cis-thymidine 3',5'-cyclic methyl phosphate | 1092-50-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: cis-thymidine 3',5'-cyclic methyl phosphate
• 英文别名: thymidine cyclic methyl 3',5'-monophosphate；thymidine 3',5'-cyclic phosphate methyl ester；methyl thymidin-3',5'-diyl cyclic phosphate；Methyl-thymidin-3',5'-phosphat；O^3'_,O5'-methoxyphosphoryl-thymidine；1-[(4aR,6R,7aS)-2-methoxy-2-oxido-4a,6,7,7a-tetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinin-2-ium-6-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1092-50-8
• 化学式: C₁₁H₁₅N₂O₇P
• 分子量: 318.223
• InChiKey: PVZWVLPHVGPUIV-ONFYOXCNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  109
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cis-thymidine 3',5'-cyclic methyl phosphate 在 DEAE Sephadex 、 碳酸氢铵 作用下， 反应 4.0h， 生成 1-((4aR,6R,7aS)-2-Aminooxy-2-oxo-tetrahydro-2λ⁵-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinin-6-yl)-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  Stereo- and regiochemistries of the oxidations of 2-methoxy-5-tert-butyl-1,3,2-dioxaphosphorinanes and the cyclic methyl 3',5'-phosphite of thymidine by water/iodine and oxygen/AIBN to P-chiral phosphates. Oxygen-17 NMR assignment of phosphorus configuration to the diastereomeric thymidine cyclic methyl 3',5'-monophosphates

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja00193a034
• 作为产物：
  描述：

  thymidin-3'-yl H-phosphonate 在 吡啶 、 碘 、 三甲基乙酰氯 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.08h， 生成 cis-thymidine 3',5'-cyclic methyl phosphate
  参考文献：
  名称：

  核苷3'，5'-环状H-膦酸酯，用于合成核苷3'，5'-环状磷酸酯的新有用的前体及其类似物

  摘要：

  用缩合剂活化的核苷H-膦酸酯自发形成核苷3'，5'-环H-膦酸酯。环化是立体选择性和产于占优势的P-非对映体中的一个（DE约80％）。核苷3'，5'-环H-膦酸酯是立体化学不稳定的，差向异构化后行的，得到热力学更稳定的非对映体为主要产物（DE约80％）。它们易于水解，酯交换和氧化，并且通过改变氧化方案，获得了核苷3'，5'-环磷酸酯类似物，例如磷酸二酯，硫代磷酸二酯和磷酸三酯。

  DOI：

  10.1021/ol4016404

文献信息

• A 400- and 600-MHz proton NMR conformational study on nucleoside cyclic 3',5' Pv-TBP systems. Conformational transmission induces diequatorial orientation of the 3',5'-dioxaphosphorinane ring in a nonchair conformation
  作者：Niek L. H. L. Broeders、Leo H. Koole、Henk M. Buck

  DOI：10.1021/ja00177a004

  日期：1990.10

  nucleoside cyclic 3’3’ PV-TBP compounds 4 and 5 were studied as models for the proposed activated state of cyclic adenosine 3’,5’-monophosphate (CAMP). Compound 4 features equatorial-axial (e,a) orientation of the 3’,5’-dioxaphosphorinane ring. The design of compound 5, which incorporates OCH2CH20Me as a conformational probe, was essentially based on our previous work on conformational transmission in

