2'-O-[2-(amino)ethyl]-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine | 242147-79-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2'-O-[2-(amino)ethyl]-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine
• 英文别名: 2'-O-(2-aminoethyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine；2'-O-aminoethyl-5'-O-dimethoxytrityl-5-methyluridine；1-[(2R,3R,4R,5R)-3-(2-aminoethoxy)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 242147-79-1
• 化学式: C₃₃H₃₇N₃O₈
• 分子量: 603.672
• InChiKey: SKXNPNVIHARHGZ-BUVRPPHQSA-N

物化性质

• 密度：
  1.34±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  142
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-[2-(amino)ethyl]-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  N,N′-Bis-(2-(cyano)ethoxycarbonyl)-2-methyl-2-thiopseudourea: A Guanylating Reagent for Synthesis of 2′-O-[2-(Guanidinium)ethyl]-Modified Oligonucleotides

  摘要：

  A guanylating reagent, N,N'-bis-(2-(cyano)ethoxycarbonyl)-2-thiopseudourea, was synthesized and used for synthesis of 2'-O-(2-(guanidinium)ethyl) (2'-O-GE) modified oligonucleotides. A convenient deprotection method for the 2'-O-GE oligonucleotides was developed.

  DOI：

  10.1080/15257770601112705
• 作为产物：
  描述：

  5-甲基尿甙 在 吡啶 、 碳酸二苯酯 、 titanium(IV) isopropylate 、 sodium azide 、 18-冠醚-6 、 水 、 碳酸氢钠 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 2'-O-[2-(amino)ethyl]-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  OLIGONUCLEOTIDE LIGATION

  摘要：

  一种连接寡核苷酸的方法。该方法包括通过将连接到寡核苷酸的炔基与连接到寡核苷酸的叠氮基反应以形成三唑键来连接一个或多个寡核苷酸。炔基是一种受应力的炔基。该方法可以包括连接一个或多个寡核苷酸的末端或交联寡核苷酸双链的链。所描述的方法允许寡核苷酸链在无需连接酶的情况下连接在一起。

  公开号：

  US20130231473A1

文献信息

• Methods for the preparation of conjugated oligomers
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US06335437B1

  公开（公告）日：2002-01-01

  The present invention provides novel methods for preparing oligonucleotide conjugates using a novel electrophilic haloacetyl linker. Novel compounds and intermediates are also disclosed.

  本发明提供了使用一种新型亲电性卤乙酰基连接剂制备寡核苷酸共轭物的新方法。同时还披露了新型化合物和中间体。
• Guanidinium functionalized oligomers and methods
  申请人：——

  公开号：US20030092046A1

  公开（公告）日：2003-05-15

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡核苷酸，它们与RNA或DNA的选定序列具有特异性杂交性，其中至少一个核苷酸基团被修饰以包括一种鸟氨酸基团。这些寡核苷酸对于诊断、治疗和调查目的非常有用。
• Guanidinium functionalized nucleotides and precursors thereof
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US06593466B1

  公开（公告）日：2003-07-15

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡聚物，其特异性与所选的RNA或DNA序列杂交，其中至少一个寡聚物的核苷酸基团被修饰以包括一种鸟氨酸基团。这些寡聚物可用于诊断、治疗和研究目的。
• Guanidinium functionalized intermediates
  申请人：Manoharan Muthiah

  公开号：US06914148B2

  公开（公告）日：2005-07-05

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡核苷酸，其具有与所选的RNA或DNA序列特异性杂交的能力，其中至少一个寡核苷酸的核苷酸基团被修饰为包含鸟氨酸基团。这些寡核苷酸可用于诊断、治疗和研究目的。
• Guanidinium functionalized oligonucleotides and method/synthesis
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US06534639B1

  公开（公告）日：2003-03-18

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡聚物，它们与RNA或DNA的选择序列特异性杂交，其中寡聚物的核苷酸中至少有一个被修饰以包括鸟氨酸基团。这些寡聚物可用于诊断、治疗和研究目的。