(S)-2-Fmoc-氨基-4-戊烯酸苄酯 | 477578-53-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: (S)-2-Fmoc-氨基-4-戊烯酸苄酯
• 英文名称: Fmoc-L-allylglycine benzyl ester
• 英文别名: (S)-2-Fmoc-amino-pent-4-enoic acid benzyl ester；benzyl (2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)pent-4-enoate
• CAS: 477578-53-3
• 化学式: C₂₇H₂₅NO₄
• 分子量: 427.5
• InChiKey: NTOCLTIRCOQHPW-VWLOTQADSA-N

物化性质

• 沸点：
  594.5±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1?+-.0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.6
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  64.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-2-Fmoc-氨基-4-戊烯酸苄酯 在 palladium on activated charcoal RuCl2(1,3-dimesityl-imidazolidin-2-yl)(PCy3)(=CHPh) 、 氢气 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 (S)-2-Fmoc-氨基庚二酸-7-叔丁酯
  参考文献：
  名称：

  Convenient Access to Glutamic Acid Side Chain Homologues Compatible with Solid Phase Peptide Synthesis

  摘要：

  Preparation of several side chain length variants of glutamic acid is achieved via olefin cross metathesis of allyl glycine derivatives. The products are suitably protected for direct use in Fmoc solid-phase peptide synthesis, as demonstrated by successful synthesis of test sequences.

  DOI：

  10.1021/ol0520222
• 作为产物：
  描述：

  (S)-(-)-2-氨基-4-戊烯酸 在 碳酸氢钠 、 potassium carbonate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 (S)-2-Fmoc-氨基-4-戊烯酸苄酯
  参考文献：
  名称：

  通过后期的环丙烷环裂解策略不同地获得组蛋白脱乙酰基酶抑制性环肽。衣原霉素的短合成。

  摘要：

  基于通过在通用的多能环丙醇前体中裂解环丙烷环的裂解来安装多个锌结合功能的后期安装，提出了一种访问组蛋白脱乙酰基酶抑制肽的统一的步骤经济策略。通过短立体选择性合成天然产物衣藻多菌素，证实了所提出的面向多样性的方法的功效，该产物含有（2 S，9 S）-2-氨基-8-氧代-9,10-的具有挑战性的安装片段环氧癸酸（Aoe）及其一系列类似物，2-氨基-8-氧十二烷酸和2-氨基丁二酸的衍生物。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.9b03305

文献信息

• Synthesis of a Homologous Series of Side-Chain-Extended Orthogonally Protected Aminooxy-Containing Amino Acids
  作者：Terrence Burke Jr.、Fa Liu、Joshua Thomas

  DOI：10.1055/s-2008-1078600

  日期：2008.8

  Practical methodology is reported for the synthesis of a homologous series of side chain extended amino acids containing aminooxy functionality bearing orthogonal protection suitable for Fmoc peptide synthesis. These reagents may be useful for the preparation of libraries containing fragments joined by peptide linkers.

  报道了合成一系列同源侧链延伸氨基酸的实用方法，该氨基酸包含具有正交保护的氨基氧基官能团，适用于 Fmoc 肽合成。这些试剂可用于制备包含由肽接头连接的片段的文库。
• [EN] FMOC PROTECTED (2S)-2-AMINO-8-[(1,1-DIMETHYLETHOXY)AMINO]-8-OXO-OCTANOIC ACID, (S)-2-AMINO-8-OXONONANOIC ACID AND (S)-2-AMINO-8-OXODECANOIC ACID FOR PEPTIDE SYNTHESIS<br/>[FR] ACIDE (2S)-2-AMINO-8-[(1,1-DIMÉTHYLÉTHOXY)AMINO]-8-OXO-OCTANOÏQUE, ACIDE (S)-2-AMINO-8-OXONONANOÏQUE ET ACIDE (S)-2-AMINO-8-OXODECANOÏQUE À PROTECTION FMOC POUR LA SYNTHÈSE DE PEPTIDES
  申请人：THE UNIV COURT OF THE UNIVERISTY OF GLASGOW

  公开号：WO2019219938A1

  公开（公告）日：2019-11-21

  The invention discloses Fmoc protected (2S)-2-amino-8-[(1,1- dimethylethoxy)amino]-8-oxo-octanoic acid, (S)-2-amino-8- oxononanoic acid and (S)-2-amino-8-oxodecanoic acid for use in peptide synthesis, such as solid phase synthesis, as well as the peptide H3K27 (Ac-Lys-Ala-Ala-Arg-Aox-Ser-Ala-NH2) prepared from Fmoc protected (2S)-2-amino-8-[(1,1-dimethylethoxy)amino]-8-oxo-octanoic acid (Aox). These three exemplary compounds as well as their unprotected forms are claimed in the form of four generic formulae. The first of these four formulae is (formula (I)) where -NPro is a protected amino group, such as an amino group protected with a base-labile protecting group, -L- is alkylene, heteroalkylene, arylene or aralkylene, -X- is a covalent bond, -N(H) - or -N(RN)-, where -RN is alkyl, -R2 is hydrogen or alkyl, -R3 is alkyl, such as C2-10 alkyl, or heterocyclyl, and -LAA- and -R1 are as defined in the claims.

