壬酰-辅酶A | 17331-98-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 中文名称: 壬酰-辅酶A
• 英文名称: Nonanoyl-coa
• 英文别名: S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] nonanethioate
• CAS: 17331-98-5
• 化学式: C₃₀H₅₂N₇O₁₇P₃S
• 分子量: 907.767
• InChiKey: WLDUTYVSAGSKIV-FUEUKBNZSA-N

物化性质

• 密度：
  1.68±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  甲醇（微溶）、水（微溶）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.1
• 重原子数：
  58
• 可旋转键数：
  27
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  壬酰-辅酶A 在 ferrocenium hexafluorophosphate 、 Streptomyces coelicolor short-chain acyl-CoA dehydrogenase 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 3.08h， 生成 nonenoyl-CoA
  参考文献：
  名称：

  从中心代谢和聚酮化合物的生物合成中筛选和工程化羧化还原酶的合成潜力

  摘要：

  羧化烯酰硫酯还原酶（ECR）是最近发现的一类酶。它们催化高效添加CO 2与α，β-不饱和CoA-硫酯的双键结合，具有两个生物学功能。在许多细菌的初级代谢中，它们在吸收中央代谢物乙酰辅酶A的过程中会产生乙基丙二酰辅酶A。在次级代谢中，它们提供独特的α-羧基-酰基-硫代酯，以改变许多聚酮化合物天然产物的主链。使用各种可能的底物库系统评估了不同的ECR。我们鉴定了三个活性位点残基，以区分仅限于C4和C5-烯酰基-CoA的ECR和高度混杂的ECR，并成功地设计了一种选定的ECR作为原理证明。这项研究定义了ECR反应性的分子基础，从而可以预测和操纵天然产物多样化中的关键反应。

  DOI：

  10.1002/anie.201505282
• 作为产物：
  描述：

  nonenoyl-CoA 在 碳酸氢钠 、 还原型辅酶II(NADPH)四钠盐 作用下， 反应 3.0h， 生成 壬酰-辅酶A
  参考文献：
  名称：

  从中心代谢和聚酮化合物的生物合成中筛选和工程化羧化还原酶的合成潜力

  摘要：

  羧化烯酰硫酯还原酶（ECR）是最近发现的一类酶。它们催化高效添加CO 2与α，β-不饱和CoA-硫酯的双键结合，具有两个生物学功能。在许多细菌的初级代谢中，它们在吸收中央代谢物乙酰辅酶A的过程中会产生乙基丙二酰辅酶A。在次级代谢中，它们提供独特的α-羧基-酰基-硫代酯，以改变许多聚酮化合物天然产物的主链。使用各种可能的底物库系统评估了不同的ECR。我们鉴定了三个活性位点残基，以区分仅限于C4和C5-烯酰基-CoA的ECR和高度混杂的ECR，并成功地设计了一种选定的ECR作为原理证明。这项研究定义了ECR反应性的分子基础，从而可以预测和操纵天然产物多样化中的关键反应。

  DOI：

  10.1002/anie.201505282

文献信息

• Establishing a Toolkit for Precursor-Directed Polyketide Biosynthesis: Exploring Substrate Promiscuities of Acid-CoA Ligases
  作者：Maybelle Kho Go、Jeng Yeong Chow、Vivian Wing Ngar Cheung、Yan Ping Lim、Wen Shan Yew

  DOI：10.1021/bi300425j

  日期：2012.6.5

  biosynthesized from acyl-CoA precursors by polyketide synthases. One of the limitations to combinatorial biosynthesis of polyketides has been the lack of a toolkit that describes the means of delivering novel acyl-CoA precursors necessary for polyketide biosynthesis. Using five acid-CoA ligases obtained from various plants and microorganisms, we biosynthesized an initial library of 79 acyl-CoA thioesters by screening

