2,2'-anhydro-1-[5-O-(4-methoxytrityl)-β-D-arabinofuranosyl]uracil | 38642-30-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2,2'-anhydro-1-[5-O-(4-methoxytrityl)-β-D-arabinofuranosyl]uracil
• 英文别名: (3aS)-3c-hydroxy-2t-(4-methoxy-trityloxymethyl)-(3ar,9ac)-2,3,3a,9a-tetrahydro-furo[2',3':4,5]oxazolo[3,2-a]pyrimidin-6-one；O^5'-(4-methoxy-trityl)-arabino-2,2'-anhydro-uridine；(2R,4R,5R,6S)-5-hydroxy-4-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]-3,7-dioxa-1,9-diazatricyclo[6.4.0.02,6]dodeca-8,11-dien-10-one
• CAS: 38642-30-7
• 化学式: C₂₉H₂₆N₂O₆
• 分子量: 498.535
• InChiKey: BUOFSGFUZZBAPG-ZRIRBKMQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  89.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,2'-anhydro-1-[5-O-(4-methoxytrityl)-β-D-arabinofuranosyl]uracil 在 吡啶 、 lithium aluminium tetrahydride 、 potassium tert-butylate 、 溶剂黄146 、 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 1-<2',3'-dideoxy-2'-phenylselenonyl-β-D-glycero-pent-2'-enofuranosyl>uracil
  参考文献：
  名称：

  通过Michael加成反应由2'，3'-ene-2'-苯基硒代壬基尿苷合成新的2'，3'-修饰的尿苷衍生物

  摘要：

  已经证明了2'，3'-烯-2'-苯基硒烯酮12和13的合成效用为[CH 2 + -CH 2 + ] 5的合成等价物。它们充当迈克尔受体，并在C-3'与各种硫，氮，氧和碳亲核试剂进行共轭加成反应，得到各种C-3'取代的-2,2'-O-脱水-或2'，3' -ene-3'-取代的或2'，3'-融合的核苷衍生物。易于从2'，3'-ene-2'-苯基硒烯酮12和13接近这些3'-取代的核苷，使其成为从2'，3'-ene-3'-可获得的相应2'-取代衍生物的有力补充。苯硒醚基核苷4（参考72–74）。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)86406-1
• 作为产物：
  描述：

  2,2'-脱水尿苷 、 4-甲氧基三苯基氯甲烷 在 吡啶 作用下， 反应 94.0h， 以82%的产率得到2,2'-anhydro-1-[5-O-(4-methoxytrityl)-β-D-arabinofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  嘧啶2'-脱氧核糖核苷的合成通过自由基原子转移环化反应在2'-位分支，该反应以乙烯基甲硅烷基作为自由基-受体系链。

  摘要：

  最近，我们开发了一种区域选择性和立体选择性的方法，可通过自由基原子转移环化反应将卤代醇或α-苯基硒代链烷醇中的羟基引入β位置的乙烯基，该反应以乙烯基甲硅烷基为临时连接的自由基受体链。2'-脱氧-2'-C-乙烯基-和2'-脱氧-2'-C-羟甲基尿苷（分别为7和8）和相应的2'-脱氧胞苷同类物（分别为10和11）的合成，使用这种自由基原子转移环化作为关键步骤，可以实现被设计为潜在抗肿瘤和/或抗病毒药物的药物。将在3'-羟基带有乙烯基甲硅烷基的2'-脱氧-2'-碘-5'-O-单甲氧基三苯甲基（MMTr）尿苷衍生物19a与（Me（3）Sn）（2）一起加热和AIBN在苯中，产生相应的自由基原子转移产物，依次将其依次用氟化四丁基铵和TBCS1 /咪唑处理，得到所需的2'-脱氧-5'-O-MMTr-3'-O-TBS-2'-C -乙烯基尿苷（25）。化合物25成功转化为目标2'-脱氧-2'-支链嘧啶核糖核苷7、8、10和11。

  DOI：

  10.1021/jo000967l

文献信息

• Nucleosides. Part LIX. The 2-(4-nitrophenyl)ethylsulfonyl (Npes) Group: A New Type of Protection in Nucleoside Chemistry
  作者：Magdalena Pfister、Helga Schirmeister、Marion Mohr、Silke Farkas、Klaus-Peter Stengele、Tilman Reiner、Martin Dunkel、Surendra Gokhale、Ramamurthy Charubala、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.19950780706

  日期：1995.11.1

  The 2-(4-nitrophenyl)ethylsulfonyl (npes) group is developed as a new sugar OH-blocking group in the ribonucleoside series. Its cleavage can be performed in a β-eliminating process under aprotic conditions using 1,8-diazabicyclo[5.4.0]undec-7-ene (DBU) as the most effective base. Since sulfonates do not show acyl migration, partial protection of 1,2-cis-diol moieties is possible leading to new types

  2-（4-硝基苯基）乙基磺酰基（npes）基团被开发为核糖核苷系列中新的糖OH封闭基团。可以在非质子条件下以β-消除过程进行裂解，使用1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯（DBU）作为最有效的碱基。由于磺酸盐不显示酰基迁移，因此可能会部分保护1,2-顺式-二醇部分，从而导致新型的寡核苷酸构建基团。一系列由Markiewicz保护的核糖核苷1-10转化为它们的2'- O- [2-（4-硝基苯基）乙基磺酰基]衍生物29-38，其中5'-OSi键可通过酸水解裂解形成39- 45。随后的单甲氧基三苯甲基化导致46-50，和脱甲硅基，得到5'- ø - （单甲氧）-2'- ö - [2-（4-硝基苯基）乙基磺酰基]核糖核苷51-55。酸处理去除三苯甲基也不会伤害npes组（56-58）。完全封闭的2'- O- [2-（4-硝基苯基）乙基磺酰基]核糖核苷96-102的明确合成是通过相应的3'-
• Synthesis of Nucleotides from <i>O</i>²,2′-Cyclouridine
  作者：Kelvin K. Ogilvie、Donald J. Iwacha

