(R)-1-{[2-O-t-butyldiphenylsilyl-1-(hydroxymethyl)ethoxy]methyl}thymine | 201732-40-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: (R)-1-{[2-O-t-butyldiphenylsilyl-1-(hydroxymethyl)ethoxy]methyl}thymine
• 英文别名: 1-[[(2R)-1-[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxy-3-hydroxypropan-2-yl]oxymethyl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 201732-40-3
• 化学式: C₂₅H₃₂N₂O₅Si
• 分子量: 468.625
• InChiKey: MSUKXJQEPKHKMC-HXUWFJFHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.76
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-1-{[2-O-t-butyldiphenylsilyl-1-(hydroxymethyl)ethoxy]methyl}thymine 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 (S)-1-{[2-O-4,4'-dimethoxytrityl-1-(hydroxymethyl)ethoxy]methyl}thymine
  参考文献：
  名称：

  胞嘧啶类似物，包含构象上灵活的无环接头，可在具有连续GC碱基对的位点形成三链体

  摘要：

  嘧啶碱基T和m 5ox C的两个核苷衍生物已用柔性无环碳水化合物连接基制备。从（R）-（-）-2,2-二甲基-1,3-二氧戊环-4-甲醇开始的新方法可以制备两种受保护的核苷类似物的立体化学纯无环衍生物，而不会受到有问题的重排产物的污染。通过简单地增加am 5ox C核苷衍生物的碳水化合物部分的柔韧性，包含5个连续GC碱基对的15-mer三联体的T m值提高了7-8°C 。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(97)10289-7
• 作为产物：
  描述：

  O,O-二(三甲基甲硅烷基)胸苷 在 palladium dihydroxide 四氯化锡 、 环己烯 作用下， 以 乙醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 25.17h， 生成 (R)-1-{[2-O-t-butyldiphenylsilyl-1-(hydroxymethyl)ethoxy]methyl}thymine
  参考文献：
  名称：

  胞嘧啶类似物，包含构象上灵活的无环接头，可在具有连续GC碱基对的位点形成三链体

  摘要：

  嘧啶碱基T和m 5ox C的两个核苷衍生物已用柔性无环碳水化合物连接基制备。从（R）-（-）-2,2-二甲基-1,3-二氧戊环-4-甲醇开始的新方法可以制备两种受保护的核苷类似物的立体化学纯无环衍生物，而不会受到有问题的重排产物的污染。通过简单地增加am 5ox C核苷衍生物的碳水化合物部分的柔韧性，包含5个连续GC碱基对的15-mer三联体的T m值提高了7-8°C 。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(97)10289-7

文献信息

• A cytosine analogue containing a conformationally flexible acyclic linker for triplex formation at sites with contiguous G-C base pairs
  作者：Guobing Xiang、Larry W McLaughlin

  DOI：10.1016/s0040-4020(97)10289-7

  日期：1998.1

  the pyrimidine bases T and m5oxC have been prepared with flexible acyclic carbohydrate linkers. A new procedure, beginning with (R)-(−)-2,2-dimethyl-1,3-dioxolane-4-methanol permits the preparation of the stereochemically pure acyclic derivatives of both protected nucleoside analogues without contamination by a problematic rearrangement product. By simply increasing the flexibility of the carbohydrate

  嘧啶碱基T和m 5ox C的两个核苷衍生物已用柔性无环碳水化合物连接基制备。从（R）-（-）-2,2-二甲基-1,3-二氧戊环-4-甲醇开始的新方法可以制备两种受保护的核苷类似物的立体化学纯无环衍生物，而不会受到有问题的重排产物的污染。通过简单地增加am 5ox C核苷衍生物的碳水化合物部分的柔韧性，包含5个连续GC碱基对的15-mer三联体的T m值提高了7-8°C 。