3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene | 1227171-06-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芘
• 英文名称: 3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene
• 英文别名: tert-butyl-[[3-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-5-pyren-1-ylphenyl]methoxy]-dimethylsilane
• CAS: 1227171-06-3
• 化学式: C₃₆H₄₆O₂Si₂
• 分子量: 566.931
• InChiKey: NJQVSPSHBBVJGA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.29
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  18.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.0h， 以0.416 g的产率得到1-[3,5-bis(hydroxymethyl)phenyl]pyrene
  参考文献：
  名称：

  含有新型荧光联芳基单元的寡核苷酸的合成与性质

  摘要：

  我们描述了含有联芳基单元的寡核苷酸 (ON) 的合成和特性，这些单元由双（羟甲基）苯残基和萘或芘部分组成。我们发现通过将联芳基单元引入 ONs，芳香族发色团在 DNA 中被适当地排列。此外，我们通过使用含有联芳基单元的 ON 作为分子信标，成功地检测了 RNA 中的单碱基错配。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2009)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200900567
• 作为产物：
  描述：

  1-溴芘 、 3,5-bis(tert-butyldimethylsilyloxymethyl)phenylboronic acid 在 sodium hydroxide 、 1,1'-双(二苯膦基)二茂铁二氯化钯(II)二氯甲烷复合物 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene
  参考文献：
  名称：

  含有新型荧光联芳基单元的寡核苷酸的合成与性质

  摘要：

  我们描述了含有联芳基单元的寡核苷酸 (ON) 的合成和特性，这些单元由双（羟甲基）苯残基和萘或芘部分组成。我们发现通过将联芳基单元引入 ONs，芳香族发色团在 DNA 中被适当地排列。此外，我们通过使用含有联芳基单元的 ON 作为分子信标，成功地检测了 RNA 中的单碱基错配。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2009)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200900567
• 作为试剂：
  描述：

  3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 氯仿 、 水 、 碳酸氢钠 、 氯化钠 、 NaSO4 、 3-(3,5-Bis-tert-butyldimethylsilyloxymethylphenyl)-pyrene 、 silica gel 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 1-[3-(4,4'-dimethoxytrityloxymethyl)-5-(hydroxymethyl)phenyl]pyrene
  参考文献：
  名称：

  Oligonucleotide derivative, labeling agent and use for labeling agent

  摘要：

  一种标记剂，包括由下式（1）表示的多个核苷酸衍生物单元：（其中，Z表示氮原子或CH，Y表示未缩合的芳香烃基团或缩合的多环烃基团，X1表示O、S或Se，X2表示SH（或S−）、Se−、C1-4烷基或morpholino基团）。

  公开号：

  US08354515B2

文献信息

• OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVE, LABELING AGENT AND USE FOR LABELING AGENT
  申请人：Ueno Yoshihito

  公开号：US20120126175A1

  公开（公告）日：2012-05-24

  The disclosures of the Specification provide an oligonucleotide derivative suited to practical use, as well as a fluorescent dye cluster and use therefor. The disclosures of the Specification use a labeling agent comprising a plurality of nucleotide derivative units represented by Formula (1) below: (where, Z represents a nitrogen atom or CH, Y represents an uncondensed aromatic hydrocarbon group or condensed polycyclic hydrocarbon group, X 1 represents O, S or Se, and X 2 represents SH (or S − ), S or Se − , a C I-4 alkyl or a morpholino group.)

  本规范的披露提供了适用于实际使用的寡核苷酸衍生物，以及荧光染料簇及其使用。本规范的披露使用包含由下式（1）表示的多个核苷酸衍生物单元的标记剂：（其中，Z表示氮原子或CH，Y表示未缩合的芳香族碳氢基团或缩合的多环碳氢基团，X1表示O，S或Se，X2表示SH（或S−），S或Se−，CI-4烷基或morpholino基团。）