Boc-Gly-Pro-Leu-GABA-NHOH | 124168-69-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Boc-Gly-Pro-Leu-GABA-NHOH
• 英文别名: Boc-Gly-Pro-Leu-Ala-NHOH；tert-butyl N-[2-[(2S)-2-[[(2S)-1-[[(2S)-1-(hydroxyamino)-1-oxopropan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-2-oxoethyl]carbamate
• CAS: 124168-69-0
• 化学式: C₂₁H₃₇N₅O₇
• 分子量: 471.554
• InChiKey: STJAKVSOIZNYKX-KKUMJFAQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.7
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.76
• 拓扑面积：
  166
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  Boc-Leu-Ala-NHOBzl 在 palladium on activated charcoal 盐酸 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 乙酸乙酯 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 25.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 生成 Boc-Gly-Pro-Leu-GABA-NHOH
  参考文献：
  名称：

  Vertebrate Collagenase Inhibitor. II. Tetrapeptidyl Hydroxamic Acids.

  摘要：

  为了开发一种有效且特异性强的胶原酶抑制剂，研究人员合成了一系列四肽羟胺酸，这基于之前关于三肽衍生物的研究结果（Chem. Pharm. Bull., 38, 1007-1011, 1990）。在合成的四肽衍生物系列中，R-Gly-Pro-Leu-Ala-NHOH 和 R-Gly-Pro-D-Leu-D-Ala-NHOH 被发现对脊椎动物胶原酶具有高度特异性和有效抑制作用，IC50 约为10^-6M，其中 R 代表 Boc 或酰基。对其结构-活性关系的分析显示了胶原酶底物结合位点的几个特征：1）S1 亚位点形成一个浅的疏水口袋，虽然甘氨酸残基对应于天然胶原底物的亚位点；2）S2 亚位点形成一个体积较大的口袋，对疏水性的需求较低；3）S3 亚位点优先容纳脯氨酸残基；4）肽类胶原酶抑制剂的 P4-P1 亚位点与 S4-S1 亚位点的结合是形成其羟胺酸基团与酶催化位点的锌离子紧密结合所必需的。将一个对映体二肽单元 D-Leu-D-Ala 引入到 P2-P1 亚位点中，显示出与胶原酶扩展的 S4-S1 亚位点的结合能力增加，从而提供了耐蛋白酶的抑制剂。

  DOI：

  10.1248/cpb.39.1489

文献信息

• NOVEL HYDROXAMIC ACID DERIVATIVE
  申请人：FUJI YAKUHIN KOGYO KABUSHIKI KAISHA

  公开号：EP0345359A1

  公开（公告）日：1989-12-13

  A novel peptide derivative compound which is expected to be useful for treatment of such diseases as rheumatoid arthritis. periodontal disease, corneal ulcer and epidermolysis bul- losa. and which is a hydroxamic acid derivative of a tetrapeptide and has the action of specifically inhibiting collagenase of vertebrate ongin.

  一种新型肽衍生物化合物，有望用于治疗类风湿性关节炎、牙周病、角膜溃疡和大疱性表皮松解症等疾病，该化合物是一种四肽的羟肟酸衍生物，具有特异性抑制脊椎动物本体胶原酶的作用。
• US5100874A
  申请人：——

  公开号：US5100874A

  公开（公告）日：1992-03-31
• Vertebrate Collagenase Inhibitor. II. Tetrapeptidyl Hydroxamic Acids.
  作者：Shinjiro ODAKE、Toru OKAYAMA、Masami OBATA、Tadanori MORIKAWA、Shunji HATTORI、Hisae HORI、Yutaka NAGAI

  DOI：10.1248/cpb.39.1489

  日期：——

  To develop a potent and specific collagenas inhibitor, a series of tetrapheptidyl hydroxamic acids were synthesized, based on the previous findings with tripeptidyl derivatives (Chem. Pharm. Bull., 38, 1007-1011, 1990). Among the series of tetrapeptidyl derivatives synthesized, R-Gly-Pro-Leu-Ala-NHOH and R-Gly-Pro-D-Leu-D-Ala-NHOH were found to be highly specific and potent inhibitors against vertebrate collagenase with an IC50 of 10-6M order, where R stands for Boc or acyl group. Analysis of their structure-activity relationships showed a characteristic feature of the substrate-binding site of collagenase as follows : 1) the S1 subsite forms a shallow hydrophobic pocket, although glycine residue corresponds to the subsite of the natural collagen substrate : 2) the S2 substite constitutes a bulky pocket with less requirement for hydrophobicity : 3) the S3 subsitte preferentially accommodates Pro residue : and 4) the accommodation of the P4-P1 substites of peptidyl collagenase inhibitor to the S4-S1 substites is required to form a tight binding of its hydroxamic acid moiety to the zinc ion at the catalytic site of the enzyme. The introduction of an enantiometric dipeptide unit, D-Leu-D-Ala, to the P2-P1 subsites demonstrated an increased binding capacity to the extended S4-S1 subsites of collagenase, thus providing proteinase-resistant inhibitor.

  为了开发一种有效且特异性强的胶原酶抑制剂，研究人员合成了一系列四肽羟胺酸，这基于之前关于三肽衍生物的研究结果（Chem. Pharm. Bull., 38, 1007-1011, 1990）。在合成的四肽衍生物系列中，R-Gly-Pro-Leu-Ala-NHOH 和 R-Gly-Pro-D-Leu-D-Ala-NHOH 被发现对脊椎动物胶原酶具有高度特异性和有效抑制作用，IC50 约为10^-6M，其中 R 代表 Boc 或酰基。对其结构-活性关系的分析显示了胶原酶底物结合位点的几个特征：1）S1 亚位点形成一个浅的疏水口袋，虽然甘氨酸残基对应于天然胶原底物的亚位点；2）S2 亚位点形成一个体积较大的口袋，对疏水性的需求较低；3）S3 亚位点优先容纳脯氨酸残基；4）肽类胶原酶抑制剂的 P4-P1 亚位点与 S4-S1 亚位点的结合是形成其羟胺酸基团与酶催化位点的锌离子紧密结合所必需的。将一个对映体二肽单元 D-Leu-D-Ala 引入到 P2-P1 亚位点中，显示出与胶原酶扩展的 S4-S1 亚位点的结合能力增加，从而提供了耐蛋白酶的抑制剂。