(R)-n-(3-((2-氨基乙基)氨基)-3-氧代丙基)-2,4-二羟基-3,3-二甲基丁酰胺 | 943528-71-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: (R)-n-(3-((2-氨基乙基)氨基)-3-氧代丙基)-2,4-二羟基-3,3-二甲基丁酰胺
• 英文名称: (R)-N-(3-((2-Aminoethyl)amino)-3-oxopropyl)-2,4-dihydroxy-3,3-dimethylbutanamide
• 英文别名: (2R)-N-[3-(2-aminoethylamino)-3-oxopropyl]-2,4-dihydroxy-3,3-dimethylbutanamide
• CAS: 943528-71-0
• 化学式: C₁₁H₂₃N₃O₄
• 分子量: 261.321
• InChiKey: KEMMDXICCGPQBQ-VIFPVBQESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.3
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  125
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 海关编码：
  2924199090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-n-(3-((2-氨基乙基)氨基)-3-氧代丙基)-2,4-二羟基-3,3-二甲基丁酰胺 、 5’-三磷酸腺苷 在 DPCK 、 PanK 、 PPAT 、 potassium chloride 、 magnesium chloride 作用下， 反应 1.5h， 以72%的产率得到NH-CoA
  参考文献：
  名称：

  Kutzneride生物合成过程中苏式和赤型-β-羟基谷氨酸的立体有择合成

  摘要：

  抗真菌和抗微生物 kutznerides，由一种 α-羟基酸和五种非蛋白质氨基酸组成的六肽，是在非核糖体生产的天然产物中发现的结构多样性的显着例子。它们含有 D-3-羟基谷氨酸，它存在于成熟库兹奈德的苏式和赤式异构体中。在这项研究中，两种假定的非血红素铁加氧酶 KtzO 和 KtzP 被重组表达，在体外进行生化表征，并发现可以立体特异性地将谷氨酸的 β 位羟基化。KtzO 生成苏-L-羟基谷氨酸，KtzP 催化与非核糖体肽合成酶 KtzH 的第三个模块的肽基载体蛋白结合的赤型异构体的形成。该模块具有截短的腺苷酸化结构域，无法激活和整合谷氨酸。在第三个 KtzH 模块中缺乏功能性腺苷酸化结构域由独立的腺苷酸化结构域 KtzN 反式补偿，KtzN 在截短的腺苷酸化结构域和 KtzO 或 KtzP 存在的情况下激活谷氨酸并将其转移到 KtzH 的载体上。开发了一种使用不可水解辅酶 A 类似物的方法，用于确定

  DOI：

  10.1021/ja9054417
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl (2-(3-((4R)-2-(4-methoxyphenyl)-5,5-dimethyl-1,3-dioxane-4-carboxamido)propanamido)ethyl)carbamate 在 三乙基硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 以42%的产率得到(R)-n-(3-((2-氨基乙基)氨基)-3-氧代丙基)-2,4-二羟基-3,3-二甲基丁酰胺
  参考文献：
  名称：

  Kutzneride生物合成过程中苏式和赤型-β-羟基谷氨酸的立体有择合成

  摘要：

  抗真菌和抗微生物 kutznerides，由一种 α-羟基酸和五种非蛋白质氨基酸组成的六肽，是在非核糖体生产的天然产物中发现的结构多样性的显着例子。它们含有 D-3-羟基谷氨酸，它存在于成熟库兹奈德的苏式和赤式异构体中。在这项研究中，两种假定的非血红素铁加氧酶 KtzO 和 KtzP 被重组表达，在体外进行生化表征，并发现可以立体特异性地将谷氨酸的 β 位羟基化。KtzO 生成苏-L-羟基谷氨酸，KtzP 催化与非核糖体肽合成酶 KtzH 的第三个模块的肽基载体蛋白结合的赤型异构体的形成。该模块具有截短的腺苷酸化结构域，无法激活和整合谷氨酸。在第三个 KtzH 模块中缺乏功能性腺苷酸化结构域由独立的腺苷酸化结构域 KtzN 反式补偿，KtzN 在截短的腺苷酸化结构域和 KtzO 或 KtzP 存在的情况下激活谷氨酸并将其转移到 KtzH 的载体上。开发了一种使用不可水解辅酶 A 类似物的方法，用于确定

  DOI：

  10.1021/ja9054417

文献信息

• An unusual intramolecular trans-amidation
  作者：Heriberto Rivera、Sachin Dhar、James J. La Clair、Shiou-Chuan Tsai、Michael D. Burkart

  DOI：10.1016/j.tet.2016.01.062

  日期：2016.6

  elaborate natural products from simple building blocks. Mimicry of these processes has offered practical means for total synthesis and provided a foundation for reaction discovery. We now report an unusual intramolecular trans-amidation reaction discovered while preparing stabilized probes for the study of actinorhodin biosynthesis. This rapid cyclization event offers insight into the natural cyclization

