3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene | 1227171-06-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芘
• 英文名称: 3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene
• 英文别名: tert-butyl-[[3-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-5-pyren-1-ylphenyl]methoxy]-dimethylsilane
• CAS: 1227171-06-3
• 化学式: C₃₆H₄₆O₂Si₂
• 分子量: 566.931
• InChiKey: NJQVSPSHBBVJGA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.29
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  18.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.0h， 以0.416 g的产率得到1-[3,5-bis(hydroxymethyl)phenyl]pyrene
  参考文献：
  名称：

  含有新型荧光联芳基单元的寡核苷酸的合成与性质

  摘要：

  我们描述了含有联芳基单元的寡核苷酸 (ON) 的合成和特性，这些单元由双（羟甲基）苯残基和萘或芘部分组成。我们发现通过将联芳基单元引入 ONs，芳香族发色团在 DNA 中被适当地排列。此外，我们通过使用含有联芳基单元的 ON 作为分子信标，成功地检测了 RNA 中的单碱基错配。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2009)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200900567
• 作为产物：
  描述：

  1-溴芘 、 3,5-bis(tert-butyldimethylsilyloxymethyl)phenylboronic acid 在 sodium hydroxide 、 1,1'-双(二苯膦基)二茂铁二氯化钯(II)二氯甲烷复合物 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene
  参考文献：
  名称：

  含有新型荧光联芳基单元的寡核苷酸的合成与性质

  摘要：

  我们描述了含有联芳基单元的寡核苷酸 (ON) 的合成和特性，这些单元由双（羟甲基）苯残基和萘或芘部分组成。我们发现通过将联芳基单元引入 ONs，芳香族发色团在 DNA 中被适当地排列。此外，我们通过使用含有联芳基单元的 ON 作为分子信标，成功地检测了 RNA 中的单碱基错配。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2009)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200900567
• 作为试剂：
  描述：

  3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 氯仿 、 水 、 碳酸氢钠 、 氯化钠 、 NaSO4 、 3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene 、 silica gel 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 1-[3-(4,4'-dimethoxytrityloxymethyl)-5-(hydroxymethyl)phenyl]pyrene
  参考文献：
  名称：

  Oligonucleotide derivative, labeling agent and use for labeling agent

  摘要：

  一种标记剂，包括由下式（1）表示的多个核苷酸衍生物单元：（其中，Z表示氮原子或CH，Y表示未缩合的芳香烃基团或缩合的多环烃基团，X1表示O、S或Se，X2表示SH（或S−）、Se−、C1-4烷基或morpholino基团）。

  公开号：

  US08354515B2

文献信息

• OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, LABELING AGENT AND USE FOR LABELING AGENT
  申请人：Ueno Yoshihito

  公开号：US20120126175A1

  公开（公告）日：2012-05-24

  The disclosures of the Specification provide an oligonucleotide derivative suited to practical use, as well as a fluorescent dye cluster and use therefor. The disclosures of the Specification use a labeling agent comprising a plurality of nucleotide derivative units represented by Formula (1) below: (where, Z represents a nitrogen atom or CH, Y represents an uncondensed aromatic hydrocarbon group or condensed polycyclic hydrocarbon group, X 1 represents O, S or Se, and X 2 represents SH (or S − ), S or Se − , a C I-4 alkyl or a morpholino group.)

  本规范的披露提供了适用于实际使用的寡核苷酸衍生物，以及荧光染料簇及其使用。本规范的披露使用包含由下式（1）表示的多个核苷酸衍生物单元的标记剂：（其中，Z表示氮原子或CH，Y表示未缩合的芳香族碳氢基团或缩合的多环碳氢基团，X1表示O，S或Se，X2表示SH（或S−），S或Se−，CI-4烷基或morpholino基团。）
• Synthesis and Properties of Oligonucleotides Containing Novel Fluorescent Biaryl Units
  作者：Yoshihito Ueno、Shinji Komatsuzaki、Keiji Takasu、Satoru Kawai、Yoshiaki Kitamura、Yukio Kitade

  DOI：10.1002/ejoc.200900567

  日期：2009.10

  describe the synthesis and properties of oligonucleotides (ONs) containing biaryl units, which are composed of a bis(hydroxymethyl)benzene residue and a naphthalene or pyrene moiety. We found that by introducing the biaryl units into the ONs, the aromatic chromophores were suitably arrayed in the DNAs. Further, we succeeded in the detection of a single-base mismatch in RNA by using the ON containing the biaryl

  我们描述了含有联芳基单元的寡核苷酸 (ON) 的合成和特性，这些单元由双（羟甲基）苯残基和萘或芘部分组成。我们发现通过将联芳基单元引入 ONs，芳香族发色团在 DNA 中被适当地排列。此外，我们通过使用含有联芳基单元的 ON 作为分子信标，成功地检测了 RNA 中的单碱基错配。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2009)
• Oligonucleotide derivative, labeling agent and use for labeling agent
  申请人：Ueno Yoshihito

  公开号：US08354515B2

  公开（公告）日：2013-01-15

  A labeling agent comprising a plurality of nucleotide derivative units represented by Formula (1) below: (where, Z represents a nitrogen atom or CH, Y represents an uncondensed aromatic hydrocarbon group or condensed polycyclic hydrocarbon group, X1 represents O, S or Se, and X2 represents SH (or S−), Se−, a C1-4 alkyl or a morpholino group).

  一种标记剂，包括由下式（1）表示的多个核苷酸衍生物单元：（其中，Z表示氮原子或CH，Y表示未缩合的芳香烃基团或缩合的多环烃基团，X1表示O、S或Se，X2表示SH（或S−）、Se−、C1-4烷基或morpholino基团）。