thymidine nucleoside 3',5'-cyclic methyl phosphite | 66386-45-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: thymidine nucleoside 3',5'-cyclic methyl phosphite
• 英文别名: thymidine 3',5'-cyclic methyl phosphite；thymidine cyclic methyl 3',5'-phosphite；1-[(4aR,6R,7aS)-2-methoxy-4a,6,7,7a-tetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinin-6-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 66386-45-6；66386-46-7；77715-47-0
• 化学式: C₁₁H₁₅N₂O₆P
• 分子量: 302.224
• InChiKey: GPKMJLACNQIZEL-FRBZENMSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  86.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  thymidine nucleoside 3',5'-cyclic methyl phosphite 在 dinitrogen tetraoxide 、 二氧化氮 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以54%的产率得到cis-thymidine 3',5'-cyclic methyl phosphate
  参考文献：
  名称：

  核苷环状 3',5' Pv-TBP 系统的 400 和 600 MHz 质子 NMR 构象研究。构象传输诱导非椅子构象中 3',5'-二氧杂膦烷环的双赤道取向

  摘要：

  新型核苷环状 3'3' PV-TBP 化合物 4 和 5 被研究作为建议的环状腺苷 3',5'-单磷酸 (CAMP) 活化状态的模型。化合物 4 具有 3',5'-二氧杂膦烷环的赤道轴 (e,a) 取向。化合物 5 的设计包含 OCH2CH20Me 作为构象探针，主要基于我们之前在 Pv-TBP 化合物中构象传输方面的工作。化合物 5 的 'H NMR 分析显示探针片段中的构象传输，这表明具有双赤道 (e,e) 方向的 3',5'-环的分子结构和 OCH2CH20Me 的轴向位置对假旋转平衡有显着贡献. 通过与 PV-TBP 化合物 13 的比较，清楚地确定了 5 中的构象传输，其中 0 n B u 取代了 OCH2CH20Me 基团，14，其中反式稠合环戊烷环取代了胸苷的呋喃糖环，15，其中 OCH2CH20Me 基团锁定在 PV-TBP 的赤道位置。结果表明，构象传递有助于稳定 3',

  DOI：

  10.1021/ja00177a004
• 作为产物：
  描述：

  thymidine 3',5'-cyclic N,N-dimethylaminophosphoramidite 生成 thymidine nucleoside 3',5'-cyclic methyl phosphite
  参考文献：
  名称：

  O 2 AIBN，用于核苷亚磷酸三烷基酯立体定向氧化的自由基方法：单独制备的非对映体，18 O标记的胸苷3'，5'-环一磷酸酯。

  摘要：

  描述了一种通过实验简便的方法将同位素18 O或17 O）氧立体定向引入生物感兴趣的磷酸二酯和三酯的方法，并将其应用于cTMP的18 O-标记。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(01)82094-3

文献信息

• Twist conformation for the cis N,N-dimethylphosphoramidate of thymidine 3′,5′-cyclic phosphate
  作者：Alan E. Sopchik、Wesley G. Bentrude

  DOI：10.1016/0040-4039(80)88092-0

  日期：1980.1

  PMR analysis assigns twist and chair predominant conformations to the Rp and Sp diastereomers, respectively ( and ), of thymidine 3′,5′-cyclic N,N-dimethylphosphoramidate, . The twist conformer population of is about 64 (acetone) to 75% (toluene).

  PMR分析分别将胸苷3'，5'-环N，N-二甲基氨基磷酸酯的Rp和Sp非对映异构体（和）赋予扭曲和椅子主要构象。的扭曲构象异构体总数为约64（丙酮）至75％（甲苯）。
• 17O NMR of diastereomeric 3′,5′-cyclic thymidine methyl phosphates, methylphosphonates, and N,N-dimethyl phosphoramidates. Phosphorus configuration of P-chiral [17O, 18O]-nucleoside phosphate diesters
  作者：Alan E. Sopchik、S. Matthew Cairns、Wesley G. Bentrude

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)72720-1

  日期：1989.1

  17O NMR spectra of the title compounds show well-separated P=O17 peaks and configurationally diagnostic δ17O values and line widths. Use of these features to assign configurational purity to (17O, 18O) P-chiral nucleoside monophosphate diesters is proposed.

  17标题化合物的O- NMR谱显示良好分离的P = O，17的峰和构型上诊断δ 17个O值和线宽。提出利用这些特征为（17 O，18 O）P-手性核苷单磷酸二酯分配构型纯度。
• Preparation of diastereomeric thymidine 3′,5′-cyclic methylphosphonates. Assignment of RP and SP configurations by 13C NMR
  作者：Gurdip S. Bajwa、Wesley G. Bentrude

  DOI：10.1016/0040-4039(80)88093-2

  日期：1980.1

  The diastereomers of thymidine 3′,5′-cyclic methylphosphonate have been prepared and separated. A use of 13C NMR for the assignment of their phosphorus configurations is demonstrated which should be generally applicable to P-derivatized cyclic nucleotides.

  胸苷3'，5'-环甲基膦酸酯的非对映异构体已制备并分离。已证明使用13 C NMR对其磷构型进行分配，这通常应适用于P衍生的环核苷酸。
• O-Methyl-bis-O-(4-nitrophenyl)phosphite: a novel chemoselective O-phosphitylating reagent
  作者：Wojciech Dabkowski、Łucja Kazimierczak

  DOI：10.1016/j.tetlet.2009.06.102

  日期：2009.9

  A novel chemoselective O-phosphitylating reagent containing two aryloxy leaving groups at a P(III) center is developed for selective formation of P(Ill) esters from amino alcohols without the need to protect the amino group. The reagent proved to be highly convenient for the synthesis of dinucleotides, P(III)-F structures, and cyclic P(III) nucleotides. (C) 2009 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Stereo- and regiochemistries of the oxidations of 2-methoxy-5-tert-butyl-1,3,2-dioxaphosphorinanes and the cyclic methyl 3',5'-phosphite of thymidine by water/iodine and oxygen/AIBN to P-chiral phosphates. Oxygen-17 NMR assignment of phosphorus configuration to the diastereomeric thymidine cyclic methyl 3',5'-monophosphates
  作者：Wesley G. Bentrude、Alan E. Sopchik、Tadeusz Gajda

  DOI：10.1021/ja00193a034

  日期：1989.5