  新型核苷环状 3'3' PV-TBP 化合物 4 和 5 被研究作为建议的环状腺苷 3',5'-单磷酸 (CAMP) 活化状态的模型。化合物 4 具有 3',5'-二氧杂膦烷环的赤道轴 (e,a) 取向。化合物 5 的设计包含 OCH2CH20Me 作为构象探针，主要基于我们之前在 Pv-TBP 化合物中构象传输方面的工作。化合物 5 的 'H NMR 分析显示探针片段中的构象传输，这表明具有双赤道 (e,e) 方向的 3',5'-环的分子结构和 OCH2CH20Me 的轴向位置对假旋转平衡有显着贡献. 通过与 PV-TBP 化合物 13 的比较，清楚地确定了 5 中的构象传输，其中 0 n B u 取代了 OCH2CH20Me 基团，14，其中反式稠合环戊烷环取代了胸苷的呋喃糖环，15，其中 OCH2CH20Me 基团锁定在 PV-TBP 的赤道位置。结果表明，构象传递有助于稳定 3',
• Novel approach to the synthesis of isotopomeric monoalkyl [¹⁶O,¹⁷O,¹⁸O]phosphates. The stereospecific one-pot conversion of (R_P)-thymidine 3′-(4-nitrophenyl)phosphorothioate into (R_P)-thymidine 3′-[¹⁶O,¹⁷O,¹⁸O]phosphate
  作者：Andrzej Okruszek、Piotr Guga、Wojciech J. Stec

  DOI：10.1039/c39870000594

  日期：——

  Reaction of the (Rp)-diastereoisomer of thymidine 3′-(4-nitrophenyl)phosphorothioate with styrene [18O]oxide in a medium containing [17O]water gives (Rp)-thymidine [16O,17O,18O]phosphate in 70% yield with diastereoisotopomeric purity not lower than 92%.

  (Rp)胸苷3'-（4-硝基苯基）磷酸硫酯与苯乙烯[18O]氧化物在含[17O]水的介质中反应，以70%的产率生成(Rp)胸苷[16O,17O,18O]磷酸，其非对映异构同位素纯度不低于92%。
• Unraveling the origin of the major mutation induced by ultraviolet light, the C→T transition at dTpdC sites. A DNA synthesis building block for the cis-syn cyclobutane dimer of dTpdU.
  作者：John-Stephen Taylor、Sourena Nadji

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)81791-9

  日期：1991.1

  One possible origin of the major mutation induced by ultraviolet light, the C --> T transition at dTpdC sites, involves the replicative bypass of the cyclobutane dimer of dTpdC or its deamination product, the cis-syn dimer of dTpdU. In order to investigate the latter proposal, we have designed and synthesized a building block for the incorporation of the cis-syn dTpdU dimer into oligonucleotides by automated solid phase DNA synthesis technology.
• Stereo- and regiochemistries of the oxidations of 2-methoxy-5-tert-butyl-1,3,2-dioxaphosphorinanes and the cyclic methyl 3',5'-phosphite of thymidine by water/iodine and oxygen/AIBN to P-chiral phosphates. Oxygen-17 NMR assignment of phosphorus configuration to the diastereomeric thymidine cyclic methyl 3',5'-monophosphates
  作者：Wesley G. Bentrude、Alan E. Sopchik、Tadeusz Gajda

  DOI：10.1021/ja00193a034

  日期：1989.5
• Nucleoside 3′,5′-Cyclic <i>H</i>-Phosphonates, New Useful Precursors for the Synthesis of Nucleoside 3′,5′-Cyclic Phosphates and Their Analogues
  作者：Malgorzata Rozniewska、Jacek Stawinski、Adam Kraszewski

  DOI：10.1021/ol4016404

  日期：2013.8.16

  stable diastereomer as a major product (de ca. 80%). They were susceptible to hydrolysis, transesterification, and oxidation and by changing oxidation protocols nucleoside 3′,5′-cyclic phosphate analogues, e.g. phosphodiesters, phosphorothioate diesters, and phosphotriesters, were obtained.

  用缩合剂活化的核苷H-膦酸酯自发形成核苷3'，5'-环H-膦酸酯。环化是立体选择性和产于占优势的P-非对映体中的一个（DE约80％）。核苷3'，5'-环H-膦酸酯是立体化学不稳定的，差向异构化后行的，得到热力学更稳定的非对映体为主要产物（DE约80％）。它们易于水解，酯交换和氧化，并且通过改变氧化方案，获得了核苷3'，5'-环磷酸酯类似物，例如磷酸二酯，硫代磷酸二酯和磷酸三酯。