从天然新科科动物的深
水海绵标本中分离出海洋
天然产物新科植物内酯。新pelolide已被证明是线粒体呼吸链中细胞色素bc 1复合物的新型
抑制剂。然而,其详细的抑制机制仍是未知的。另外,由于新
鸟苷内酯的
化学结构非常复杂,因此很难合成。在当前的工作中,通过结合分子对接,分子动力学模拟和分子力学泊松-玻尔兹曼表面积计算,首次确定了新去内酯的结合模式,这表明新去内酯是bc 1的Q o
抑制剂。复杂的。然后,根据
抑制剂-蛋白质相互作用分析的指导,进行了结构修饰,目的在于简化新pelolide的
化学结构,从而合成了一系列具有更简单
化学结构的新neopeltolide衍
生物。计算出的新合成类似物的结合能(ΔG cal)与它们的实验结合自由能(ΔG exp)具有很好的相关性(R 2 = 0.90 ),这证实了该计算方案是可靠的。具有
二苯醚片段的化合物45已成功设计并合成为最有效的候选物(IC 50(= 12n