  该发明揭示了用于肽合成的Fmoc保护(2S)-2-氨基-8-[(1,1-二甲基乙氧基)氨基]-8-氧代辛酸、(S)-2-氨基-8-氧代壬酸和(S)-2-氨基-8-氧代癸酸，例如固相合成，以及从Fmoc保护的(2S)-2-氨基-8-[(1,1-二甲基乙氧基)氨基]-8-氧代辛酸(Aox)制备的肽H3K27(Ac-Lys-ALA-ALA-Arg-Aox-Ser-ALA-NH2)。这三种示范性化合物及其未保护形式以四种通用式的形式声明。这四种式中的第一种式（式(I)）是其中-NPro是受保护的氨基基团，例如用碱敏感保护基保护的氨基基团，-L-是烷基，杂原子烷基，芳基或芳基烷基，-X-是共价键，-N(H)-或-N(RN)-，其中-RN是烷基，-R2是氢或烷基，-R3是烷基，例如C2-10烷基，或杂环烷基，-LAA-和-R1如索引中所定义。
• High-value alcohols and higher-oxidation-state compounds by catalytic Z-selective cross-metathesis
  作者：Ming Joo Koh、R. Kashif M. Khan、Sebastian Torker、Miao Yu、Malte S. Mikus、Amir H. Hoveyda

  DOI：10.1038/nature14061

  日期：2015.1

  high-value compounds by cross-metathesis. The ruthenium complex is prepared from a commercially available precursor and an easily generated air-stable zinc catechothiolate. Transformations typically proceed with 5.0 mole per cent of the complex and an inexpensive reaction partner in 4–8 hours under ambient conditions; products are obtained in up to 80 per cent yield and 98:2 Z:E diastereoselectivity.

  烯烃复分解催化剂为生命科学领域的医生和研究人员提供了必不可少的分子。然而，一个持续存在的问题是缺乏直接生成无环 Z 烯丙醇的化学转化，包括含有受阻相邻取代基或反应性功能单元（如苯酚、醛或羧酸）的产品。在这里，我们提出了一种电子改性的二硫化钌催化剂，它可以通过交叉复分解有效地产生这种高价值的化合物。钌配合物由市售前体和易于生成的空气稳定儿茶酚硫醇锌制备。在环境条件下，转化通常在 4-8 小时内以 5.0 摩尔百分比的配合物和廉价的反应伙伴进行；以高达 80% 的产率和 98:2 Z:E 非对映选择性获得产品。该催化剂的使用已在天然抗肿瘤剂 Neopeltolide 的合成以及可再生原料（油酸）向抗真菌剂的一步立体选择性克级转化中得到证明。在这种转化中，新催化剂比常用的二氯钌配合物更有效地促进交叉复分解，表明其效用可能超出 Z 选择性过程。
• Rational Drug Design of Topically Administered Caspase 1 Inhibitors for the Treatment of Inflammatory Acne
  作者：Jean-François Fournier、Laurence Clary、Sandrine Chambon、Laurence Dumais、Craig Steven Harris、Corinne Millois、Romain Pierre、Sandrine Talano、Étienne Thoreau、Jérome Aubert、Michèle Aurelly、Claire Bouix-Peter、Anne Brethon、Laurent Chantalat、Olivier Christin、Catherine Comino、Ghizlane El-Bazbouz、Anne-Laurence Ghilini、Tatiana Isabet、Claude Lardy、Anne-Pascale Luzy、Céline Mathieu、Kenny Mebrouk、Danielle Orfila、Jonathan Pascau、Kevin Reverse、Didier Roche、Vincent Rodeschini、Laurent François Hennequin

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b00067

  日期：2018.5.10

  treatment of acne, a dermatological disorder affecting 650M persons globally. Inhibiting the protease responsible for the cleavage of inactive pro-IL1β into active IL-1β, caspase-1, could be an alternative small molecule approach. This report describes the discovery of uracil 20, a potent (38 nM in THP1 cells assay) caspase-1 inhibitor for the topical treatment of inflammatory acne. The uracil series was designed

  目前正在临床上研究白介素β抗体在治疗痤疮中的应用，痤疮是一种痤疮，一种皮肤病，全球范围内影响着6.5亿人。抑制负责将非活性前IL1β裂解为活性IL-1β的蛋白酶caspase-1，可能是另一种小分子方法。该报告描述了尿嘧啶20的发现，一种有效的caspase-1抑制剂（在THP1细胞分析中为38 nM），用于局部治疗炎性痤疮。根据已公开的胱天蛋白酶-1药效团模型设计尿嘧啶系列，该模型涉及P1中的反应性战斗部对共价可逆抑制，P4中的芳基部分对细胞凋亡的胱天蛋白酶的选择性。可逆性通过酶稀释测定法或通过使用不同的底物浓度进行评估。除了经典的结构-活性-关系探索之外，还讨论并成功解决了局部给药方面的挑战，例如光毒性，有机和水溶解度，溶液中的化学稳定性以及皮肤代谢稳定性。
• Organic synthesis in pursuit of immunology: Large-scale synthesis of peracetylated GM2 glycosylamino acid for preparation of a multiantigenic prostate cancer vaccine
  作者：Young Shin Cho、Qian Wan、Samuel J. Danishefsky

  DOI：10.1016/j.bmc.2005.06.018

  日期：2005.9

  We describe herein the stereo-controlled, large-scale synthesis of peracetylated GM2 glycosylamino acid. Key features of the synthesis include a newly modified [1+3] coupling reaction and an olefin cross-metathesis-hydrogenation sequence. The GM2 glycosylamino acid is now ready for incorporation into a hexavalent prostate cancer vaccine construct.

  我们在本文中描述了过乙酰化GM2糖基氨基酸的立体控制的大规模合成。合成的关键特征包括新修饰的[1 + 3]偶联反应和烯烃交叉复分解-氢化序列。现在已准备好将GM2糖基氨基酸掺入六价前列腺癌疫苗构建物中。