  聚酮化合物的生物合成过程涉及一系列适时的生物合成操作，可从简单的结构单元中生成精细的天然产物。这些过程的模仿为全合成提供了实用的手段，并为发现反应奠定了基础。我们现在报告一个不寻常的分子内转，同时准备稳定探头，放线菌生物合成的研究-amidation反应发现。这种快速的环化过程提供了对II型聚酮化合物抗生素生物合成固有的自然环化过程的洞察力。
• Activity of Fatty Acid Biosynthesis Initiating Ketosynthase FabH with Acetyl/Malonyl-oxa/aza(dethia)CoAs
  作者：Trevor J. Boram、Aaron B. Benjamin、Amanda Silva de Sousa、Lee M. Stunkard、Taylor A. Stewart、Timothy J. Adams、Nicholas A. Craft、Kevin G. Velázquez-Marrero、Jianheng Ling、Jaelen N. Nice、Jeremy R. Lohman

  DOI：10.1021/acschembio.2c00667

  日期：2023.1.20

  with mutant FabH C112Q that mimics the acyl-enzyme intermediate allowing dissection of the decarboxylation reaction. The acetyl- and malonyl-oxa(dethia)CoA analogues undergo extremely slow hydrolysis in the presence of FabH or the C112Q mutant. Decarboxylation of malonyl-oxa(dethia)CoA by FabH or C112Q mutant was not detected. The amide analogues were completely stable to enzyme activity. In enzyme assays

  脂肪酸和聚酮生物合成酶利用酰基硫酯和丙二酰硫酯的反应性进行催化。一个典型的例子是 FabH，它在许多细菌和植物中启动脂肪酸生物合成。 FabH 与乙酰辅酶 A 进行酰基转移酶反应，生成乙酰基-S -FabH 酰基酶中间体，随后与酰基载体蛋白 (ACP) 携带的丙二酰硫酯进行脱羧克莱森缩合。我们设想 FabH 与底物类似物的晶体结构可以深入了解支撑不同反应的构象变化和酶/底物相互作用。在这里，我们用酯或酰胺代替硫酯合成了乙酰/丙二酰辅酶A类似物，并表征了它们作为大肠杆菌FabH 底物或抑制剂的稳定性和行为，为结构研究提供信息。我们还用突变体 FabH C112Q 表征了类似物，它模拟酰基酶中间体，允许解析脱羧反应。在 FabH 或 C112Q 突变体存在的情况下，乙酰基和丙二酰基氧杂（脱硫）CoA 类似物会发生极其缓慢的水解。未检测到 FabH 或 C112Q 突变体对丙二酰氧 (dethia)CoA
• Cytotoxic peptides and conjugates thereof
  申请人：NOVARTIS AG

  公开号：US10280139B2

  公开（公告）日：2019-05-07

  Disclosed herein are novel compounds of formula (I) as described herein: and the use of such peptides in making immunoconjugates (i.e Antibody Drug Conjugates) Also described herein are immunoconjugates (i.e Antibody Drug Conjugates) comprising such novel compound linked to an antigen binding moiety, such as an antibody; where such immunoconjugates are useful for treating cell proliferative disorders. The invention further provides pharmaceutical compositions comprising these immunoconjugates, compositions comprising the immunoconjugates with a therapeutic co-agent, and methods to use these immunoconjugates and compositions for treating cell proliferation disorders.

  本文公开了如本文所述的新型式 (I) 化合物： 本发明还描述了免疫结合剂（即抗体药物结合剂），其包含与抗原结合分子（如抗体）连接的此类新型化合物；其中此类免疫结合剂可用于治疗细胞增殖性疾病。本发明进一步提供了包含这些免疫共轭物的药物组合物、包含这些免疫共轭物与治疗共用试剂的组合物，以及使用这些免疫共轭物和组合物治疗细胞增殖障碍的方法。
• AURISTATIN DERIVATIVES AND CONJUGATES THEREOF
  申请人：Geierstanger Bernhard Hubert

  公开号：US20170121282A1

  公开（公告）日：2017-05-04

  Disclosed herein are novel compounds of formula (I) as described herein: and the use of such peptides in making immunoconjugates (i.e Antibody Drug Conjugates) Also described herein are immunoconjugates (i.e Antibody Drug Conjugates) comprising such novel compound linked to an antigen binding moiety, such as an antibody; where such immunoconjugates are useful for treating cell proliferative disorders. The invention further provides pharmaceutical compositions comprising these immunoconjugates, compositions comprising the immunoconjugates with a therapeutic co-agent, and methods to use these immunoconjugates and compositions for treating cell proliferation disorders.
• CYTOTOXIC PEPTIDES AND CONJUGATES THEREOF
  申请人：NOVARTIS AG

  公开号：US20180155281A1

  公开（公告）日：2018-06-07

  Disclosed herein are novel compounds of formula (I) as described herein: and the use of such peptides in making immunoconjugates (i.e Antibody Drug Conjugates) Also described herein are immunoconjugates (i.e Antibody Drug Conjugates) comprising such novel compound linked to an antigen binding moiety, such as an antibody; where such immunoconjugates are useful for treating cell proliferative disorders. The invention further provides pharmaceutical compositions comprising these immunoconjugates, compositions comprising the immunoconjugates with a therapeutic co-agent, and methods to use these immunoconjugates and compositions for treating cell proliferation disorders.