2'-O-(2-phthalimidoethyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine | 242147-78-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2'-O-(2-phthalimidoethyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine
• 英文别名: 2'-O-(2-phthalimidoethyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyl uridine；2'-O-phthalimidoethyl-5'-O-dimethoxytrityl-5-methyluridine；2'-O-(2-phthalimidoethyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxy-trityl)-5-methyl uridine；2-[2-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxy-2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyethyl]isoindole-1,3-dione
• CAS: 242147-78-0
• 化学式: C₄₁H₃₉N₃O₁₀
• 分子量: 733.775
• InChiKey: LYDFMUNWRCJDRI-QZHHCZDESA-N

物化性质

• 密度：
  1.42±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  54
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  153
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-(2-phthalimidoethyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine 在 二异丙基铵盐四氮唑 、 肼 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 2'-O-[N-(2-cyanoethoxycarbonyl)-2-aminoethyl]-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine 3'-O-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl]phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  N-(2-Cyanoethoxycarbonyloxy)succinimide:  A New Reagent for Protection of Amino Groups in Oligonucleotides

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo982299y
• 作为产物：
  描述：

  2,2'-O-脱水-5-甲基尿嘧啶核苷 在 碳酸氢钠 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 2'-O-(2-phthalimidoethyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  N-(2-Cyanoethoxycarbonyloxy)succinimide:  A New Reagent for Protection of Amino Groups in Oligonucleotides

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo982299y

文献信息

• Methods for the preparation of conjugated oligomers
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US06335437B1

  公开（公告）日：2002-01-01

  The present invention provides novel methods for preparing oligonucleotide conjugates using a novel electrophilic haloacetyl linker. Novel compounds and intermediates are also disclosed.

  本发明提供了使用一种新型亲电性卤乙酰基连接剂制备寡核苷酸共轭物的新方法。同时还披露了新型化合物和中间体。
• Guanidinium functionalized oligomers and methods
  申请人：——

  公开号：US20030092046A1

  公开（公告）日：2003-05-15

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡核苷酸，它们与RNA或DNA的选定序列具有特异性杂交性，其中至少一个核苷酸基团被修饰以包括一种鸟氨酸基团。这些寡核苷酸对于诊断、治疗和调查目的非常有用。
• Guanidinium functionalized nucleotides and precursors thereof
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US06593466B1

  公开（公告）日：2003-07-15

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡聚物，其特异性与所选的RNA或DNA序列杂交，其中至少一个寡聚物的核苷酸基团被修饰以包括一种鸟氨酸基团。这些寡聚物可用于诊断、治疗和研究目的。
• Guanidinium functionalized intermediates
  申请人：Manoharan Muthiah

  公开号：US06914148B2

  公开（公告）日：2005-07-05

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡核苷酸，其具有与所选的RNA或DNA序列特异性杂交的能力，其中至少一个寡核苷酸的核苷酸基团被修饰为包含鸟氨酸基团。这些寡核苷酸可用于诊断、治疗和研究目的。
• Guanidinium functionalized oligonucleotides and method/synthesis
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US06534639B1

  公开（公告）日：2003-03-18

  The present invention provides oligomers which are specifically hybridizable with a selected sequence of RNA or DNA wherein at least one of the nucleoside moieties of the oligomer is modified to include a guanidinium group. These oligomers are useful for diagnostic, therapeutic and investigative purposes.

  本发明提供了寡聚物，它们与RNA或DNA的选择序列特异性杂交，其中寡聚物的核苷酸中至少有一个被修饰以包括鸟氨酸基团。这些寡聚物可用于诊断、治疗和研究目的。