2'-O-phthalimidoethyl-5-methyluridine | 242147-77-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-O-phthalimidoethyl-5-methyluridine
• 英文别名: 2-[2-[(2R,3R,4R,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyethyl]isoindole-1,3-dione
• CAS: 242147-77-9
• 化学式: C₂₀H₂₁N₃O₈
• 分子量: 431.402
• InChiKey: SZYZSXFWVCHGGL-DEXNDLTESA-N

物化性质

• 密度：
  1.58±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.7
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  146
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-phthalimidoethyl-5-methyluridine 在 肼 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 2'-O-[2-(amino)ethyl]-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  N-(2-Cyanoethoxycarbonyloxy)succinimide:  A New Reagent for Protection of Amino Groups in Oligonucleotides

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo982299y
• 作为产物：
  描述：

  N-羟乙基酞酰亚胺 在 硼烷 、 碳酸氢钠 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 2'-O-phthalimidoethyl-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  N-(2-Cyanoethoxycarbonyloxy)succinimide:  A New Reagent for Protection of Amino Groups in Oligonucleotides

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo982299y
• 作为试剂：
  描述：

  N-羟乙基酞酰亚胺 、 硼烷 、 氢气 、 、 2,2'-O-脱水-5-甲基尿嘧啶核苷 、 碳酸氢钠 在 crude solution 、 silica gel 、 乙酸乙酯 、 邻苯二甲酸亚胺 、 2'-O-phthalimidoethyl-5-methyluridine 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇乙酸乙酯 为溶剂， 反应 24.5h， 生成 2'-O-phthalimidoethyl-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  Guanidinium functionalized oligonucleotides and method/synthesis

  摘要：

  本发明提供了寡聚物，它们与RNA或DNA的选择序列特异性杂交，其中寡聚物的核苷酸中至少有一个被修饰以包括鸟氨酸基团。这些寡聚物可用于诊断、治疗和研究目的。

  公开号：

  US06534639B1

文献信息

• Compounds and oligomeric compounds comprising novel nucleobases
  申请人：——

  公开号：US20040033973A1

  公开（公告）日：2004-02-19

  The present invention relates to nucleoside compositions comprising novel nucleobases and oligomeric compounds comprising at least one such nucleoside. These oligomeric compounds typically have enhanced binding affinity properties compared to oligomeric compounds without the modification. The oligomeric compounds are useful, for example, for investigative and therapeutic purposes.

  本发明涉及包含新型核碱基的核苷酸组合物以及包含至少一种此类核苷酸的寡聚合物化合物。这些寡聚合物化合物通常具有比没有这种修饰的寡聚合物化合物更强的结合亲和性能。这些寡聚合物化合物可用于调查和治疗等用途。
• Methods for the preparation of conjugated oligomers
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US06335437B1

  公开（公告）日：2002-01-01

  The present invention provides novel methods for preparing oligonucleotide conjugates using a novel electrophilic haloacetyl linker. Novel compounds and intermediates are also disclosed.

  本发明提供了使用一种新型亲电性卤乙酰基连接剂制备寡核苷酸共轭物的新方法。同时还披露了新型化合物和中间体。
• Guanidinium functionalized oligomers and methods
  申请人：——

  公开号：US20030092046A1

  公开（公告）日：2003-05-15

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡核苷酸，它们与RNA或DNA的选定序列具有特异性杂交性，其中至少一个核苷酸基团被修饰以包括一种鸟氨酸基团。这些寡核苷酸对于诊断、治疗和调查目的非常有用。
• Guanidinium functionalized nucleotides and precursors thereof
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US06593466B1

  公开（公告）日：2003-07-15

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡聚物，其特异性与所选的RNA或DNA序列杂交，其中至少一个寡聚物的核苷酸基团被修饰以包括一种鸟氨酸基团。这些寡聚物可用于诊断、治疗和研究目的。
• Guanidinium functionalized intermediates
  申请人：Manoharan Muthiah

  公开号：US06914148B2

  公开（公告）日：2005-07-05

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡核苷酸，其具有与所选的RNA或DNA序列特异性杂交的能力，其中至少一个寡核苷酸的核苷酸基团被修饰为包含鸟氨酸基团。这些寡核苷酸可用于诊断、治疗和研究目的。