2-[(2-氧代-1H-嘧啶-6-基)氨基]乙酸 | 19674-84-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 2-[(2-氧代-1H-嘧啶-6-基)氨基]乙酸
• 英文名称: N-(1H-2-oxo-4-pyrimidinyl) glycine
• 英文别名: 2-[(2-oxo-1H-pyrimidin-6-yl)amino]acetic acid
• CAS: 19674-84-1
• 化学式: C₆H₇N₃O₃
• 分子量: 169.14
• InChiKey: QKGIANUYNBBFCS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  90.8
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[(2-氧代-1H-嘧啶-6-基)氨基]乙酸 在 丙酮 作用下， 以92%的产率得到6-(甲基氨基)-2(1h)-嘧啶酮
  参考文献：
  名称：

  Celewicz, Lech; Spychala, Jaroslaw; Golankiewicz, Krzysztof, Synthetic Communications, 1987, vol. 17, # 16, p. 1939 - 1950

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Method and apparatus for degradation and sequencing of polymers which sequentially eliminate terminal residues
  申请人：PERSEPTIVE BIOSYSTEMS, INC.

  公开号：EP0639607A2

  公开（公告）日：1995-02-22

  A method and apparatus for sequentially degrading at least a portion of a polymer of backbone repeating units, the polymer having a terminal repeating unit comprised of a nucleophile and a backbone carbonyl carbon distant from the nucleophile, comprising the steps of first initiating attack of said nucleophile upon said backbone carbonyl carbon by raising the energy level to activate said nucleophile for said attack. Secondly, forming a ring comprising the terminal repeating unit, thereby simultaneously releasing the ring and generating a shortened polymer having a terminal repeating unit capable of nucleophile attack upon the backbone carbonyl carbon and, lastly, maintaining the reaction conditions necessary for repeating steps a and b until the portion of the polymer desired is degraded. In a related embodiment, polyamide nucleic acid (PNA) sequences can be determined by generating a nested set of polymer fragments, each fragment having N-x repeating units where N is the total number of repeating units in the parent polymer and x is the number of degradation cycles the fragment has been subjected to, and then analyzing the nested set of polymer fragments to determine polymer sequence. An apparatus embodying the method of sequential degradation is also described. Analysis may be by MALD-TOF.

  一种顺序降解至少部分骨架重复单元聚合物的方法和装置，该聚合物具有由亲核物和远离亲核物的骨架羰基碳组成的末端重复单元，包括以下步骤：首先，通过提高能级以激活所述亲核物对所述骨架羰基碳的攻击，启动所述亲核物对所述骨架羰基碳的攻击。其次，形成一个包含末端重复单元的环，从而同时释放该环并生成一个缩短的聚合物，其末端重复单元能够对骨架羰基碳进行亲核攻击；最后，保持重复步骤 a 和 b 所需的反应条件，直到所需的聚合物部分降解为止。在一个相关的实施方案中，聚酰胺核酸（PNA）序列可以通过生成嵌套的聚合物片段来确定，每个片段具有 N-x 个重复单元，其中 N 是母体聚合物中重复单元的总数，x 是片段所经历的降解循环次数，然后分析嵌套的聚合物片段来确定聚合物序列。此外，还介绍了一种体现顺序降解方法的装置。分析可采用 MALD-TOF。
• Substituierte N-Ethyl-Glycinderivate zur Herstellung von PNA und PNA-/DNA-Hybriden
  申请人：HOECHST AKTIENGESELLSCHAFT

  公开号：EP0672661A1

  公开（公告）日：1995-09-20

  Es werden N-Ethyl-Glycinderivate der Formel I worin PG für eine gegen schwache Säuren labile Aminoschutzgruppe vom Urethantyp oder vom Trityl-Typ, X für NH, O oder S, Y für CH₂, NH oder O, und B' für in der Nucleotidchemie übliche Basen stehen, deren exocyclische Amino bzw. Hydroxygruppen durch geeignete bekannte Schutzgruppen geschützt sind, oder für Basenersatzverbindungen stehen und deren Salze mit tert. organischen Basen sowie ein Verfahren zu deren Herstellung beschrieben. Die N-Ethyl-Glycinderivate der Formel I finden Anwendung bei der Herstellung von PNA und PNA-/DNA-Hybriden.

  式 I 的 N-乙基甘氨酸衍生物 式中，PG 代表对弱酸易变的氨基保护基团（尿烷型或三苯甲基型），X 代表 NH、O 或 S，Y 代表 CH₂、NH 或 O，B'代表核苷酸化学中常用的碱，其外环氨基或羟基受适当的已知保护基团的保护，或代表碱置换化合物，以及它们与叔有机碱的盐，并描述了它们的制备过程。式 I 的 N-乙基甘氨酸衍生物可用于生产 PNA 和 PNA/DNA 杂交产物。
• Compositions and methods for analyzing modified nucleotides
  申请人：New England Biolabs, Inc.

  公开号：US10227646B2

  公开（公告）日：2019-03-12

  A method for identifying any of the presence, location and phasing of modified cytosines (C) in long stretches of nucleic acids is provided. In some embodiments, the method may comprise (a) reacting a first portion of a nucleic acid sample containing at least one C and/or at least one modified C with a DNA glucosyltransferase and a cytidine deaminase to produce a first product and/or reacting a second portion of the sample with a dioxygenase, optionally a DNA glucosyltransferase and a cytidine deaminase to produce a second product and; (b) comparing the sequences from the first and optionally the second product obtained in (a), or amplification products thereof, with each other and/or an untreated reference sequence to determine which Cs in the initial nucleic acid fragment are modified. A modified TET methylcytosine dioxygenase with improved efficiency compared to unmodified TET2 at converting methylcytosine to carboxymethylcytosine is also provided.

  本研究提供了一种用于鉴定长链核酸中修饰胞嘧啶（C）的存在、位置和相位的方法。在一些实施方案中，该方法可包括 (a) 将含有至少一个 C 和/或至少一个修饰 C 的核酸样本的第一部分与 DNA 葡糖基转移酶和胞苷脱氨酶反应，生成第一产物，和/或将样本的第二部分与二氧酶、DNA 葡糖基转移酶和胞苷脱氨酶反应，生成第二产物，以及；(b) 将(a)中获得的第一和第二产物或其扩增产物的序列相互比较和/或与未经处理的参考序列比较，以确定初始核酸片段中哪些 Cs 被修饰。与未修饰的 TET2 相比，修饰的 TET 甲基胞嘧啶二加氧酶将甲基胞嘧啶转化为羧甲基胞嘧啶的效率更高。
• CELEWICZ, LECH;SPYCHALA, JAROSLAW;GOLANKIEWICZ, KRZYSZTOF, SYNTH. COMMUN., 17,(1987) N 16, 1939-1950
  作者：CELEWICZ, LECH、SPYCHALA, JAROSLAW、GOLANKIEWICZ, KRZYSZTOF

  DOI：——

  日期：——
• CELEWICZ, LECH;SPYCHALA, JAROSLAW;GOLANKIEWICZ, KRZYSZTOF, J. LABELL. COMPOUNDS AND RADIOPHARM., 25,(1988) N 12, C. 1401-1405
  作者：CELEWICZ, LECH、SPYCHALA, JAROSLAW、GOLANKIEWICZ, KRZYSZTOF

  DOI：——

  日期：——