3-oxodecanoyl-N-acetylcysteamine | 1341177-73-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 3-oxodecanoyl-N-acetylcysteamine
• 英文别名: β-ketodecanoyl-N-acetylcysteamine thioester；3-oxo-decanoyl-S-N-acetylcysteamine；3-Keto-decanoyl-S-N-acetyl cysteamine；S-(2-acetamidoethyl) 3-oxodecanethioate
• CAS: 1341177-73-8
• 化学式: C₁₄H₂₅NO₃S
• 分子量: 287.423
• InChiKey: ZDOKPZUSUKRVJM-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  456.4±30.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.049±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  88.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-oxodecanoyl-N-acetylcysteamine 在 水 作用下， 生成 3-氧代癸酸
  参考文献：
  名称：

  铜绿假单胞菌中2-烷基-4（1H）-喹诺酮类的生物合成：潜在致病性治疗干扰的潜力。

  摘要：

  定位群体感应：该假单胞菌喹诺酮信号（PQS）及其直接前体是HHQ在重要群体感应信号分子绿脓杆菌有助于这种细菌的致病性。使用重组PqsD蛋白进行的HHQ生物合成的体外重建，已经阐明了该酶及其底物，并导致了用于鉴定抑制剂的测试系统。

  DOI：

  10.1002/cbic.201100014
• 作为产物：
  描述：

  3-羟基癸酸 在 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 pyridinium chlorochromate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 3-oxodecanoyl-N-acetylcysteamine
  参考文献：
  名称：

  链霉菌天蓝色解离的脂肪酸合酶的FabG和FabI的表征。

  摘要：

  功能性串扰：鉴定并鉴定了来自天蓝色链霉菌的β-酮酰基-酰基载体蛋白（ACP; FabG）和烯酰-ACP还原酶（FabI）。动力学分析表明，这些酶可处理直链和支链底物，以及来自脂肪酸和十一烷基脯氨酸的生物合成途径中的ACP。这种松弛的底物特异性使这些酶参与了两个过程。

  DOI：

  10.1002/cbic.201402670

文献信息

• Dess–Martin periodinane oxidative rearrangement for preparation of α-keto thioesters
  作者：Randy Sanichar、Ciaran Carroll、Ryan Kimmis、Bela Reiz、John C. Vederas

  DOI：10.1039/c7ob02959d

  日期：——

  Dess–Martin Periodinane (DMP) mediated oxidative rearrangement reaction was uncovered. The reaction proceeds via oxidation of a β-hydroxy thioester to a β-keto thioester, followed by an α-hydroxylation and then further oxidation to form a vicinal thioester tricarbonyl. This product then rearranges, extruding CO2, to form an α-keto product. The mechanism of the rearrangement was elucidated using 13C labelling

  发现了由Dess-Martin高碘烷（DMP）介导的氧化重排反应。该反应通过将β-羟基硫代酯氧化为β-酮硫代酯，然后进行α-羟基化，然后进一步氧化以形成邻位硫代酯三羰基来进行。然后该产物重排，挤出CO 2，形成α-酮产物。使用13 C标记和中间体以及反应产物的分析阐明了重排的机理。这种有效的方法使得易于制备α-酮硫酯，α-酮硫酯是药学上重要的杂环支架例如喹喔啉酮的合成中的潜在中间体。
• A FabG inhibitor targeting an allosteric binding site inhibits several orthologs from Gram-negative ESKAPE pathogens
  作者：Peter Vella、Reshma Srilakshmi Rudraraju、Thomas Lundbäck、Hanna Axelsson、Helena Almqvist、Michaela Vallin、Gunter Schneider、Robert Schnell

  DOI：10.1016/j.bmc.2020.115898

  日期：2021.1

  identify a set of µM inhibitors, with the most potent representative (1) demonstrating activity against six FabG-orthologues. A co-crystal structure with FabG from A. baumannii (PDB:6T65) confirms inhibitor binding at an allosteric site located in the subunit interface, as previously demonstrated for other sub-µM inhibitors of FabG from P. aeruginosa. We show that inhibitor binding distorts the oligomerization

  ESKAPE 人类致病菌群内抗生素耐药性的传播对感染治疗和安全医院环境的维护提出了严峻挑战。这促使人们努力验证这些物种中的新靶蛋白，这些靶蛋白可以作为抗生素开发的潜在目标。遗传数据表明，FabG 酶是细菌脂肪酸生物合成系统 FAS-II 的一部分，在几种 ESKAPE 病原体中是必不可少的。FabG 在脂肪酸延长过程中催化 3-酮酰基-ACP 的 NADPH 依赖性还原，从而为细胞膜的产生和维持提供脂质供应。在这里，我们报告了对来自鲍曼不动杆菌和S的 FabG 酶的小分子筛选。鼠伤寒确定一组 µM 抑制剂，其中最有效的代表 ( 1 ) 展示了针对六种 FabG 直向同源物的活性。与来自鲍曼不动杆菌(PDB:6T65) 的FabG 的共晶结构证实了抑制剂在位于亚基界面的变构位点处的结合，正如之前对来自铜绿假单胞菌的 FabG 的其他亚 µM 抑制剂所证明的那样。我们表明抑制剂结合扭曲了 FabG
• Insights into the programmed ketoreduction of partially reducing polyketide synthases: stereo- and substrate-specificity of the ketoreductase domain
  作者：Ishin Soehano、Lifeng Yang、Feiqing Ding、Huihua Sun、Zhen Jie Low、Xuewei Liu、Zhao-Xun Liang