  聚酮化合物是化学上多样化且具有医学上重要意义的生物化学物质，它们是通过聚酮化合物合酶从酰基辅酶A前体生物合成的。聚酮化合物的组合生物合成的局限性之一是缺少工具包，该工具包描述了递送聚酮化合物生物合成所必需的新型酰基-CoA前体的方法。使用从各种植物和微生物中获得的5种酸性CoA连接酶，我们通过针对123种羧酸的文库筛选每种酸性CoA连接酶，生物合成了79种酰基CoA硫酯的初始文库。酰基-CoA硫酯库包括肉桂基-CoA，3-苯基丙酰基-CoA，苯甲酰基-CoA，苯乙酰基-CoA，丙二酰-CoA，饱和和不饱和脂族CoA硫酯和双环芳族CoA硫酯的衍生物。在我们对新型酰基辅酶A前体的生物合成路线的搜索中，我们发现了两种以前未报道过的丙二酰辅酶A衍生物（3-硫代苯丙氨酰辅酶A和苯基丙二酰辅酶A），无法通过规范的丙二酰辅酶A合成酶生产。该报告强调了确定常规底物池之外底物混杂的实用性和重要性，并描述了建
• A Pair of Atypical KAS III Homologues with Initiation and Elongation Functions Program the Polyketide Biosynthesis in Asukamycin
  作者：Xiaoli Yan、Jun Zhang、Hongqun Tan、Zhihao Liu、Kai Jiang、Wenya Tian、Mengmeng Zheng、Zhi Lin、Zixin Deng、Xudong Qu

  DOI：10.1002/anie.202200879

  日期：2022.5.2

  KAS IIIs are known to be involved in the initiation step of polyketide and fatty acid biosynthesis. In vitro reconstitution of the upper triene chain of asukamycin unveils two highly unusual KAS IIIs which both exhibit initiation and iterative elongation activity. Together with the permissive ketoreductase and dehydratase, these C−C bond-forming enzymes can synthesize a large variety of polyenes.

  已知 KAS III 参与聚酮化合物和脂肪酸生物合成的起始步骤。Asukamycin 上三烯链的体外重组揭示了两种非常不寻常的 KAS III，它们都表现出起始和迭代延伸活性。与允许的酮还原酶和脱水酶一起，这些 C-C 键形成酶可以合成多种多烯。
• An Atypical Acyl‐CoA Synthetase Enables Efficient Biosynthesis of Extender Units for Engineering a Polyketide Carbon Scaffold
  作者：Mengmeng Zheng、Jun Zhang、Wan Zhang、Lu Yang、Xiaoli Yan、Wenya Tian、Zhihao Liu、Zhi Lin、Zixin Deng、Xudong Qu

  DOI：10.1002/anie.202208734

  日期：2022.10.24

  new acyl-CoA synthetase (ACS, UkaQ) with broad substrate specificity and an unusual catalytic mode was identified. Its stability and catalytic activity were remarkably improved by protein engineering, enabling it to synthesize a large variety of acyl-CoAs. In combination with permissive carboxylases, diverse extender units were synthesized and used to engineer the polyketide carbon scaffold of antimycin

  鉴定了一种具有广泛底物特异性和不寻常催化模式的新型酰基辅酶 A 合成酶（ACS，UkaQ）。蛋白质工程显着提高了其稳定性和催化活性，使其能够合成多种酰基辅酶 A。结合允许的羧化酶，合成了多种扩展单元，并用于设计抗霉素的聚酮化合物碳支架。
• BioWF: A Naturally‐Fused, Di‐Domain Biocatalyst from Biotin Biosynthesis Displays an Unexpectedly Broad Substrate Scope
  作者：Shona M. Richardson、Peter J. Harrison、Michael A. Herrera、Menglu Wang、Rebecca Verez、Gustavo Perez Ortiz、Dominic J. Campopiano

  DOI：10.1002/cbic.202200171

  日期：2022.9.5

  A BioWF fusion biocatalyst can convert various fatty acid substrates to α-oxoamine (AON) products. The ATP-dependent BioW domain catalyses formation of an acyl-CoA thioester intermediate. The pyridoxal 5’-phosphate (PLP)-dependent BioF domain then accepts various amino acids and catalyses the formation of a range of aminoketone analogues.

  BioWF 融合生物催化剂可以将各种脂肪酸底物转化为 α-氧代胺 (AON) 产物。ATP 依赖性 BioW 结构域催化形成酰基辅酶 A 硫酯中间体。然后，吡哆醛 5'-磷酸 (PLP) 依赖性 BioF 结构域接受各种氨基酸并催化一系列氨基酮类似物的形成。