物，它们与三（2-氨基乙基）胺核结合以获得一系列新的高亲和力六齿Fe（III）螯合剂。该系列研究的设计原理是核心和金属配体之间的连接基团的大小和柔性。进行代表性配位基团的pKa和稳定性常数（Fe3 +和Cu2 +）的测量，以帮助合理化螯合剂的生物活性。新型螯合剂在一组代表性微生物上进行了测试，其中一些微生物有效地抑制了微生物的生长。我们证明羟基吡啶酮和三（2-氨基乙基）胺核之间的连接基的性质和位置对微生物的生长抑制有相当大的影响，酰胺或胺键都可以提供有效的螯合剂。
• Tripodal trisamides based on nicotinic and picolinic acid derivatives
  作者：H R Hoveyda、Veranja Karunaratne、Christopher J Nichols、Steven J Rettig、Ashley KW Stephens、Chris Orvig

  DOI：10.1139/v98-030

  日期：1998.4.1

  A number of polydentate arylamide ligands have been prepared by coupling various acyclic tripodal or linear polyamines with derivatives of nicotinic and picolinic acids. Two synthetic procedures were utilized; tris[(2-hydroxynicotinyl)carbonyl]-2-aminoethyl}amine (H₃NICTREN) was prepared by Method A, the HOSu/DCC method, and the other arylamides in this study were prepared by Method B, the CDI method. Method A involved the reaction of N-hydroxysuccinimide with 2-hydroxynicotinic acid (in the presence of dicyclohexylcarbodiimide (DCC) as a dehydrative coupling reagent) to form the succinimide ester, followed by reaction with TREN to yield H₃NICTREN. Method B involved reaction of a carboxylic acid (2-hydroxynicotinic, 3-hydroxypicolinic, nicotinic, or picolinic acids) with carbonyldiimidazole (CDI) to form the N-acylimidazolide, followed by reaction with the amine (TREN, TAME, spermidine, or TRPN) to yield the desired arylamide. The X-ray structure of 1,1,1-tris[(3-hydroxypicolinyl)carbonyl]-2-aminomethyl}ethane (H₃PICTAME) was determined; crystals of H₃PICTAME are monoclinic, a = 10.257(2), b = 15.572(3), c = 15.208(2) Å, β = 96.124(15)°, Z = 4, space group P2₁/a. The structure was solved by direct methods and refined by full-matrix least-squares procedures to R = 0.041 and R_w = 0.038 for 2506 reflections with I >= 3 sigma (I). In the solid state, H₃PICTAME contains an extensive hydrogen-bonding network, with eight intra- and one intermolecular H-bonds per molecule; the ligand is partially preorganized for metal ion chelation. The acid dissociation constants of H₃NICTREN and those of 1,1,1-tris[(2-hydroxynicotinyl)carbonyl]-2-

  aminomethyl}ethane (H₃NICTAME) have been determined; pK_a1 = 11.2 (10.68), pK_a2 = 10.7 (10.58), pK_a3 = 10.0 (9.71), and pK_a4 = 6.25 for H₃NICTREN (H₃NICTAME); the high phenolic pK_a's are consistent with the hydrogen bonding observed in the solid state.Key words: arylamide, hydrogen bonding, preorganization.

  一些多齿芳胺配体已通过将各种无环三脚架或线性多胺与烟酸和吡啶甲酸衍生物偶联而制备。本研究采用了两种合成方法；三[(2-羟基烟酰基)羰基]-2-氨基乙基}胺（H₃NICTREN）通过方法A，即HOSu/DCC方法制备，而本研究中的其他芳胺通过方法B，即CDI方法制备。方法A涉及N-羟基琥珀酰亚胺与2-羟基烟酸（在二环己基碳二亚胺（DCC）存在下作为脱水偶联试剂）反应形成琥珀酰亚胺酯，然后与TREN反应生成H₃NICTREN。方法B涉及羧酸（2-羟基烟酸、3-羟基吡啶甲酸、烟酸或吡啶甲酸）与羰基二咪唑（CDI）反应形成N-酰基咪唑，然后与胺（TREN、TAME、精胺或TRPN）反应生成所需的芳胺。确定了1,1,1-三[(3-羟基吡啶基)羰基]-2-氨基甲基}乙烷（H₃PICTAME）的X射线结构；H₃PICTAME的晶体为单斜晶系，a = 10.257(2)，b = 15.572(3)，c = 15.208(2) Å，β = 96.124(15)°，Z = 4，空间群P2₁/a。该结构通过直接方法解决，并通过全矩阵最小二乘法精化至R = 0.041和R_w = 0.038，对于I >= 3 sigma (I)的2506个反射。在固态中，H₃PICTAME包含广泛的氢键网络，每个分子有八个分子内和一个分子间氢键；配体部分预组织以供金属离子螯合。已确定了H₃NICTREN和1,1,1-三[(2-羟基烟酰基)羰基]-2-氨基甲基}乙烷（H₃NICTAME）的酸解离常数；H₃NICTREN（H₃NICTAME）的pK_a1 = 11.2（10.68），pK_a2 = 10.7（10.58），pK_a3 = 10.0（9.71），pK_a4 = 6.25；高酚pK_a值与固态中观察到的氢键结合一致。关键词：芳胺，氢键，预组织。