  DOI：10.1039/c4ob01777c

  日期：——

  hallmarks of iterative polyketide synthases (PKSs) is the programming mechanism which is essential for the generation of structurally diverse polyketide products. In partially reducing iterative PKSs (PR-PKSs), the programming mechanism is mainly dictated by the ketoreductase (KR) domain. The KR domain contributes to the programming of PR-PKSs through selective reduction of polyketide intermediates. How

  迭代聚酮化合物合酶（PKSs）的标志之一是编程机制，该机制对于生成结构多样的聚酮化合物产品至关重要。在部分减少迭代PKS（PR-PKS）时，编程机制主要由酮还原酶（KR）域决定。KR结构域通过选择性还原聚酮化合物中间体而有助于PR-PKS的编程。KR域如何实现选择性酮还原仍有待充分理解。在这项研究中，我们发现，（的KR结构域- [R）-mellein-合成PR-PKS SACE5532用作B型KR结构域，以产生（ř）-羟基官能团。对SACE5532和NcsB的KR域的比较研究表明，两个KR域对简单的N-乙酰半胱胺硫酯（SNAC）底物具有不同的底物偏好。我们进一步发现，可以通过用KR NcsB交换几个基序来切换KR SACE5532的底物偏好，并且在全长SACE5532中交换相同基序会导致PKS的重新编程。总之，这些结果通过为聚酮化合物中间体的差异识别来实现编程的酮还原反应这一假设提供了新的
• Structural Basis for the Formation of Acylalkylpyrones from Two β-Ketoacyl Units by the Fungal Type III Polyketide Synthase CsyB
  作者：Takahiro Mori、Dengfeng Yang、Takashi Matsui、Makoto Hashimoto、Hiroyuki Morita、Isao Fujii、Ikuro Abe

  DOI：10.1074/jbc.m114.626416

  日期：2015.2

  The acylalkylpyrone synthase CsyB from Aspergillus oryzae catalyzes the one-pot formation of the 3-acyl-4-hydroxy-6-alkyl-alpha-pyrone scaffold from acetoacetyl-CoA, fatty acyl-CoA, and malonyl-CoA. This is the first type III polyketide synthase that performs not only the polyketide chain elongation but also the condensation of two beta-ketoacyl units. The crystal structures of wild-type CsyB and its

  米曲霉的酰基烷基吡喃酮合酶CsyB催化由乙酰乙酰辅酶A，脂肪酰基辅酶A和丙二酰辅酶A一锅形成3-酰基-4-羟基-6-烷基-α-吡喃酮支架。这是第一种III型聚酮化合物合酶，不仅可以进行聚酮化合物链的延伸，还可以使两个β-酮酰基单元缩合。野生型CsyB及其I375F和I375W突变体的晶体结构分别以1.7-，2.3-和2.0-A的分辨率解析。晶体结构揭示了一个独特的活性位点结构，该结构具有迄今无法识别的新颖口袋，可容纳乙酰乙酰辅酶A起始物，此外还具有带有Cys-His-Asn催化三联体的常规延伸/环化口袋和用于结合脂肪的长疏水通道酰基链。该结构还表明存在一个假定的亲核水分子，该分子被氢键网络激活，其活性位点中心处有His-377和Cys-155。此外，体外酶反应证实，H2（18）O分子的（18）O原子通过酶法结合到最终产物中。这些观察结果表明，酶反应是通过将乙酰乙酰辅酶A负载到Cys-155
• Elucidation of Piericidin A1 Biosynthetic Locus Revealed a Thioesterase-Dependent Mechanism of α-Pyridone Ring Formation
  作者：Qian Liu、Fen Yao、Yit Heng Chooi、Qianjin Kang、Wei Xu、Yanran Li、Yucheng Shao、Yuefeng Shi、Zixin Deng、Yi Tang、Delin You

  DOI：10.1016/j.chembiol.2011.12.018

  日期：2012.2

  results provide overview of the biosynthesis pathway. Furthermore, in vitro characterization of the terminal polyketide synthase module with the thioesterase domain using β-ketoacyl substrates was performed. That revealed a pathway where the α-pyridone ring formation is dependent on hydrolysis of the product β, δ-diketo carboxylic acid by the C-terminal thioesterase followed by amidation and cyclization

  匹氏菌素是一类抑制线粒体呼吸链并表现出抗菌，抗真菌和抗肿瘤活性的α-吡啶酮类抗生素。piomogeuesvar链霉菌的顺序分析。杭州湾的基因组揭示了六个模块化聚酮化合物合酶，一个酰胺基转移酶，两个甲基基转移酶和一个单加氧酶，用于生产匹利西丁A1。基因功能分析和缺失结果提供了生物合成途径的概述。此外，使用β-酮酰基底物对带有硫酯酶结构域的末端聚酮化合物合酶模块进行了体外表征。这揭示了α-吡啶酮环形成取决于C末端硫酯酶对产物β，δ-二酮羧酸的水解，然后进行酰胺化和环化的途径。