  DOI：10.1139/v74-257

  日期：1974.5.1

  Procedures for the synthesis of protected O²,2′-cyclouridines and their incorporation into dinucleoside monophosphates have been developed. The properties of these molecules with snake venom and spleen phosphodiesterases have been investigated. The cyclonucleotides are easily converted into arabinouridine nucleotides and thus provide a convenient route to these compounds.

  已开发出一种合成受保护的O2,2'-环尿苷并将其纳入二核苷酸单磷酸酯的程序。已研究了这些分子与蛇毒和脾磷酸二酯酶的性质。这些环核苷酸易于转化为阿拉伯核糖核苷酸，从而为这些化合物提供了便捷的途径。
• Nucleotides. Part LVII.. Synthesis of phosphoramidite building blocks of 2?-amino-2?-deoxyribonucleosides: New compounds for oligonucleotide synthesis
  作者：Beate Greiner、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.19980810556

  日期：——

  The chemical synthesis of 2′-amino-2′-deoxyribonucleosides of uracil, cytosine, adenine, and guanine, and their conversion into suitably protected 3′-phosphoramidite building blocks 35–40 for oligonucleotide synthesis are described. The aglycone and the 2′-amino functions were protected using the 2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl (npeoc) group. The synthesis of the 3′-O-succinyl (3′-O-(3-carboxypropanoyl))-substituted

  化学合成的尿嘧啶，胞嘧啶，腺嘌呤，鸟嘌呤和2'-氨基-2'-脱氧核糖核苷，和其转化为适当保护的3'-亚磷酰胺构建模块35 - 40用于寡核苷酸合成进行说明。使用2-（4-硝基苯基）乙氧羰基（npeoc）基团保护糖苷配基和2'-氨基官能团。3'- O-琥珀酰基（3' - O-（3-羧基丙酰基））取代的起始核苷41的合成描述了1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯（DBU）脱保护过程中预期迁移的溶液和固相行为，并对其进行了研究。使用新的结构单元制备了寡核苷酸，并通过紫外熔融技术研究了它们的杂交特性。
• Intramolecular cyclization-trapping of carbon radicals by olefins as means to functionalize 2′- and 3′-carbons in β-D-nucleosides
  作者：J.-C. Wu、Z. Xi、C. Gioeli、J. Chattopadhyaya

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)96134-4

  日期：——

  Intramolecular free-radical addition-cyclization reactions of 1-(5′-O-(MMTr)-3′-deoxy-3′-phenylseleno-2′-O-allyl- or 2′-O-alkynyl-β-D-arabinofuranosyl)uracils 6a – 6d, 1-(5′O-(MMTr)-2′-deoxy-2′-phenylseleno-3′-O-allyl- or 3′-O-alkynyl-β-D-xylofuranosyl)uracils 10 – 10d, 1-(5′-O-(MMTr)-2′-O-allyl-3′-O-phenoxythio carbonyl-β-D-arabinofuranosyl)uracil 25 and 1-(5′-O-(MMTr)-3′-O-allyl-2′-O-phenoxythio carbonyl-β-

  1-（5'-O-（MMTr）-3'-脱氧-3'-苯基硒基-2'-O-烯丙基或2'-O-炔基-β-D-的分子内自由基加成环化反应阿拉伯呋喃呋喃糖基）尿嘧啶6a – 6d，1-（5'O-（MMTr）-2'-脱氧-2'-苯基硒基-3'-O-烯丙基或3'-O-炔基-β-D-二呋喃呋喃糖基）尿嘧啶10 – 10d，1-（5'-O-（MMTr）-2'-O-烯丙基-3'-O-苯氧硫羰基-β-D-阿拉伯呋喃糖基）尿嘧啶25和1-（5'-O-（MMTr ）-3'-O-烯丙基-2'-O-苯氧基硫羰基-β-D-二呋喃呋喃糖基）尿嘧啶28是非对映体特异性的，并得到纯的[33.0]-β-稠合双呋喃产物，例如1- （3'-脱氧-3'-C，2'-O-（（1-烷基）乙烯）-β-D-呋喃呋喃糖基）尿嘧啶7a – 7d，1-（2'-脱氧-2'-C，3 '-O-（（1-烷基）乙烯）-β-D-呋喃呋喃糖基）尿嘧啶11a – 11
• Nucleotide syntheses using <i>O</i>²,2′-anhydrouridine
  作者：K. K. Ogilvie、D. Iwacha

  DOI：10.1139/v70-139

  日期：1970.3.1

  The synthesis of a nucleotide derivative (3) which can lead directly to O2,2′-anhydro- and arabino- analogues of 1-β-D-ribofuranosyluracil nucleotides is described.

  描述了可直接导致 1-β-D-呋喃核糖尿嘧啶核苷酸的 O2,2'-脱水-和阿拉伯-类似物的核苷酸衍生物 (3) 的合成。